1 / 26

Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG

Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG. Tujuan Perkuliahan.

loring
Download Presentation

Pengantar Biokimia MARIA ULFAH, S.Si, M.Pd JURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPA IKIP PGRI SEMARANG

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Pengantar BiokimiaMARIA ULFAH, S.Si, M.PdJURUSAN PEND.BIOLOGI FPMIPAIKIP PGRI SEMARANG

  2. Tujuan Perkuliahan • Memperkenalkan bahasa biokimia: Kosakata (istilah dan struktur), tatabahasa (reaksi-reaksi), struktur kalimat (jalur-jalur metabolisme), dan pengertian (hubungan-hubungan metabolisme) • Mengajarkan cara mengambil intisari proses kehidupan • Menyarikan kesatuan konsep yang mendasari proses kehidupan • Menularkan hasrat mencari tahu atas hal yang akan dipelajari dan hal yang perlu diketahui

  3. Filosofi Pembelajaran • Menjelaskan, bukan mengindoktrinasi • Menunjukkan hal yang perlu diketahui dan yang tidak perlu diketahui • Menghargai pertanyaan tentang hal yang belum diketahui • Mempelajari semua hal adalah tidak mungkin, tetapi yang lebih penting adalah mengorganisir hal yang kita ketahui agar dapat digunakan

  4. Tentang Struktur • Struktur biokimia yang rumit tidak akan pernah dapat ditiru, akan tetapi hal yang perlu dipikirkan tentang struktur tersebut adalah: • Bagaimana konsentrasinya berubah sebagai tanggapan atas kondisi metabolisme tertentu • Bagaimana struktur tersebut berperan terhadap aktifitas biologisnya • Dalam jalur metabolisme mana senyawa dengan struktur tersebut ditemukan (dari apa/mana asal senyawa tersebut dan menjadi apa selanjutnya?)

  5. Ciri-Ciri Kehidupan • Keragaman biologis: mikroba, ganggang, lumut, tanaman, serangga, burung, monyet, kamu • Kesatuan kimiawi: sistem kehidupan (di bumi) mengikuti hukum fisika-kimia organik– tidak ada aturan khusus

  6. 3 Kebutuhan Kehidupan:(1) ENERGI, perlu diketahui bagaimana: • Memperolehnya • Mengubahnya • Menggunakannya Fig. 1-28

  7. (2) MOLEKUL SEDERHANA, perlu diketahui bagaimana: • Mengubahnya • Mempolimerasinya • Menghancurkannya

  8. (3) MEKANISMEKiMIA, untuk: • Memperoleh energi • Mengendalikan reaksi kimia yang berurutan • Mensintesis & mendegradasi makromolekul • Mempertahankan kesetimbangan yang dinamis • Swa-susun struktur yang kompleks • Mengganda secara akurat & efisien • Mempertahankan keteraturan proses biokimia dalam lingkungan yang berubah-ubah

  9. Strategi 1: Mahluk hidup menggunakan pasangan kimia untuk mengendalikan proses kimia yang normalnya tidak dapat terjadi Fig. 1-26b

  10. Strategi 2: Mahluk hidup menggunakan enzim untuk memacu reaksi yang biasanya lambat

  11. Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan termodinamikanya? Fig. 1-11

  12. Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan mekanismenya?? Fig. 1-22

  13. Biomolekul - Komposisi

  14. * Atom Karbon yang Fleksibel adalah Tulang Punggung Kehidupan Fig. 1-14

  15. Isomer Kimia Rumus kimia sama, bentuk berbeda Fig. 1-18a

  16. Molekul Khiralbentuk putaran berbeda dengan bentuk bayangan Fig. 1-19a

  17. StereoisomerRumus dan bentuk kimia sama – fungsi biologis Fig. 1-23a

  18. * Perubahan BiokimiaDapat Dikelompokkan dalam 5 kategori • Reaksi pemindahan gugus • Reaksi oksidasi-reduksi • Penataan kembali (isomerisasi) • Reaksi pemotongan • Reaksi kondensasi

  19. Senyawa penyusun Gula sederhana Asam amino Nukleotida Asam lemak Makromolekul Polisakarida Protein (peptida) RNA atau DNA Lipida Anabolik Katabolik Struktur Biomolekul

  20. Biosintesis Membutuhkan Molekul Sederhana untuk Digabung secara Kovalen melalui Berbagai Cara … 3eFig. 3-25

  21. O 3.5 Cl 3.0 N 3.0 C 2.5 P 2.1 H 2.1 Na 0.9 K 0.8 Kekuatan ikatan kimia tergantung pada1. Kelektronegativan relatif dari dua atom yang berikatanKeelectronegativantinggi = Afinitas elektron tinggi From 3eTable 3-4

  22. * 2. Jumlah elektron pengikat See Fig. 1-13

  23. Kekuatan ikatan yang umum Approx. Avg. Triple: 820 kJ/mole Double: 610 kJ/mole Single: 350 kJ/mole

  24. * Gugus Fungsional yang Umum Fig. 1-15

  25. * Nukleofil Biologis yang Penting: gugus fungsional kaya elektron 3eTable 3-4

  26. Ringkasan… • Atom karbon tetrahedral memiliki sifat ikatan yang fleksibel • Senyawa-senyawa beratom banyak dapat memiliki beberapa bentuk isomerik • Pengubahan bentuk membutuhkan pemutusan ikatan-ikatan kimia • Molekul-molekul besar disusun dari molekul- molekul kecil melalui pembentukan ikatan kimia baru

More Related