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Introduzione al concetto di thesaurus ( 1 )

Architettura del MeSH: Medical Subject Headings della National Library of Medicine Maurella Della Seta Settore Documentazione Istituto Superiore di Sanità III Riunione di formazione e operativa del Gruppo di Ricerca Azalea Roma, Istituto Regina Elena 2 febbraio 2003.

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Introduzione al concetto di thesaurus ( 1 )

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Presentation Transcript

  1. Architettura del MeSH: Medical Subject Headings della National Library of MedicineMaurella Della SetaSettore Documentazione Istituto Superiore di SanitàIII Riunione di formazione e operativa del Gruppo di Ricerca AzaleaRoma, Istituto Regina Elena 2 febbraio 2003

  2. Introduzione al concetto di thesaurus ( 1 ) • L’interrogazione del Medline e di altri archivi della NLM viene preferibilmente condotta utilizzando i descrittori che compaiono nel thesaurus MeSH (Medical Subject Headings). • Thesaurus = vocabolario di termini controllati utilizzati per rappresentare in forma sintetica i soggetti dei documenti. È composto da una lista di termini ognuno dei quali corrisponde ad un concetto o ad una classe di concetti.

  3. Introduzione al concetto di thesaurus ( 2 ) • Il linguaggio controllato del thesaurus rappresenta il punto di incontro tra l’indicizzatore e l’utente che interroga la base di dati. • I termini accolti nel thesaurus sono collegati tra loro da relazioni semantiche: • a) relazioni di equivalenza - see rimandano da una voce non accolta ad una voce accolta - Clinical Markers see Biological Markers

  4. Introduzione al concetto di thesaurus ( 3 ) • b) relazioni gerarchiche rinviano da un termine gerarchicamente superiore ad uno inferiore e viceversa. Nel thesaurus MeSH questo tipo di relazioni è espresso dalla struttura ad albero. • c) relazioni associative o di affinità rimandano da un termine ad un altro correlato. Esempi del MeSH: Veins see related Phlebography; Neoplasms see related Antineoplastic agents

  5. Altri tipi di relazione presenti nel MeSH • La voce consider also terms at collega termini linguisticamente correlati, aventi radici latine o greche o anglosassoni: questa relazione è usata principalmente per i termini anatomici. • Ad esempio: Liverconsider also terms at hepat- • kidney, renal, nephr- Termini colle- gati a “rene”

  6. Aggiornamento dei descrittori MeSH I descrittori MeSH vengono revisionati ed aggiornati annualmente sulla base dell’evoluzione delle scienze biomediche; specialisti di ogni area della biomedicina effettuano il monitoraggio della letteratura scientifica e tengono sotto osservazione le aree emergenti della ricerca.

  7. Selezione del materiale da indicizzare • La National Library of Medicine si avvale della collaborazione di un comitato di esperti (Literature Selection Technical Review Committee). • Questo gruppo si riunisce periodicamente per esaminare nuovi periodici, valutare se inserirli nel Medline, stabilire il grado di priorità da assegnare (con valore decrescente da 1 a 3 in relazione alle tematiche trattate nella pubblicazione). In media possono trascorrere da 15 giorni a due mesi per l’inserimento nel Medline.

  8. Composizione del thesaurus Mesh Il thesaurus MeSH è composto da: • oltre ventimila descrittori principali (main headings) • quasi ottocento sottodescrittori (subheading o qualifiers ) • oltre centomila voci supplementari (Supplementary Concept Records) , comprendenti nomi di sostanze chimiche, numeri di registro CAS etc.

  9. Ricerca manuale Ricerca online Versione Internet Index Medicus Mesh (allegato al fascicolo di gennaio) Permuted MeSH Annotated MeSH Tree Structures MeSH Browser PubMed MeSH Database UMLS Metathesaurus Gateway Versioni dei Medical Subject Headings MeSH Non più stampati dal 2004

  10. Anatomy [A] Organisms [B] Diseases [C] Chemicals and Drugs [D] Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment [E] Psychiatry and Psychology [F] Biological Sciences [G) Physical Sciences [H] Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena [I] Technology and Food and Beverages [J] Humanities [K] Information Science [L] Persons [M] Health Care [N] Geographic Locations [Z] Categorie in cui sono raggruppati i descrittori nelle MeSH Tree Structures

  11. Esempio di descrittore come compariva nell’Annotated Alphabetic List dei MeSH

  12. Specificità Indicizzazione multipla Coordinazione Il documento va indicizzato con il descrittore MeSH più specifico. Ad ogni documento vanno assegnati tutti i descrittori necessari per esprimerne il contenuto esaurientemente. 1. Descrittore precoordinato 2. Descrittore/Subheading 3. Due o più descrittori Filosofia di indicizzazione

  13. OPERATORI LOGICI OR AND NOT • L’operatore OR seleziona i record contenenti almeno uno dei termini di ricerca Milk OR Cheese • L’operatore AND seleziona i record contenenti entrambi i termini di ricerca Hepatitis B AND Italy • L’operatore NOT esclude tutti i record contenenti uno dei termini di ricerca Cough NOT Child

