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Canaux ioniques

Canaux ioniques. I. Généralités sur les canaux ioniques II. Exemples de rôle des canaux ioniques dans des fonctions cellulaires III. Quelques exemples de canalopathies IV. Les canaux ioniques : cibles thérapeutiques et de toxines V. structure moléculaire de canaux ioniques

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  1. Canaux ioniques • I. Généralités sur les canaux ioniques • II. Exemples de rôle des canaux ioniques dans des fonctions cellulaires • III. Quelques exemples de canalopathies • IV. Les canaux ioniques : cibles thérapeutiques et de toxines • V. structure moléculaire de canaux ioniques • http://perso.univ-rennes1.fr/francois.tiaho • Dossier: Phycel

  2. I. Généralités sur les canaux ioniques • 1.1. Propriétés et fonctions générales • Définition des canaux ioniques • Différences essentielles entre transporteurs et canaux ioniques • diffusion simple, vitesse 1000 fois plus élevée pour les canaux. • Prix Nobel concernant les canaux ioniques • Localisation des canaux ioniques • Membrane cytplasmique, membrane du réticulum, membrane nucléaire…. • - Potentiel de membrane • - Potentiel récepteur, potentiel post-synaptique • - Excitabilité • - Neurotransmission • - Couplage excitation contraction • - Différenciation cellulaire (neurones, muscles) • - Transduction des signaux dans la communication cellulaire • - Sécrétion • - Excrétion

  3. Prix Nobel de Physiologie et Médecine 1963: Hodgkin et Huxley C: Courants sodique et potassique du PA A: L’axone géant de Calmar Schéma A issu de Neurosciences, Purves et al. B: La technique de potentiel imposé D: PA et conductances ioniques Figures B, C et D issues de « Principles of neural sciences, 4ème édition, Kandel et al. »

  4. prix Nobel de Physiologie et Médecine 1991: Neher et Sakmann A: Configuration « inside-out » B: Courants nicotiniques unitaires Figures A et B issues de « Principles of neural sciences, 4ème édition, Kandel et al. »

  5. Prix Nobel de Chimie 2003: MacKinon Roderick Structure cristalline par diffraction aux RX de canaux KIR (KcsA) de bactérie, Streptomyces lividans Figures issues de « Principles of neural sciences, 4ème édition, Kandel et al. »

  6. I. Généralités sur les canaux ioniques • Définition des canaux ioniques • Différences essentielles entre transporteurs et canaux ioniques • diffusion simple, vitesse 1000 fois plus élevée pour les canaux. • Prix Nobel concernant les canaux ioniques • Localisation des canaux ioniques • Membrane cytplasmique, membrane du réticulum, membrane nucléaire. - Potentiel de membrane - Potentiel récepteur, potentiel post-synaptique - Excitabilité - Neurotransmission - Couplage excitation contraction - Différenciation cellulaire (neurones, muscles) - Transduction des signaux dans la communication cellulaire - Sécrétion - Excrétion

  7. 1.2. Principes de diffusion des ions à travers les canaux ioniques • Gradients ioniques • Gradient électrique • Gradient électro-chimique et Equation de NERNST • Intensité du courant unitaire et global

  8. Na+ Cl- Ca2+ K+ Na+ K+ PK élevé PNa faible Remarque: PCl élevé PCa faible Gradient chimique Concentrations extracellulaires Na: ~150 mM Cl: ~150 mM K: ~5 mM Ca:~2 mM ATP Ca2+ K+ Na+ Cl- Ca2+ ATP HCO3- Cl- Concentrations intracellulaires K: ~150 mM Na: ~10 mM Cl: ~20 mM Ca:~10 nM

  9. Na+ Cl- Ca2+ K+ K+ Influence su les ions - Entrée des cations _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ - Sortie des anions + + + + + + + + + + + + + + Gradient électrique Genèse K+ Na+ Cl- Ca2+

  10. Ip,Na-K Na+ Ik,F Cl- INa,F Ca2+ Ica,F + = + K+ Ek~ -90 mV ECl~ -70 mV ENa~ +60 mV ECa> +60 mV _ _ _ _ _ _ _ + + + + + + + Gradient électro-chimique Equation de Nernst: Ex = (RT/ZF)Ln([X]o/[X]i) Ip,Na-K K+ Na+ Cl- Ca2+ Na+ K+ ICa,F Ik,F INa,F Ix = G (V-Ex)

