ECUE Méthodologie de la Génétique Moléculaire

1. ECUE Méthodologie de la Génétique Moléculaire TD : Claire Darzac Mise en évidence et cribles basés sur des interactions protéiques Cours sur le FRET Maïté Coppey : 12/10 TD : Sandrine Caburet Cribles basés sur des critères d’expression différentielle Cours sur la PCR quantitative Thierry Grange 19/10 TD : Alain Zider Mutagenèse insertionelle chez la drosophile transgenèse Vecteurs Mutagenèse Perte et gain de fonction

2. Mise en évidence d’interactions protéiques par des méthodes biochimiques Test d’interaction GST Co-immunoprécipitation Cribles permettant d’identifier des partenaires protéiques Criblage d’une banque d’expression dans lambda GT11 Clonage de molécules de surface par expression transitoire Le système double hybride Le phage display Protéomique et interaction protéique

3. Culture de bactéries plac Extraction protéique GST X Lysat bactérien M • marquage métabolique • produit de transcription traduction Analyse sur gel SDS page rinçages

4. Culture de bactéries Analyse sur gel SDS PAGE plac plac GST X GST Extraction protéique rinçages

6. Co-immunoprécipitation Extrait cellulaire Anticorps anti X Protéine A sépharose Dénaturation et analyse sur gel SDS page M Ig Y • Mise en évidence Y • Coloration à l’argent • Anticorps anti Y • Marquage métabolique methionine35S • Cartographie peptidique par spectrométrie de masse X

7. Criblage d’une banque d’expression dans lGT11

8. Criblage d’une banque d’expression dans lGT11

9. Cellules cos banque de cDNA construite dans un vecteur d’expression eucaryote Expression transitoire Incubation avec un premier anticorps étalement isolement de l’ADN épisomal Transfection dans des bactéries Analyse des cDNA (séquençage)

12. Gal4 AD LexA LacZ Lex op

13. LexA DLA gal4 DAT Prom. DLA Apat PolyA Proie Apat ampiciline DLA trp Rapporteur PolyA 2µ Ori coli lacZ met ampiciline DAT Gal4 VP16 B42 His 2µ Ori coli Prom. DAT Proie PolyA ampiciline leu 2µ Ori coli

15. stratégie de contre sélection

16. 5’ fluoroorotic acid 5’ fluorodexoxyuridine Thymidilate synthase DNA synthesis

17. Mise en évidence d’une interaction Protéine ARN (phage MS2) Apat ARN phage MS2

20. Transformation dans E.Coli (sup ambre) Phage rescue purification des phages et passage sur colonne d'affinité rinçages élution Ré-infection de bactéries et isolement des plasmides

27. Co-Immunoprécipitation

28. RNA biotinylés Spliceosome humain Analyse en gel bidimensionnel Identification par Spectrométrie de masse Isolement du cDNA correspondant Expression d’une protéine chimère 41-GFP Anti corps anti -U1-snRNP 41-GFP Transfection dans des celllules HeLa