  14. Avvelenamento da piombo Avvelenamento da benzene Asbestosi da esposizione occupazionale Lead Poisoning Benzene/poisoning Asbestosis +Occupational Exposure Coordinazione dei MeSH

  15. La versione Internet del thesaurus MeSH - MeSH Browser • Dal 1999 la NLM ha dato la possibilità di consultare su Internet il Thesaurus MeSH, mettendo a disposizione all’interno del suo sito Web uno strumento di ricerca denominato MeSH Browser. Il MB non è collegato al PubMed • Indirizzo Internet del MeSH Browser: http://www.nlm.nih.gov/mesh/MBrowser.html

  16. NLM Mesh Browser Schermata iniziale del MeSH Browser

  17. Possibilità di ricerca sul MeSH Browser • Si possono ricercare tre tipi di record • MeSH Heading (descrittori) • Supplementary Concept Records (sostanze chimiche) • Qualifiers (Subheadings) • La ricerca può essere effettuata iniziando la navigazione dall’inizio della struttura ad albero o inserendo un termine o la radice di un termine.

  18. 2004 Struttura ad albero del MeSH. Consente l’esplosione dei termini controllati

  19. Categoria C - Diseases

  20. Struttura ad albero della voce Neoplasms

  21. Record relativo al descrittore Cysts

  22. Ricerca del descrittore Lung Neoplasms

  23. Descrittore Lung Neoplasms

  24. 2004 MeSH Lista di tutti i descrittori in cui è presente il termine Lung

  25. Pregnancy Complications. OpzioneFIND TERMS WITH ANY FRAGMENT Seleziona ogni descrittore in cui compaia almeno una delle due parole inserite come termine di ricerca

  26. 2004 MeSH Si ottiene la lista dei descrittori MeSH in cui è presente il termine Pregnancy o il termine Complications

  27. Ricerca per parole libere (text words) • Le Text Word sono parole significative presenti nel TITOLO, nell’ABSTRACT ed in altri campi del record. Il loro uso è indispensabile quando: • un concetto non è espresso da nessun descrittore • quando il descrittore disponibile non è sufficientemente specifico • per ricercare articoli in process (non ancora indicizzati con i MeSH).

  28. Uso ed applicazione dei subheading

  29. http://www.nlm.nih.gov/ mesh/Mbrowser.html EPIDEMIOLOGY

  30. MeSH Heading identiche a subheading

  31. Surgery in the 20thcentury Surgery/HISTORY Education in Pathology Pathology/EDUCATION Rehabilitation in the future Rehabilitation/TRENDS Surgery of stomach ulcer Stomach ulcer/SURGERY Brain pathology Brain/PATHOLOGY Rehabilitation of handicapped Disabled/REHABILITATION Main Heading e SubheadingDisciplineAspetti

  32. Mesh heading quasi identiche a subheading

  33. Disease A/complications Disease B/etiology Disease A/complications Disease B/ complications Disease/chemically induced Drug/adverse effects Disease/diagnosis Drug/diagnostic use Organ/drug effect Drug/pharmacology Sapendo che la malattia A causa la malattia B Le malattie sono contemporanee, non se ne conosce la causa Malattia causata dagli effetti nocivi di un farmaco Diagnosi di una malattia tramite una sostanza chimica Effetti di un farmaco o sostanza chimica su un organo Alcune combinazioni Mh/Sh più frequenti

  34. Organism/drug effects Drug/pharmacology Organ/surgery Disease/surgery Disease/etiology Technique/adverse effects Disease/ultrasonography Organ/ultrasonography Disease/drug therapy Drug/therapeutic use Effetto di un farmaco o sostanza chimica su un micro-organismo Trattamento chirurgico, operazioni Malattia causata dagli effetti nocivi di una tecnica Esame ecografico Trattamento farmacologico di una malattia, chemioterapia Alcune combinazioni Mh/Sh più frequenti/2

  35. USO DI SUBHEADING SPECIFICI • DIAGNOSI TRAMITE ECOGRAFIA DEL TUMORE EPATICO Liver neoplasms/diagnosis ERRATO Liver neoplasms/ultrasonography CORRETTO *** • TERAPIA DEL MORBO DI PARKINSON CON APOMORFINA Parkinson disease/therapy ERRATO Parkinson disease/drug therapy CORRETTO *** • ANALISI DEL PIOMBO NEL SANGUE Lead/analysis ERRATO Lead/blood CORRETTO

  36. Subheading /anatomy & histology • PANCREAS STRUCTURE MH - Pancreas/anatomy & histology • MEASUREMENT OF THE UTERUS DURING THE FIRST TRIMESTER OF PREGNANCY MH - Uterus/anatomy & histology MH - Pregnancy trimester, first

  37. Applicazione dei subheading tramite MeSH Database

  38. Formati di visualizzazione del descrittore Invio alla casella di ricerca tramite l’operatore logico prescelto

  39. Cliccando direttamente sul descrittore si ottiene il formato Full

  40. Selezionare il subheading “therapy” e l’opzione Do Not Explode this term. Cliccare su:

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