  11. Exemple de droite i=f(Vm) Exemple de tracés ix = ץ x (Vm-Ex) Exemple de tracés Exemple de courbe i=f(Vm) Ix = G x (Vm-Ex) G= N x P0 x ץ Courants unitaires Exemple cas de ik,V Courant membranaire Global Po dépend de l’effecteur (Vm, ligand, étirement) Exemple cas deiNa,V

  12. 1.3 classification électrophysiologique des canaux ioniques • En fonction de la sélectivité ionique • - Na+, K+, Ca2+, cationiques, Cl- • En fonction du facteur contrôlant la probabilité d’ouverture • fuite (Na+, K+, Ca2+, Cl-)  • exemples ENaC, canaux à 2-P, KIR et ECaC • potentiel de membrane • ligand chimique • médiateur, second messager • Mécano-récepteur

  13. II. Exemples de rôle des canaux ioniques dans des fonctions cellulaires: • 2.1 Dans les cellules excitables • 2.2 Dans la sécrétion hormonale exemple de l’insuline. • 2.3 Dans l’excrétion • exemple des excrétions hydrominérales de cellules épithéliales pulmonaires.

  14. Prix Nobel de Physiologie et Médecine 1963: Hodgkin et Huxley C: Courants sodique et potassique du PA A: L’axone géant de Calmar Schéma A issu de Neurosciences, Purves et al. B: La technique de potentiel imposé D: PA et conductances ioniques Figures B, C et D issues de « Principles of neural sciences, 4ème édition, Kandel et al. »

  15. Dépolarisation H2O 3 Glucose 2 Gonflement 4 1 Cl- P.O. Ca Influx calcique Glucose X 5 K ATP 2’ Remarque: La cellule ß-pancréatique à un taux de chlore intracellulaire élevé et ECl~ -30 mV 1. Transporteur de glucose 2. Aquaporine 2’. Canal potassique ATP-dépendant 3. Canal chlore mécano-sensible 4. Canal calcique voltage-dépendant Exocytose d ’insuline Rôle des canaux ioniques dans la sécrétion d ’insuline

  16. Légende: SNS:système nerveux sympathique SNP: système nerveux parasympathique RCPG1: récepteur ß-adrénergique RCPG2:récepteur muscarinique PKA: protéine kinase A CamKII: Kinase de type II calcium et calmoduline-dépendante Sécrétion hydrominérale pulmonaire chez l’homme et la souris lumière Sang K+ K+ Homme Cl- NaCl Homme RCPG1 PKA + Souris SNS Cl- KCl K+ Cl- + Na+ Eau CaMKII K+ Souris RCPG2 Na+ SNP Eau Eau Membrane Basolatérale Membrane Apicale

  17. III Canalopathies • 3.1 Mucoviscidose: CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Reguator). • 3.2 Myotonies (crampes): ClC (voltage-sensitive Cl-Channels). • 3.3 HypoPP (paralysie musculaire): Cav et Nav • 3.4 syndrome du QT Long: Kv et Nav • 3.5 Myopathie de Lambert Eaton: Cav • 3.6 Myasthénie Gravis: R-Ach • 3.7 Polykystose rénale: TRP

  18. Canalopathies Définition : Maladies génétiques affectant l’activité de canaux ioniques. http://www.orpha.net/orphacom/cahiers/docs/FR/Prevalence_des_maladies_rares.pdf Les Cahiers d’Orphanet - Prévalence des maladies rares : Une enquête bibliographique.

