Infekcie GIT

1. Infekcie GIT • Infekcie prenosné orálnou cestou postihujúce GIT prejavujúce sa ako • enteritída – salmonelóza – TS opakovane, krv na protilátky • intoxikácia – botulizmus – pokus na zvierati • celkové ochorenie – týfus – TS, krv na hemokultiváciu, krv na protilátky • nezápalové ochorenie – Helicobacter pylorí - bioptický materiál – mikroskopia, rýchlotest biochemických vlastností – ureáza, krv na protilátky, dychová skúška na ureázovú aktivitu • Infekcie prenosné orálnou cestou postihujúce iné systémy - hepatitída A,E, poliomyelitída, enterovírusové infekcie – meningitída, myokarditída – stolica na izoláciu vírusov, krv na protilátky

2. Ochranné faktory Predisponujúce faktoryu ochorení GIT • Osobná hygiena Antacidá • Žalúdočná kyselina Potenie • Normálna flóra GIT Veľká inf.dávka • Peristaltika Spomalená peristaltika • Lokálne protilátky Imunodeficit • Proteolytické enzýmy • Fagocytujúce bunky • Žlč

3. Etiologické agens najčastejších hnačkovitých ochorení Salmonella – potraviny, vajíčka,hydina, zvieratá Schigella – rodiny,azylové inštitúcie,denné sanatóriá E.coli – potraviny, voda Vibrio cholerae – voda v trópoch Vibrio parahaemolyticus – plody mora Rotavírus – rodiny, inštiúcie – hlavne deti, Norwalk vírus, Adenovírusy – rodiny, inštitúcie Yersinia enterocolitica – zvieracie výkaly Campylobacter – potraviny, zvieratá,mlieko Bacillus cereus – potraviny (ryža,cestoviny) Clostridium perfringens – zle tepelne upravené mäso Giardia lamblia – voda Entamoeba histolytica – inštitúcie, ľudia Clostridium difficile – nozokomiálne, po použití atb

4. Typy enterálnych ochorení • Intraluminálne – nezápalové sekretorické hnačky - tenké črevo - enterotoxín, porucha rezorbcie • Mukózne – zápalová dyzentéria - hrubé črevo - prestup cez mukózu • Systémové – intracelulárne parazity, - ileum - enterálne horúčky (týfus – Salmonella typhi)

5. Bakteriálne toxíny pri ochoreniach GIT Neurotoxíny – Clostridium botulinum, Bacillus cereus, Staphylococcusaureus Enterotoxíny – Vibrio cholerae, Escherichia coli - termostabilný aj termolabilný, Salmonella enteritidis, Citrobacter, Aeromonas, Klebsiella, Clostridium perfringens, Shigela dysenteriae, Bacillus cereus Cytotoxíny - Schigelly, Clostridiium perfringens, Staphylococcus aureus, Vibrio parahaemolyticus, Clostridium difficile

6. Enterobacteriaceae • Najrozsiahlejšia, najheterogénnejši skupina medicínsky dôležitých baktérií • 27 rodov,102 druhov (95% medicínsky významných patrí do 25 druhov) - na základe DNA homológie, biochemických vlastností, sérologických reakcií, ATB citlivostí • Bežne prítomné v prírode (pôda, voda, rastliny) súčasť normálnej flóry čreva. Obligátne patogénne(Yersinia pestis), podmienečne patogénne (Klebsiella, E. coli) • Prenos zo zvieraťa (Salmonelly), od človeka - nosiča (S. typhi), endogénna infekcia (E.coli)

7. Štruktúra • 3 skupiny antigénov: • - somatický O antigén - najdôležitejší antigén bb. steny, termostabilný, LPS, zložený z 3 súčastí - O polysachrid, kórový polysacharid a lipid A - s endotoxínovou aktivitou • - púzdrový K antigén - termolabilný, skrížene reagujúci s protilátkami proti iným baktériám. U Salmonella typhi sa nazýva Vi antigén. • - bičíkový H antigén - termolabilný, podlieha antigénnym zmenám

