1 / 35

Yrd. Doç. Dr. İzzet YELKOVAN

Yrd. Doç. Dr. İzzet YELKOVAN. Protein Yönlendirme C. Ü. Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD. 2006. 1- Organeller Mitokondri Lizozom ER Golgi peroksizom 2- Sitozolik K. Akışkan bölgeler Katı ve sıvı böl. vb. 3- Çekirdek Por sistemi 4- Özelleşmiş bölgeler Mikroviluslar Dendrit Akzon

nevaeh
Download Presentation

Yrd. Doç. Dr. İzzet YELKOVAN

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Yrd. Doç. Dr. İzzet YELKOVAN • Protein Yönlendirme • C. Ü. Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD. • 2006

  2. 1- Organeller Mitokondri Lizozom ER Golgi peroksizom 2- Sitozolik K. Akışkan bölgeler Katı ve sıvı böl. vb 3- Çekirdek Por sistemi 4- Özelleşmiş bölgeler Mikroviluslar Dendrit Akzon Pseudopod Mikrospike Hücre korteksi vb Hücre İçi Kompartmanlar

  3. Hücre İçi Kompartmanlar • 5- Membran modifikasyon bölgeleri • Sıkı bağlantı bölgeleri • Geçit bölgeleri • Kemer desmozom • Düğme desmozom • Hemidesmozom • Sil • Kamçı • Hücre ekstrasellular adezyon bölgeleri

  4. Sitozol Çekirdek Kloroplast Mitokondri Plastidler Hücre içi bilgi ve madde akış yönü Endoplazmik retikulum Golgi Bir başka açıdan değerlendirme Geç endozom Salgı vezikülleri Lizozom Erken endozom Hücre yüzeyi key Geçit ile transport Transmembran transport Vezikuler transport

  5. Veziküler Trafik • Endositoz: hücre zarından hücre içine • Fagositoz • Pinositoz • Ekzositoz: hücre içinden hücre zarına • Golgiden gelen • Lizozomdan gelen • ER’den gelen • Salgı vezikülleri

  6. Veziküler Trafik • ER’den golgiye • Golgiden -ER’ye -lizozoma -hücre zarına -çekirdek zarına • Lizozomdan golgiye • Endozomdan lizozoma -hücre zarına • Golgiden golgiye

  7. Veziküler Trafik • Donor kompartmandan tomurcuklanma üç yöntem ile geçekleştirilir (örücü ve örtücü proteinler). • Klatrin • COP I (coated protein I kaplı) • COP II (coated protein II kaplı)

  8. Veziküler TrafikKlatrin

  9. Protein Konuşlandırma

  10. Protein Konuşlandırma Hücre içinde protein konuşlandırmada üç yöntem kullanılır: 1- Ko-translasyonal - translokasyon • yani protein sentezinin, proteinin görev yerinde yapılması 2- Post-translasyonal – translakasyon • yani sentez sonrası proteinin görev yerine taşınması 3- Vesikular – transport • Proteinin bir vezikül aracılığıyla görev yerine taşınması • Membran üzerine bağlı • Vezikül lümeninde

  11. Protein Konuşlandırma 1- Ko-translasyonel translokasyon 2- Post-translasyonel translokasyon

  12. 1- Ko-translasyonal translokasyon • Type I: Koparılıp atılan bir sinyal dizi taşırlar Çoğunlukla C terminal ucu sitoplazmada, N terminal ucu ER lümenindedir • Type II: C terminali lümende olanlar • Type III: N terminali lümende olanlar • Type IV: Çok geçişli membrane proteinleri • GPI (glycosylphosphatidylinositol):

  13. 1- Ko-translasyonal translokasyon Type I:

  14. 1- Ko-translasyonal translokasyonType IV:

  15. 1- Ko-translasyonal translokasyonGPI (glikozilfosfatidilinositol) • Farnelizasyon • Miristoilasyon

  16. ER membranını hedefleme

  17. Sinyal Tanıma Partikülü (SRP) • Protein ER’a getirilir • Protein üzerindeki sinyal diziye bağlanır • ER’daki SRP reseptörüne bağlanır • RNA-protein kompleksi oluşur

  18. Translokon • TRAM • Sec61 • Sec61 • Sec61 • Sucul kanal

  19. 2- Post-translasyonal translokasyonSitoplazmik Protein Sentezi Hücrede Serbest Protein Sentezi

  20. 2- Post-translasyonal translokasyonSitoplazmik protein sentezi

  21. 2- Post-translasyonal translokasyonSitoplazmik Protein Sentezi Hücrede Serbest Protein Sentezi • ER’a giriş • ER lümeninde alıkonma • Golgi’de alıkonma • Mitokondriye giriş • Çekirdeğe giriş • Peroksizoma giriş • vb

  22. 2- Post-translasyonal translokasyonBir proteinin nereye ait olduğu üzerinde yazılıdır • ER’a girişi içinsinyal dizi • H3N-met-met-ser-phe-val-ser-leu-leu-leu-val-gly-ile-leu-phe-trp-ala-thr-glu-ala-glu-gln-leu-thr-lys-cys-glu-val-phe-gln • ER lümeninde alıkonması için sinyal dizi • Lys-asp-glu-leu-COO- • Golgi’de alıkonma

  23. 2- Post-translasyonal translokasyonBir proteinin nereye ait olduğu üzerinde yazılıdır • Mitokondriye girişi için sinyal dizi • H3N-met-leu-ser-leu-arg-gln-ser-ile-arg-phe-phe-lys-pro-ala-thr-arg-thr-leu-cys-ser-ser-arg-tyr-leu-leu • Çekirdeğe girişi için sinyal dizi • ---pro-pro-lys-lys-lys-arg-lys-val---- • Peroksizoma girişi için sinyal dizi • ---ser-lys-leu---

  24. ÖrnekMitokondrilere Protein Girişi (import) • Hedef Organelde 4 Farklı Yerleşim Şekli Vardır • Mitokondrial matrix • Intermembrane boşluk • Inner membran • Outer membran

  25. Protein yönlendirmemitokondrial import • post-translational transporttur • ATP ve/veya proton gradienti gibi enerji gerektirir • sinyal dizisi uzundur ve zayıf korunan dizilerdendir

  26. Mitokondriyal Import veŞaperoninlerelektrokimyasal gradient

  27. Mitokondriye protein girişi

  28. Sinyal peptidaz sinyal diziyi keser

  29. Mitokondriyal Şaperoninler

  30. 3- Vesikular – transport Proteinler farklı 3 tipörtülü vezikül ile taşınırlar

  31. 3- Vesikular – transport These aren’t the only type of coats, but they account for the great majority.

  32. 3- Vesikular – transport

  33. 3- Vesikular – transport

  34. Vezikular sistem

More Related