  19. Bibliographie canalopathies • Tristani-Firouzi and Etheridge. “Kir 2.1 channelopathies: the Andersen–Tawil syndrome”.Pflugers Arch - Eur J Physiol (2010) 460:289–294. • Olson & Terzic. « Human KATP channelopathies: diseases of metabolic homeostasis” Pflugers Arch - Eur J Physiol (2010) 460:295–306. • Anumonwo & Lopatin. ”Cardiac strong inward rectifier potassium channels”. JMCC 48 (2010) 45–54. • Ruth Williams.“Neurodegeneration: Switch to the potassium channel” Nature Reviews Neuroscience 7, Research Highlight p330 (May 2006). • Waters, M. F. et al. « Mutations in voltage-gated potassium channel KCNC3 cause degenerative and developmental central nervous system phenotypes Nature Genet. 26 (2006). ORIGINAL RESEARCH PAPER. • Mazzuca et al. « Canaux ioniques et épilepsies ».Epileptic Disorders Vol. 6, No. special, 2004. • Balser. « The Cardiac Sodium Channel: Gating Function and Molecular Pharmacology”.J Mol Cell Cardiol 33, 599–613 (2001)

  20. Légende: SNS:système nerveux sympathique SNP: système nerveux parasympathique RCPG1: récepteur ß-adrénergique RCPG2:récepteur muscarinique PKA: protéine kinase A CamKII: Kinase de type II calcium et calmoduline-dépendante Sécrétion hydrominérale Pulmonaire chez l ’homme et la souris lumière Sang K+ K+ Homme Cl- NaCl Homme RCPG1 PKA + Souris SNS Cl- KCl K+ Cl- + Na+ Eau CaMKII K+ Souris RCPG2 Na+ SNP Eau Eau Membrane Basolatérale Membrane Apicale

  21. Organisation moléculaire du canal CLC Organisation moléculaire du canal CFTR Chlore, sucres, phosphates, peptides D2 D1 D5 D3 D4 Les différentes mutations impliquées dans La myotonie congénitale de Thomsen et Becker D1 et D2: 12 STM D3 et D4: Activité ATPasique R: phosphorylation par PKA Mutation la plus fréquente sur NBF1, F508 NBF: nucleotid binding fold Canalopathies de canaux chlores Le canal chlore CLC1 est un dimère

  22. Myotonie congénitale de Thomsen et Becker • La myotonie congénitale est une affection se manifestant par une difficulté à la décontraction musculaire en relation avec un état d'hyperexcitabilité de la membrane de la fibre musculaire. Cette affection a un début précoce : bien souvent, les sujets porteurs du trait sont reconnus par les familles dès les premiers mois de vie. La myotonie présente la particularité d'être améliorée par l'effort (phénomène d'échauffement). Le diagnostic clinique est facilement confirmé par l'examen électromyographique qui montre des décharges myotoniques en rapport avec l'état d'hyperexcitabilité de la membrane de la fibre musculaire. Cette myotonie peut être transmise sur le mode autosomique dominant ou autosomique récessif. Les deux formes de la maladie : myotonie de Becker (autosomique récessive) et myotonie de Thomsen (autosomique dominante) sont dues à des mutations du gène du canal chlore. Ces mutations ont pour conséquence une perte de fonction du canal chlore dont le rôle est de faciliter la repolarisation de la cellule musculaire. C'est pourquoi le traitement repose sur les agents bloquant le canal sodium comme le mexiletine, la carbamazépine ou la diphénylhydantoïne. *Auteur : Pr B. Fontaine (avril 2002). • La myotonie congénitale est une pathologie se traduisant par un défaut de relâchement musculaire qui existe dès l'enfance. Cette affection touche tous les muscles y compris les muscles oculaires, faciaux et linguaux. Cette hypertonie musculaire s'accompagne souvent d'hypertrophie et cette affection touche plus sévèrement les hommes que les femmes. • Il existe deux formes de myotonie, la forme à transmission dominante qui débute le plus souvent au cours de l'enfance et la forme à transmission récessive de survenue plus tardive. • Le forme à transmission récessive est plus sévère et s'accompagne d'une faiblesse musculaire de façon transitoire lors des efforts.

  23. La polykystose rénale type dominant (PKD) • La polykystose rénale type dominant (PKD) est la plus fréquente des maladies héréditaires monogéniques du rein. Elle se caractérise par l’apparition lente et progressive de kystes principalement au niveau des reins. • Presque 10 % des personnes sous rein artificiel souffrent de cette maladie. À la différence de la polykystose rénale type récessif, elle se manifeste rarement dans la période néo natale. Toutes les personnes atteintes n’évoluent pas vers l’insuffisance rénale. • Tous les autres organes peuvent être atteints comme le foie, le pancréas, les vésicules séminales et les vaisseaux. Les kystes hépatiques sont la manifestation extra rénale la plus fréquente. • La rupture d'un anévrisme des artères cérébrales est une complication grave.