8. Gastroenteritídy E.coli • enterotoxigénne ETEC - produkcia termostabilného a termolabilného toxínu, plazmidom mediovaná, kmene s adhezívnymi pillmi, mierne vodnaté hnačky, cestovateľské hnačky, • enteroinvázne EIEC - prenikajú do epitelu HČ a deštruujú ho, teploty, kŕče, krv a leu v stolici, špecifické O sérotypy, potvrdenie inváznosti - Serenyho test - inokulácia kmeňna do spojovkového vaku zvieraťa • enteropatogénne EPEC - ťažké detské hnačky v rozv. krajinách, produkujú shiga-like toxin, schopné adherovať na ery • enterohemorhagické EHEC - produkujú shiga-like verotoxin - cytopatický efekt. Nekomplikovaná hnačka až hemorhagická kolitída. HUS - hemolyticko uremický syndróm - 0157:H7, - akútne renálne zlyhanie, trombocytopénia, mikroangiopatická emolytická anémia. U detí do 5 rokov. • enteroagregujúce - detské hnačky v rozvojových krajinách

9. Salmonella • 1500 sérotypov, rôzne názvy podľa miesta izolácie • DNA analýza: 1 druh (S. enterica) a jej 7 podskupín • Prítomná u všetkých zvierat, kontaminovaná potrava - primárne od kontaminovaných zvierat, vajíčka - salmonelové ochorenie sliepok, sekundárne - od infikovaného človeka - nosiča. Potrebné veľké inokulum 106-8 - šírenie potravinami, v ktorých sa môže pomnožiť. Osoby so zvýšeným rizikom - imunokompromitovaný, deti, redukovaná acidita žalúdočnej tekutiny • Enteritída - postihnutie HČ, teplota, nauzea, zvracanie, kŕče, bolesť hlavy a svalov. Dg.: tampón stolice, 3 x za sebou. Lactóza negatívne kolónie, biochemická identifikácia. Stanovenie séroskupiny sklíčkovou aglutináciou podľa Kauffmann Whitovej schémy - epidemiologický význam ( S. enteritidis, S. infantis, S. agona, S. kentucky…………………….)

10. Shigella • 4 druhy - Sh. dysenteriae, Sh. flexneri, Sh. boydii, Sh. sonnei a 38 sérotypov • Dyzentéria - vodnaté hnačka s prímesou krvi, ochorenie často epidemické, kontaminovanými rukami. Prežíva vo vode až 6 mesiacov. Malá infekčná dávka - asi 200 baktérií. Ochorenie tenkého čreva, najskôr bez invázie epitelu. Produkcia enterotoxínu - invázia mukózy, deštrukcia sliznice a tvorba vredov - hnis a krv v stolici • Dg. Na základe biochemických vlastností ( charakteristický zápach, netvorí plyn, laktózu neskvasuje)., odlíšenie druhov - sklíčkovou aglutináciou

11. Yersinia enterocolitica • Enterokolitída v chladnejších oblastiach, najväčšia metabolická aktivita baktérie prib 22*C, infekcia z potravín, hnačka, bolesti brucha, kŕče, teplota. Chronické postihnutie - terminálne ileum, zdurené mesenterické uzliny, imituje appendicitídu. Extraintestinálne prejavy - artritída, hepatitída, osteomyelitída - dôkaz sérologicky aglutináciou • krvou prenosná bakterémia a endotoxický šok (krvné konzervy - chladené 3 týždne)

