GENETIKA POPULACÍ KVANTITATIVNÍCH ZNAKŮ 8

1. GENETIKA POPULACÍ KVANTITATIVNÍCH ZNAKŮ8 Genetické parametry - heritabilita prof. Ing. Václav Řehout, CSc.

2. Genetické parametry Heritabilita a metody jejího odhadu

3. primární GP genetický rozptyl prostřeďový rozptyl kovariance sekundární GP • heritabilita • opakovatelnost • genetické a prostřeďové korelace

4. Heritabilita = dědivost do jaké míry je znak podmíněný geneticky? do jaké míry je předáván z rodičů na potomky? číselně vyjadřujeme koeficientem heritability h2; nabývá hodnot od 0 do 1; h2 je mírou dědivosti

5. koef. heritability platí pro danou populaci daný čas konkrétní podmínky obecně platí v daném čase a prostoru ! nemá obecnou platnost !

6. hodnota dědivosti závisí na metodě výpočtu struktuře populace podmínkách chovu úrovni užitkovosti úrovni plemenářské práce sezónnosti vlastnosti pohlavním dimorfismu četnosti souboru přesnosti výpočtu meziplemenných rozdílech (užitkovém zaměření)

7. Metody výpočtu h2 1. podobnost rodičů a potomků 2. rozklad proměnlivosti 3. neparametrické metody 4. selekční experimenty ! Podmínka – jen ze souborů příbuzných jedinců !

8. 1. podobnost rodičů a potomků(hodnoceno korelační nebo regresní analýzou) korelace nebo regrese 1potomka na 1 rodiče: korelace nebo regrese B1 - potomka na průměr rodičů: B2 - rodiče na průměr potomků B3 - průměru rodičů na průměr potomků korelace nebo regrese C1 - mezi polosourozenci C2 - mezi úpl. sourozenci C3 - mezi dvojčaty

9. ad a) korelace nebo regrese potomka na rodiče: A1 – bez zohlednění ze strany otců (jeden rodič - jeden potomek) M1 D1 rMD = rXY M2 D2 bDM=bYX Mn Dn h2=2rXY nebo 2bYX Korelační páry

10. ad a) korelace nebo regrese potomka na rodiče: A2 – při zohlednění ze strany otců (jeden rodič - jeden potomek) Modifikovaný výpočet rXY nebo bYX ale stejně h2=2rXY nebo 2bYX

11. ad b) korelace nebo regrese potomka na průměr rodičů: B1 – regrese potomků na průměr rodičů (jeden rodič - jeden potomek) M1O1 D1 M2O2 D2 MnOn Dn M+O 2 R1 D1 R2 D2 RnDn rRD=rXY; bDR=bYX h2=2rXY nebo 2bYX = R

12. ad b) korelace nebo regrese potomka na průměr rodičů: B2 – regrese průměru potomků na jednoho z rodičů (jeden rodič - jeden potomek) P1P2 Pn M1 P1P2 Pn M2 PnPn Pn Mn ∑ P n = P P1 M1 P2 M2 Pn Mn rMP=rXY; bPM=bYXh2=2rXY nebo 2bYX

13. ad b) korelace nebo regrese potomka na průměr rodičů: B3 – regrese průměru potomků na průměr rodičů (jeden rodič - jeden potomek) M1 O1 P1 P2 Pn M2 O2 P1 P2 Pn Mn On P1 P2 Pn P1 R1 P2 R2 Pn Rn rRP=rXY bPR=bYX M+O 2 ∑ P n h2=2rXY nebo 2bYX = R = P

14. C1 – korelace mezi dvojicemi polosour. Opět – páry polosourozenců = korelační páry rXY bYX O1M1,2 PS1 PS2 O2M1 ,2 PS1PS2 OnMm,n PS1 PS2 Při více polos. Než 2 pak páry ze všech možných kombinací= n=počet polosourozenců n2+n 2 h2=4rXY nebo 4bYX

15. C2 – korelace mezi dvojicemi úpl. sourozenců Opět – páry polosourozenců = korelační páry Poznámka: Stejné podmínky chovu obou sourozenců  problém a proto vhodnější AR O1M1 S1 S2 O2M1 S1S2 OnMn S1 S2 h2 = 2S1S2 = 2rXY nebo bYX

16. C3 – korelace mezi dvojčaty Opět – páry polosourozenců = korelační páry Jednovaječná dvojčata: h2=rMZ Dvouvaječná dvojčata:  rDZ h2=2(rMZ-rDZ) Korelace mezi sourozenci úpl.:  rSS (rPS) a jsou-li souč. sourozenci dvojčata, pak rFSMZ h2 = 2(rMZ-rFSMZ)

17. 2. rozklad proměnlivosti z analýzy variance teoreticky vychází z předpokladu podobnosti příbuzných je-li znak dědivý, jsou si příbuzní podobnější náhodní jedinci v populaci

18. podobnost otec: potomci mezi uvnitř nízká dědivost vysoká dědivost střední dědivost

19. Analýza variance - jednofaktorová

20. složky MS • MSE: proměnlivost uvnitř skupiny je podmíněna působením prostředí: MSE: = VE • MSA: proměnlivost mezi skupinami je podmíněna geneticky a vlivy prostředí, ve kterém zvířata produkují: MSA = VE + n0VG vážený počet jedinců ve skupině

21. intraklasní korelační koeficient hodnota závisí na tom, jaká je příbuznost (genetická podobnost) porovnávaných jedinců: pokud porovnáváme polosourozence, je jejich genetická podobnost = 0,25 (proto je výsledek roven ¼ h2)

22. 3. neparametrické metody obtížně měřitelné znaky neznáme fenotyp, známe pořadí korelační koeficient dle Spearmana stanovíme pořadí rodičů a nezávisle pořadí potomků; diference mezi pořadím di n - počet dvojic

23. 4. selekční experiment a) selekční pokus r+ nadprůměrní rodiče p+ jejich potomci r- podprůměrní rodiče p- jejich potomci

24. 4. selekční experiment b) realizovatelná dědivost x průměr populace xs průměr vybraných rodičů x0 průměr jejich potomků

25. 4. selekční experiment c) realizovaná dědivost v genetickém zisku