  24. 4.1. Canaux et thérapie • 4.1.1. Anesthésiques locaux: NaV (lidocaïne, procaïne) • 4.1.2. Anesthésiques généraux et sédatifs: • Récepteur GABA (Barbituriques tels que pheno- et pento-barbital, benzodiazépines tel que valium) • Canaux de fuite potassique (halothane, riluzole) • 4.1.3. Antihypertenseur: Cav(nifedipine), KIR-ATP (Cromakalim, minoxidil, Nicorandil). • 4.1.4. Diabète (Sulfonylurée): KIR-ATP(glibenclamide, tolbutamide).

  25. Bibliographie canaux et thérapie • Ko et al. “Pathophysiology of voltage-gated K+ channels in vascular smooth muscle cells: modulation by protein kinases”. Prog Biophys Mol Biol. 2010 Sep;103(1):95-101. • Ko et al. “Physiological roles of K+ channels in vascular smooth muscle cells”. J. Smooth Muscle Res. (2008) 44 (2): 65–81. • Christophe Girard et Florian Lesage, « Canaux K2P neuronaux : aspects moléculaires et fonctionnels ». M/S : médecine sciences, vol. 20, n° 5, 2004, p. 544-549. • Denac et al.” Structure, function and pharmacology of voltage-gated sodium channels”. Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol. 362, 453-79 (2000) • Grover and Garlid, “ATP-Sensitive Potassium Channels: A Review of their Cardioprotective Pharmacology”J Mol Cell Cardiol 32, 677–695 (2000).

  26. Dépolarisation H2O 3 Glucose 2 Gonflement 4 1 Cl- P.O. Ca Influx calcique Glucose X 5 K ATP 2’ Remarque: La cellule ß-pancréatique à un taux de chlore intracellulaire élevé et ECl~ -30 mV 1. Transporteur de glucose 2. Aquaporine 2’. Canal potassique ATP-dépendant 3. Canal chlore mécano-sensible 4. Canal calcique voltage-dépendant Exocytose d ’insuline Rôle des canaux ioniques dans la sécrétion d ’insuline

  27. 4.2. Toxines de canaux ioniques • 4.2.1. TTX et saxitoxines : NaV(intoxication aux fruits de mer ) • 4.2.2. Dendrotoxines (Dendroaspis angusticeps, mamba vert) et KV, Charybdotoxines (scorpions) apamine (abeilles) IKCa • 4.2.3. Conus geographus (cone): CaV type N • 4.2.4. Agelenopsis Aperta (arraignée): CaV type P/Q • 4.2.5.Bungarus multicinctus (serpent): Récepteur nicotinique • 4.2.6. Strychnine: Récepteur glycine • 4.2.7 Toxine d’algue Kaïnate produit par l’algue rouge Digenea simplex, bloqueurs de certains récepteurs ionotropiques du glutamate.

  28. 4.2.1 Intoxication aux fruits de mer • Bloqueurs NaV: • tétrodoxine (bactéries de souche Vibrio fischeri,, Vibrio altermonas, Vibrio alginolyticus et Pseudomonas spp). • saxitoxine (dinoflagélés alexandrium spp, Gymnodinium spp, Pyrodinium spp), • Activateurs NaV: • brévétoxine (dinoflagélés Gymnodinium breve) • ciguatoxine (dinoflagélés Gambierdiscus spp).

  29. Intoxication à la TTX • Stade 1 : paresthésies buccales suivies dans certains cas de nausées et vomissements. • Stade 2 : paralysie motrice des doigts et des membres. • Stade 3 : perte des mouvements musculaires volontaires, cyanose, hypotension, dysphagie et dysphonie. Détresse respiratoire. • Stade 4 : La mort survient par arrêt respiratoire. Les battements cardiaques persistent mais sont de courtes durées. Arrêt cardiaque par collapsus.