12. Vibrionaceae • G- zahnuté paličky, netvoria spóry, schopné aeróbneho aj anaeróbneho rastu. Prítomné vo vode • Oxidázový test – pozit – odlíšenie od Enterobakteriaceaei • V.cholerae - gastsroenteritis • V. parahaemolyticus - gastroenteritis • V. vulnificans – bakterémia, inf. rán, celulitída – expozícia kontaminovanej vode, GIT – zjedenie surových ustríc • V. alginolyticus – inf. rán, mäkkých tkanív, otitis externa • Ostatné vibriá – infekcie rán, miernejšie infekcie GIT • Plesiomonas – GIT inf. zo surových morských živočíchov • Aeromonas – opportunistické infekcie a infekcie rán aj pri použití pijavic ( rozkladajú tromby a udržujú mikrocirkuláciu při mikrochirurgických a plastických operáciách

13. Campylobacter Čiarkovité , G-, pohyblivé, 11 druhov ,7 poddruhov Vyžaduje mikroerofilné prostredie, teplotu 42*C, prechádza filtrami - selektívne vychytávanie při izolácii Campylobacter jejuni – gastroenteritída, u pacientov so zníženou imunitou –hypogamaglobulinémia, zníženou aciditou žalúdočnej tekutiny. Infikuje sliznicu jejuna, ilea a colon, ktorá je edematózna, krvavá, tvorba krýpt, abscesov.Infiltrácia do lamina propria. Enterotoxín, cytoptický toxín, endotoxín. Hydina, potraviny neutralizujúce pH redukujú inf. dávku. C.coli - gastroenteritis, C. fetus – septikémia, artritída, tromboflebitída, meningitída Lab dg kultivácia na selektívnych pôdach, mikroskopia, biochemická identifikácia., Th.: ERY

14. Helicobacter • Špirálovité paličky, G-, v súvislosti s B gastritídou, žalúdočným a duodenálnym vredom., príp. Ca – Gastrospirillum hominis • Patogenéza – produkcia ureázy – vytvára oblak amoniaku, ktorý chráni baktériu před účinkom žal. kyseliny, - pohyblivosť, - tvorba mucinázy – prienik baktérie do mukóznych vrstiev – adherencia – prichytenie baktérie na intracelulárne spoje – zápal s infiltráciou mononukleárov v lamina propria. Uniká prítomným protilátkam igA – svojou lokalizáciou v mukóze. • Neexistuje zvierací rezervoir – prenos interhumánny • Th. ATB . Bizmutové soli, nitroimidazol a amoxicilin alebo TTC

15. Diagnostické postupy na dôkaz mikrobiálnych ochorení GIT Tampón stolice – opakovaný - enterobaktérie - transportná pôda - Campylobacter - kultivácia, latex aglutinácia - rotavírusy SVP– stolica na vajíčka parazitov – mikroskopicky Stolica na izoláciu vírusov – u celkových enterovírusových o. Zvratky – vírusové ochorenie, dôkaz toxínov Výplach žalúdka – Mykobaktérie – u detí Biopsia žalúdka – Helicobacter pylorí Aspirát z duodena – Giardia lamblia Aspirát z pečene – améby, anaeróbne mikroorganizmy Biopsia črevnej sliznice – améby, clostrídiová enterotoxikóza Perianálny zlep – Oxyuris vermicularis

16. Tenké črevo • Vírusové – rotavírusy, adenovírusy, calcivírusy, astrovírusy, Norwalk vírus, • Toxické – E. coli, Cl. perfringens, Vibrio sp., Bacillus cereus • Parazitárne – Giardia, Cryptosporidium Hrubé črevo Invázne – E.coli, Shigella, Salmonella, Campylobacter, Yersinia, Aeromonas, Plesiomonas Toxické – Clostridium difficile Parazity - Entamoeba

