500 likes | 1.28k Views
Struktur Makromolekul Pengantar Struktur dan kereaktifan asam amino Pengantar Struktur dan kereaktifan protein Pengantar Struktur asam nukleat Protein sebagai biokatalis Pengantar Informasi genetika. 4. Struktur , Bentuk dan Informasi makromolekul. Asam amino: Struktur umum & penamaan
E N D
Struktur Makromolekul • Pengantar Struktur dan kereaktifan asam amino • Pengantar Struktur dan kereaktifan protein • Pengantar Struktur asam nukleat • Proteinsebagai biokatalis • Pengantar Informasi genetika 4. Struktur, BentukdanInformasimakromolekul KI-1213-2
Asam amino: • Struktur umum & penamaan • Zwiter ion dan kelarutan • Penggolongan asam amino berdasarkan gugus R-nya: • Alifatik, aromatik, siklik, hidroksil/sulfur, asam,basa, netral • L-asam amino merupakan asam amino yang banyak di alam. • 20 aa. Penyusun protein Struktur & KereaktifanAsam Amino KI-1213-2
Protein: merupakan polimer kondensasi dari aa. Polimerisasi ini terbentuk melalui ikatan peptida. • Sifat ikatan peptida • Organisasi struktur protein: • Struktur primer • Struktur sekunder : -Helix, -pleeted sheet • Struktur tersier • Struktkur kuarterner : Globular, serabut StrukturdanKereaktifan Protein KI-1213-2
Molekul penyusun asam nukleat • Basa nitrogen • Gula • Gugus fosfat • Nukleosida dan Nukleotida • Asam nukleat merupakan polimer kondensasi dari nukleotida • Arah kepolaran asam nukleat StrukturdankereaktifanAsamNukleat KI-1213-2
Gula penyusun asam nukleat • Ribosa, penyusun asam ribo nukleat (Ribonucleic acid= RNA) • Deoksi-ribosa, penyusun asam deoksi-ribo nukleat (Deoxy-ribonucleic acid= DNA) KI-1213-2
Nukleosida dan Nukleotida • ribosa/deoksi ribosa bergabung dengan basa N, membentuk nukeosida (adenosin/ deoksi-adenosin, uridin, Timidin guanosin/ deoksi guanosin, Sitidin/deoksi sitidin • Nukleosida yang bergabung dengan gugus fosfat membentuk nukleotida • Contoh : ATP, GMP KI-1213-2
Basa N : C, G, A, U • Untai tunggal • RNA diperlukan sel dalam sintesis protein: messenger RNA (m-RNA), transfer RNA (t-RNA), ribosomal RNA (r-RNA); pada prokariot. Asam Ribonukleat (Ribonucleic acid, RNA) KI-1213-2
Basa Nitrogen penyusun: C,G,A,T • Terdiri dari 2 untai ganda dengan konformasi heliks ganda. Heliks itu terbentuk sedemikian rupa sehingga tulang punggung deoksiribosa-fosfat ada di bagian luar, sedangkan basa N berpasangan (tak sembarang) di dalam untai. • Arah kepolaran kedua untai itu berbeda satu sama lain (antiparalel). Asam deoksiribonukleat (Deoxyribonucleic acid, DNA) KI-1213-2
Definisi: • Merupakan protein • Fungsi: katalis • Sifat: spesifik: bahkan beberapa bersifat stereospesifik • Penamaan: • Jenis reaksi + akhiran “ase” • Substrat + jenis reaksi + akhiran “ase” • Kofaktor & Koenzim • Penggolongan: • Berdasarkan jenis reaksi yang dikatalisisnya PROTEIN SEBAGAI BIOKATALIS KI-1213-2
Tabel Penggolongan Enzim KI-1213-2
Kerja enzim • Model ‘Kunci & anak kunci’ : Emil Fisher (1894) • Model ‘Induced-fit’: Daniel Koshland (1958) Model Mekanisme Kerja Enzim KI-1213-2
Reaksi: • Pendekatan Kesetimbangan Kinetika Reaksi Enzim KI-1213-2
PendekatanKesetimbangan KI-1213-2
Berdasarkan pers Michaelis-Menten • Kurva antara V terhadap [S] • Pada saat [V] = ½[Vmax], maka: • V= Km Penentuan Km & Vm KI-1213-2
Inhibisi Reversibel • Kompetitif • Non Kompetitif • Inhibisi Irreversibel Inhibisi Enzim KI-1213-2
Contoh Inhibitor tak reversibel KI-1213-2
Fungsi Asam Nukleat • Sebagai blue print suatu organisme • Dogma central • kodon • Anti kodon KI-1213-2