  30. 4.2.1 Intoxication aux fruits de mer • La consommation de mollusques (moules, huîtres, bourgots, clams et même crabes) surtout de mai à septembre, peut provoquer une intoxication grave, parfois mortelle, causée par une toxine paralysante. • PSP: paralysis shellfish poisoning, la plus connue • DSP: Diarrheic shellfish poisoning, • NSP: Neurotoxic shellfish poisoning • ASP: Amnesic shellfish poisoning.

  31. 5.1. Premiers ADNc clonés • 1982: Clonage d’ADNc codant pour la s.u. alpha de récepteur nicotinique de la torpille.Sumikawa et al., Nucleic Acids Res. 1982, vol. 10, p5809-22. • 1984: Clonage d’ADNc codant pour la s.u. alpha du canal sodique de la torpille. Noda et al.,Nature. 1984, vol. 312, p.121-7. • 1986: Clonage d’ADNc codant pour la s.u. alpha de récepteur nicotinique de souris. Boulter J et al., Nature. 1986, vol. 319, p.368-74. • 1987:Clonage d’ADNc codant pour la s.u. alpha du canal calcique de muscle squelettique de lapin. Tanabe et al.,Nature, 1987, vol. 328 p.313-8. • 1987:Clonage d’ADNc codant pour le canal potassique shaker de drosophile. Tempelet al.Science, 1987, vol. 237 p.770-5. • 1996: Clonage d’ADNc codant pour le canal potassique TWIK humain. Lesage et al. The EMBO Journal 1996, vol.15 pp.1004-1011,

  32. 1.Canaux 2 TM/P: KIR 2. Canaux 4 TM/2P: TWIK 4.Stoechiométrie et activation 3. Canaux 6TM/P: Shaker 5.2 familles de canaux potassiques

  33. 5.2. familles de canaux potassiques Girard et Lesage 2004, médecine sciences, vol. 20, p. 544-549.

  34. Bibliographie canaux « 2 TM/P » • Anumonwo & Lopatin. ”Cardiac strong inward rectifier potassium channels”. JMCC 48 (2010) 45–54. • Zünkler. ”Human ether-a-go-go-related (HERG) gene and ATP-sensitive potassium”. Pharmacology & Therapeutics 112 (2006) 12–37. • Grover and Garlid, “ATP-Sensitive Potassium Channels: A Review of their Cardioprotective Pharmacology”J Mol Cell Cardiol 32, 677–695 (2000).

  35. Bibliographie canaux « 4 TM/2P » • Christophe Girard et Florian Lesage, « Canaux K2P neuronaux : aspects moléculaires et fonctionnels ». M/S : médecine sciences, vol. 20, n° 5, 2004, p. 544-549. • Gurney & Manoury, « Two-pore potassium channels in the cardiovascular system”Eur Biophys J (2009) 38:305–318. • Dedman et al. « The mechano-gated K2P channel TREK-1”Eur Biophys J (2009) 38:293–303. • Eric Honoré, « The neuronal background K2P channels: focus on TREK1”Nature Reviews Neuroscience 8, 251-261 (2007). • Sanders and Koh, « Two-pore-domain potassium channels in smooth muscles: new components of myogenic regulation”.J Physiol 570.1 (2006) pp 37–43.

  36. Bibliographie canaux « 6 TM/P » • Berkefeld et al.“Ca2+-Activated K+ Channels: From Protein Complexes to Function”. Physiol Rev 90: 1437–1459, 2010. • Anumonwo & Lopatin. ”Cardiac strong inward rectifier potassium channels”. JMCC 48 (2010) 45–54. • Zünkler. ”Human ether-a-go-go-related (HERG) gene and ATP-sensitive potassium”. Pharmacology & Therapeutics 112 (2006) 12–37. • Wahl-Schott and Biel. “HCN channels: Structure, cellular regulation and physiological function”. Cell. Mol. Life Sci. 66 (2009) 470 – 494. • Birnbaum et al. “Structure and Function of Kv4-Family Transient Potassium Channels”. Physiol Rev. 84: 803–833 (2004). • Mazzuca et al. « Canaux ioniques et épilepsies ».Epileptic Disorders Vol. 6, No. special, 2004