17. Rizikové potraviny a etiologické agens Mliečne – Campylobacter, Salmonella Vajíčka – Salmonella Mäso – Closstridium perfringens, Bacillus cereus, Aeromonas, Campylobacter, Salmonella Hovädzie mäso – surové – E. coli O157.,H7 Hydina – Campylobacter Bravčové C. perfringens, Yersinia enterocolitica Morské živočíchy – Astrovírusy, Aeromonas, Plesiomonas, Vibrio sp. Ustrice – Calcivírusy, Plesiomonas, Vibrio sp Zelenina – Aeromonas, C. perfringens Majonézy – St. aureus Ryža – Bacillus cereus Konzervované potraviny, med (u detí do 1 roku) – Cl. botulinum

18. Stolica – mikrobiologická vzorka • Pri hnačkovitých ochoreniach a iných ochoreniach GIT. • Očkovanie na selektívne médiá – existencia fyziologickej flóry - dôkaz baktérií • Dôkaz toxínov, vírusov, parazitov • Interpretácia výslekov, Terapia, Anaeróbne baktérie

19. Kultivácia • TS – inokulácia na neselektívnu, selektívnu a diagnostickú pôdu (krvný agar, Dezoxycholát citrát, MacConckey, živný bujón – pomnoženie • Izolácia čistých kolónií, rastové a biochemické valstnosti – fermentácia cukrov – Hajnova pôda, Enterotesty, • Antigénna štruktúra – E.coli, Salmonelly –

20. Stolica na vajíčka parazitov • Odber stolice veľkosti asi ako orech alebo perianálny zlep • Vajíčka, články parazitárnych červov • Spracovanie stolice – sedimentačná metóda • Mikroskopické vyšetrenie

21. Stolica na izoláciu vírusov • U celkových ochorení • Transport v chlade • Bunkové línie – naočkovanie stolice – pomnoženie vírusu – jeho identifikácia: elektrónmikroskopicky, sérologickými metódami, sledovanie cytopatogénneho efektu – zdĺhavé a pracné

22. Dôkaz protilátok v krvi pacienta • Hepatitídy – • Nepriama diagnostika – dôkaz vírusových, bakteriálnych alebo parazitárnych antigénov v sére pacienta a protilátok proti nim • Nutnosť znalosti patogenézy ochorenia

23. Hepatitídy vyvolané vírusmi – vírus sa dostáva do pečene pri virémii alebo prostredníctvom mononukleárnych fagocytov. Pečeň je často zdrojom sekundárnej virémie, alebo je poškodená infekciou. Podobné príznaky. Hepatitída = zápal pečene – (ochorenie) Icterus = žltačka–príznak pri ochorení pečene, hemolýze, pri stáze žlči. Hepatitis A, B, C, D, E, G, Hepatitída pri EBV infekcii (angína s monocytózou a postihnutím RES) Žltá zimnica (flavivirus, vektorom je komár z rodu Aedes,, výskyt v Afrike a J. Amerike, hepatitída a hemorhagická horúčka, pri poštípaní a saní krvi samička vyvráti obsah aj s vírusmi do krvi, Vi napadne endotelové bb, je transportovaný do bb. RES, sekundárna virémia spôsobí symptómy – hepatitída, encefalitída... očkovanie) U imunokompromitovaných pri infekcii CMV, a novorodencov HSV, varicella, kongenitálne rubeola,

25. Vírus hepatitídy A Stabilný pri pH 3 odoláva éteru, chloroformu, detergentom, vyschnutiu, teplote od –20 do –70 *C (roky) /kocky ľadu/, 56*C 30 minút, 61*C 20minút – čiastočná inaktivácia prítomný v slanej aj povrchovej vode – mesiace Inaktivovaný – chlórom, formaldehydom, UV žiarením, Fekálne orálny prenos, socioekonomické podmienky, MX na jeseň Očkovanie, vysoká premorenosť

26. Hepatitída E – endemická oblasť – J Taliansko, fekálnoorálny prenos, kontaminovaná voda akútny mierny priebeh, mortalita 1-2%, u tehotných ťažké ochorenie s 20% mortalitou

