Proporcionando los medios para una mejor comprensión de la diversidad biológica

1. Proporcionando los medios para una mejor comprensión de la diversidad biológica mejora de los datos primarios y su uso para la evaluación de amenazas y la planificación de la conservación in situ en Suramérica Hector Tobón, Daniel Amariles, Julián Ramírez, Louis Reymondin, Johannes Signer, Jorge Camacho, Jhon Tello and Andy Jarvis International Center for Tropical Agriculture, CIAT Cali, Colombia Noviembre 3, 2010

2. Entregables • Verificación y mejoramiento de la calidad de los datos • Verificación de coordenadas • Georreferenciación • Modelos de Nicho • Entrenamiento del script de modelos de nicho. • Análisis de Amenazas y conservación en Suramérica • Herramienta de navegación basada en Google maps

3. @Calidad de Datos: ¿Por qué se necesita alta calidad y confiabilidad de los datos? • Analizar patrones de diversidad de las especies a través de todas las regiones • Entrenar y evaluar modelos de nicho • Evaluar los problemas de conservación (in situ, ex situ) • Evaluar los impactos y amenazas sobre la biodiversidad. • Entre otros …

4. @Calidad de Datos: Estado promedio de un gran conjunto de datos • La base de datos de GBIF(versionjul 2009) posee 177,887,193 de occurrencias. • Las occurrencias del reino Plantaeson 44,706,505 (25,13%) • 33,340,000 (74.5%) tienen coordenas • ¿Cuántas de ellas son correctas y confiables? • ¿Cuántas georreferenciaciones nuevas se pueden obtener? Estado de los registros del ReinoPlantae

5. Script de verificación de coordenadas y georreferenciación Registro sin verificar sí Condiciónde Forma: El pais de registro no esnulo y el país del registroconcuerda con el paiscalculado con lascoordenadas. Condiciónde coordenadas: El registrotienecoordenadas sí no no Condiciónde georreferenciación: La ubicación del registro (país, estado, ciudad y localidad) puede ser georreferenciada con precisión Condiciónde máscara: Las coordenadas del registroapuntan a un area terrestredefinidapor la máscara. sí no no sí Condiciónde variables ambientales: El registro se encuenta en el nicho de la taxonomia (al menos en el 80% del espacioambiental) Marcarcomo georeferenciado no sí RegistroConfiable Registro a excluir

6. @Modelo de Nicho: Entrenamiento del script paramodelos de nicho • Aplicando el algoritmo de máxima entropía • MacoubeaguianensisAubl.: Alimentos para las comunidades rurales indígenas en el Amazonas. Data harvesting Building the presence model

7. @Modelo de Nicho: Evaluando amenazas y acciones de conservación en la actualidad • Modelo de distribución de especies con registros de presencia mayores a 10 en la base de datos de IABIN. • Evaluación de la distribución de cada especie en relación con: • Diferentes escenarios de Amenaza. • Áreas protegidas existentes.

8. @Herramienta de Navegación • Basada en Google Maps. • Utiliza entradas listas para ser usadas (PNGs y KMLs). • Trabaja por sí sola y es fácil de acoplar con el portal si se requiere. • Utiliza tecnologías de visualización web como JQuery, y otras tecnologías para administración del proyecto como Maven y Subversion. • Muestra todos los resultados de los modelos, así como los datos primarios. • Es Portable.

9. @Herramienta de Navegación

12. Preguntas • ¿Los datos principales de SSTN se encuentran en la tabla “occurrence_record”? • ¿Los datos presentes en dicha tabla son exactamente los mismos de GBIF? ¿Los han filtrado? ¿Los han enriquecido? • ¿Podemos obtener el dump de toda la base de datos?