  37. 5.2 Diversité et sous unités auxiliaires des canaux potassiques Figures issues de Lesage et al., M/S 2000, vol 16, p663-73

  38. Courants potassiques cardiaques Zünkler 2006, Pharmacology & Therapeutics 112:12–37.

  39. Famille des canaux potassium à rectification entrante (KIR) • Dans le coeur: • l’assemblage d’hetéromères de Kir2.1, Kir2.2, and Kir2.3 subunits underlie IK1 current. • l’assemblage d’hetéromères deKir3.1 and Kir3.4 subunits underlies IKACh current. Anumonwo & Lopatin, JMCC 48 (2010) 45–54.

  40. canaux « 4 TM/2P » Canaux spinaux Girard et Lesage 2004, médecine sciences, vol. 20, p. 544-549.

  41. TWIK: tandem of P domains in a weak inwardly rectifying K+ channel • TREK:TWIK1-related K+ channel, • TRAAK: TWIK-related arachidonic acid sensitive K+ channel • TASK: TWIK-related acid-sensitive K+ channel • THIK: TWIK-related halothane-inhibitable K+ channel

  42. A: Sous unité alpha 1 de canaux CaV C: Sous unité alpha de canaux NaV + + + + + + + + + + + + B: Structure oligomérique Canaux CaV 5.3 structure moléculaires des canaux CaV et NaV CaV1.X: Type L s.u. α Canaux CaV CaV2.X : Type N, P/Q, R CaV3.X: Type T -Sous unité alpha -Sous unité bêta1 -Sous unité bêta2 Canaux NaV

  43. 5.4.Phylogenèse des canaux ioniques voltage-dépendants Canaux 2 TM/P KIR,,IKATP, GIRK 2. Canaux 4 TM/2P: TWIK Duplication puis divergence Addition puis divergence Canaux 6TM/P: Shaker, HCN, TRP Duplication puis divergence I II Canaux TPC INaV; ICaV Canaux TPC: canaux calciques vacuolaires

  44. 1. Sous unité alpha du récepteur nicotinique 2. Stoechiométrie des récepteurs 5.5. Récepteurs canaux des neuromédiateurs Les récepteurs canaux pentamériques • Famille des récepteurs nicotiniques: • Récepteur Nicotinique (Na, K) • Récepteur 5-HT3 (Na, K) • Récepteur P2X (Na, K, Ca) • Récepteur GABA (Cl) • Récepteur glycine (Cl) Récepteur au Glutamate (Na, K, Ca)

  45. 5.5. Famille des récepteurs canaux glutamatergiques Structure moléculaire: 3TM • Récepteur AMPA (α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionate) • Glur1-4 (Na, K) • Transmission rapide • Récepteur kaïnate (neurotoxin) • Glur5-7, KA1 et KA2 (Na, K) • Désensibilisation rapide du récepteur • Récepteur NMDA (N-methyl-D-aspartate) • NR1, NR2A..D (Na, K, Ca) • Activation lente, potentialisée par la glycine et • bloquée par le magnésium.

  46. 5.6. Sélectivité ionique du canal KCSA de Streptomyces lividans Figures issues de Parent et al. 2002, M/S , vol 18, p.605-9

  47. Voltage-dependance des canaux KV (thermophilic archaebacteria Aeropyrum pernix KvAP) Segment S4 Segment S4 Jiang et al. Nature 423, 33-41 (2003)

  48. Bibliographie: structure cristalline de canaux ioniques • Jiang et al. « X-ray structure of a voltage-dependent K+ channel”. Nature 423, 33-41 (2003). • Jiang et al. <The principle of gating charge movement in a voltage-dependent K+ channel>. Nature 423, 42–48 (2003). • Jiang, Y. et al. “Crystal structure and mechanism of a calcium-gated potassium channel”. Nature 417, 515–522 (2002). • Jiang, Y. et al. « The open pore conformation of potassium channels ». Nature 417, 523–526 (2002). • Schmidt et al.“Phospholipids and the origin of cationic gating charges in voltage sensors”.Nature 444, 775-779 (2006).

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