28. Šikmá časť – aeróbne prostredie, laktóza negatívne bakktérie – neskvasujú – alkalické, červené Kolmá časť anaeróbne prostredie enterobaktérie skvasujú – kyslé – žlté, alebo H2S - čierne 1 negatívna kontrolka 2 Ps.aeruginosa : nefermentujúca G- palička 3 Shigella sonnei: H2S - negat., plyn – negat., TSI – kyslé/alkal 4 Salmonella typhi: H2S – pozit., plyn –negat., TSI – kyslé/alkal 5 Escherichia coli: H2S – negat., plyn - pozit., TSI – kyslé/kyslé 6 Proteus mirabilis: H2S – pozit, plyn - negat., TSI – kyslé /kyslé

29. Kultivácia G- paličiek - Salmonella, Shigella, E.coli • Kultivácia - Salmonella, Shigella, E.coli • krvnom agare - G - palička, šedavé kolónie neodlíšiteľné, • na Mc agare - E.coli laktózu skvasuje - ružové kolónie, Salmonella laktózu neskvasuje - žlté, priesvitné - s tvorbou sirovodíka, Shigella - laktózu neskvasuje, bez sirovodíka, • na DC - dezoxycholátovom agare - selektívna pôda - rastie Salmonella (laktóza negat. so sírovodíkom) a Shigella (laktóza negat. bez sírovodíka). E. coli nerastie

30. Biochemické vlastnosti E.coli • Biochemické vlastnosti - fermentácia cukrov - Hajnova pôda (skvasovanie cukrov glc+, lac +, tvorba plynu +, tvorba sírovodíka -, skvasovanie urey -, pohyb +, skvasovanie simonscitrátu -,+) - Enterotesty

31. Biochemické vlastnosti Shigella • Biochemické vlastnosti - fermentácia cukrov - Hajnova pôda glc+, lac+, plyn-, sírovodík -, urea-, pohyb+, simonscitrát - a Enterotesty

32. Biochemické vlastnosti Salmonella • Biochemické vlastnosti - fermentácia cukrov - Hajnova pôda glc+, lac-, plyn -, sírovodík -, pohyb+, urea-, simonscitrat - • Enterotesty:

33. Biochemické vlastnosti - fermentácia cukrov Enterotest E16 • H Sírovodík čierna bezfarebná • G Lyzín modrá zelená • F Indol červená žltá • E Ornitín modrá zelená • D Ureáza červená žltá • C Fenylalanín tmavozelená žltá • B Eskulín čierna bezfarebná • A Simonscitrát modrá žltá • H Malonát modrá žltá • G Inositol žltá zelená • F Adenitol “ “ • E Celobioza “ “ • D Sacharóza “ “ • C Sorbitol “ “ • B Trehalozs “ “ • A Mannitol “ “

34. Widalova reakcia - diagnostické možnosti brušného týfusu • Kultivácia (priama diagnstika) krvi (7.-10. deň), stolice (od 2. týždňa), kostnej drene, moču (od 3. týždňa) a zisťovanie aglutinínov v sére - Widalova reakcia (nepriama diagnostika) - protilátky proti O a H antigénom S. typhí - štvornásobný vzostup titra protilátok - akútne ochorenie alebo - vyhľadávanie nosičov - skrížená reaktivita, dostatočne vysoký titer • Znalosti klinického obrazu a patogenézy - Ochorenie začína ingesciou baktérií.Inkubačný čas je 1-2 týždne. Pri väčšom inokule sa môže vyskytnúť akútna gastroenteritída. Baktérie prenikajú cez mukózu tenkého čreva ( invázia) endocystózou do submôukózy. Množia sa v submukózze a sú vychytávané do lymfatických uzlín, kde sa množia v makrofágoch, dostávajú sa do krvi (perzistujúca bakterémia) a orgánov RES a ostatných orgánov (hemorhagie, kožná rozeola, orgánové komplikácie)

35. Widalova reakcia - diagnostické možnosti brušného týfusu (graf) týždeň