Coleção de Bactérias Instituto Oswaldo Cruz – IOC/FIOCRUZ

1. Coleção de BactériasInstituto Oswaldo Cruz – IOC/FIOCRUZ Joseli Maria da Rocha Nogueira Departamento de Bacteriologia

2. Coleção Entomológica Coleção Helmintológica Coleção de Culturas de Fungos Coleção de Febre Amarela Coleções de PesquisaInstituto Oswaldo Cruz IOC/FIOCRUZ • Coleção de Bactérias • Coleção Malacológica • Coleção de Culturas do Gênero Bacillus e Gêneros Correlatos • Coleção de Leishmania spp. e Endotrypanum spp. • Coleção de Tripanossomatídeos

3. Coleções de PesquisaInstituto Oswaldo Cruz IOC/FIOCRUZ

4. Coleção de BactériasComposição do acervo IOC/FIOCRUZ Microbiologia Bacteriologia Bacillus Staphylococcus Streptococcus Salmonella Vibrio Shigella Yersinia Aeromonas Pseudomonas Listeria Leptospira Neisseria Corynebacterium Bordetella Helicobacter Campylobacter Brucella Escherichia 840 cepas padrão 47.000 isolados

5. Coleção de Bactérias IOC/FIOCRUZ Equipe executora • Joseli Maria da Rocha Nogueira – Informatização da coleção de cultura • Ronaldo Mendes Alves – Isolamento e caracterização de bactérias • Wagner Thadeu Cardoso Esteves - Isolamento e caracterização de bactérias • 06 pessoas a serem contratados – Apoio técnico • 03 pessoas a serem contratadas - Apoio administrativo

6. Coleção de BactériasObjetivos Específicos • Garantir a preservação do acervo bacteriano acumulado em 70 anos(conseqüência das atividades de pesquisa e dos serviços prestados pelos CRN) • Criar a infra-estrutura necessária para a disponibilizar o acervo bacteriano e prestar serviços(guarda, autenticação e fornecimento de cepas) • Treinar pessoal para as atividades das coleções • Elaborar um catálogo dos isolados bacterianos identificados e cepas de referência.

7. Coleção de BactériasAbrangência e Aplicações • Expressiva representatividade da micro-biodiversidade nativa em relação aos principais patógenos humanos e animais; • Acervo referencial para produção de imunobiológicos (soros, anticorpos monoclonais, vacinas e produtos derivados de engenharia genética); • Linhagens utilizadas em controle biológico e produtos farmacêuticos; • Prestação de serviços de tipagem por métodos fenotípicos e baseados na análise do DNA.

8. Coleção de BactériasServiços • Tipagem de novos isolados através de técnicas convencionais e/ou utilizando métodos moleculares; • Depósito de culturas de microrganismos*; • Fornecimento de cepas padrão e isolados clínicos ou de meio ambiente; • Treinamento de pessoal*. * Integrado as atividades dos Laboratórios de Pesquisa e Centros de Referência.

9. Coleção de Bactérias Características principais • Vinculada às atividades dos Laboratórios de Pesquisa e Centros de Referência; • Ocupa o espaço físico corresponde a ocupação dos laboratórios do departamento*; • Pesquisadores são os responsáveis diretos pelas atividades da coleção (bactérias utilizadas nas próprias linhas de pesquisa e atividades de prestação de serviços dos Centros de Referência); • Principal demanda é da comunidade científica nacional e internacional; • O crescimento decorre das atividades de pesquisa e serviços, principalmente no intercâmbio a nível nacional e internacional; • Concentração nas áreas de Saúde Humana, Animal com interfaces nas questões ligadas ao Meio Ambiente; • A coleção não foi estabelecida pelo valor comercial; • Orientação ou tendência no sentido daquilo que é considerado relevante pelos pesquisadores responsáveis, relaciona-se com a demanda nacional no setor Saúde e linhas de pesquisa aprovadas por agências de fomento.

10. Coleção de Bactérias Vantagens e Limitações do Modelo • Principais vantagens: • Possibilidade de implementar um sistema integrado de boas práticas laboratoriais; • Equipe altamente especializada no local, que pode contribuir com a caracterização de cepas, cultivo e técnicas de preservação e outras pesquisas correlatas; • Principais limitações: • Prestação de serviços e produtos limitada as condições operacionais e orçamento dos laboratórios de pesquisa; • Não atende a demanda crescente por materiais autenticados (dificuldade de alcançar regulamentos internacionais/ gerenciamento de questões relativas a propriedade dos recursos e distribuição); • A responsabilidade institucional não é explícita; • Não atende a demanda de depósito para fins de obtenção de patente.

11. Coleção de BactériasGrau de Informatização/Objetivos • Elaborar um único banco de dados capaz de associar as diferentes ferramentas utilizadas pelos diferentes laboratórios que vão compor a coleção; • Definição de “campos comuns” para agregar informações pertinentes a todos os gêneros bacterianos da coleção; • Padronização do sistema de informatização.