230 likes | 400 Views
Utvikling av (industrielle) enzymer Vincent Eijsink UMB, snart NMBU – Institutt for Kjemi, Bioteknologi og Matvitenskap. Enzymers fortreffelighet. Katalyserer kjemiske reaksjoner under naturlige betingelser. Er meget presise; ingen bi-produkter.
E N D
Utvikling av (industrielle) enzymer Vincent Eijsink UMB, snart NMBU – Institutt for Kjemi, Bioteknologi og Matvitenskap
Enzymers fortreffelighet • Katalyserer kjemiske reaksjoner under naturlige betingelser. • Er meget presise; ingen bi-produkter. • Ingen behov for bruk av forurensende kjemikalier, lave energibehov. • Kan katalysere prosesser som vi ikke har kjemisk teknologi til. • Det finnes mange.
Begrensning 1 - Industrielle krav til et enzym • Lett å produsere i store nok mengder * • Tilstrekkelig stabil og aktiv under prosessbetingelser * • Bred anvendbarhet • Billig • * Essensiell og overhode ikke noe selvfølge
Begrensning 2 - Komplekse substrater krever komplekse enzymblandinger
Potensialet er allikevel stor S-Y Ding et al., Science, 2012, 338:1055-1060
Å utvikle industrielle enzymer • WP1 – Finne kandidater (”bioprospektering”) • WP2 – Uttrykke/produsere kandidater • WP3 – Karakterisere kandidater • WP4 – Forbedre (”engineere”) kandidater • For enzymeprodusenten: Industrialisere produksjonsprosessen og formulere produktet • For brukere: Prosessutvikling (WP5-7)
Bioprospektering • Finn gode «kilder» som så kan tappes på flere måter, direkte, eller etter forskjellige grader av anrikning • Metagenomer • Metaproteomer • Genomer • Ekpresjonsbiblioteker fulgt av funksjonell screening
Metaproteomikk Metacellulosomics-driven discovery of synergism in a soil-derived cellulose-degrading microbial community Yizhuang Zhou, BGI, Phillip B. Pope, UMB, et al., 2013
Begrensning av datasettet Upregulation of gene expression whenSerpula lacrymans grows on wood (Eastwood et al., 2011, Science 333:762-765)
Oppdagelsen av LPMOs, «Lytic Polysaccharide Monooxygenases» (Vaaje-Kolstad et al., 2010; Horn et al., 2012) Med behandling Uten behandling
Enzym produksjon (WP2) • Ekspresjonssystemet (vertsorganisme) må velges med omhu og flere systemer må testes • Labskala – Funker ofte; kan raskt ekskludere enzymer fra videre utvikling • Større skala – Krever spesialkompetanse • «Downstreamprocessing» kan være en utfordring Sintef
Enzym produksjon (WP2) Uformell uttalelse fra Novozymes, verdens ledende produsent av industrielle enzymer: Den viktigste enkeltfaktor som har gjort våre cellulase produkter billigere i perioden 2000 – 2010 ligger i vår fermenteringsteknologi
Karakterisering (WP3) UiT En stor kostnadspost og en potensiell «competitive advantage»
«Engineering» (WP4): Å forbedre enzymers operasjonelle egenskaper gjennom sete- rettet mutagenese eller in vitro evolusjon
Screening of lyase mutant library: increased G-G specificity Robotic colony picker and work stations A230 Time 1. MGMGMGMGMGM 2. GGGGGGGGGGG lyasegene (alyA) (brakes G-G and M-G) random mutagenesis, error prone pcr mutatedlyasegenes ISOLATION OF A NOVEL LYASE WITH SPECIFIC ACTIVTY AGAINST G-G Expression in E. coli, 108 000 clones Cultivation in 96-well plates, 6700 random strains Activity measurements on two defined substrates Tøndervik A, et.al.(2010) JBC, 2010. 285(46): p. 35284-92.
Simultan utvikling av enzym og prosess Borregaard trenger spesialtilpassede enzym-cocktails; NorZymeD kan bidra
Fabrikk for annen generasjons bioetanol, Crescentino, Italia
Fungi infected strawberry flowers Our product + Synthetic fungicide (10% of recommended dose) www.biochos.com
Kommerialiseringsveier for NorZymeD • Nye eller forbedrede enzymer • Nye eller forbedrede prosesser • Prosesser spesialtilpasset til norske forhold • Produksjon av (spesial)enzymer