1 / 21

ISOSITRAT DEHIDROGENASE

ISOSITRAT DEHIDROGENASE. Disusun oleh : Steven Shen (10509065) Martin Suryadi (10509067) Bibit Musnaini (10509079) Masyitha Ambarwati (10509085) Bunga Annisa (10509089) Nona Srikandi (10509093). Iso s itrate dehidrogenase (IDH).

todd-hinton
Download Presentation

ISOSITRAT DEHIDROGENASE

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. ISOSITRAT DEHIDROGENASE Disusunoleh: Steven Shen (10509065) Martin Suryadi (10509067) BibitMusnaini (10509079) MasyithaAmbarwati (10509085) BungaAnnisa (10509089) Nona Srikandi (10509093)

  2. Isositrate dehidrogenase (IDH) • Merupakanenzim yang digunakan pada langkah ketiga dari siklus asam sitrat • Mengkatalisis dekarboksilasioksidatif isositratmenghasilkansebuah molekul α-ketoglutarat • Reaksiireversibeldengan perubahan energi bebas standar sebesar-8,4 kJ / mol

  3. Struktur • PertamadianalisisdaribakteriE. coli • Umumnyaberupahomodimer (gabungan 2 subunit monomer identik) • Terdiridaridari 416 residu dengan berat molekul 45,7 kD • Disusunoleh 14-αheliks dan 18 β-sheet, αheliks beradapadaseluruhstruktur, sedangkanβ-sheet beradapadapusatstruktur

  4. Struktur Gambar 2: IDH kompleksdengan NADP, isositrat, dankalsium Gambar 1: Struktur IDH

  5. SisiAktif • Sisiaktif IDH mengikat molekul NAD+/NADP+ serta ion Mg2+ /Ca2+yang pentinguntukproseskatalisis • Isositrate berikatan dengan sisi aktifmenggunakan 8 asam amino denganurutanTyr, Asn,Ser, Arg, Arg, Arg, Tyr, dan Lys

  6. SisiAktif • Ion logamterikatdenganikatanhidrogenpadatigaresiduasam amino yang sifatnyalestari. • NAD+/NADP+terikatpadasisiaktifdidaerah[250-260], [280-290], [300-330], dan [365-380].

  7. Asam amino penyusunsisiaktif IDH

  8. Tahapanreaksi Terdiridariduatahapreaksi: • Oksidasiisositrat (alkoholsekunder) menjadioksalosuksinat (keton) • Dekarboksilasiguguskarboksil beta keketonmembentukalfaketoglutarat. Reaksiumum: Isositrate + NADP+ Mg2+( ion logam)alfa-ketoglutarat+ NADPH + H+ + CO2

  9. ReaksiKatalisis

  10. MekanismeReaksi

  11. MekanismeReaksiKatalisis Video

  12. Pengendalianreaksikatalisis • Reaksi berlangsungdengan ketersediaan isositrat (substrat), ion Mg2+, NAD+/NADP+dan ADP sebagaiinducer • ADP merangsangenzimsecaraallosteriksehinggameningkatkanafinitasenzimterhadapsubstrat

  13. Pengendalianreaksikatalisis • NADH/ NADPH danα-ketoglutarat bertindaksebagai inhibitor produk • ATP berlebihmenyebabkaninhibisifeedback yang merupakan inhibitor kompetitif

  14. Pengendalianlajuoleh ADP dan ATP Dikutipdari: http://www.chembio.uoguelph.ca/educmat/chm452/lecture8.htm

  15. Deaktivasi IDH pada Bakteri Pembentukan Energi Biosintesis α-ketoglutarat Glioksilat + Suksinat

  16. Inaktivasi IDH • Fosforilasi Serine ( Ser 113) pada sisi aktifakanmenginaktivasienzimdenganmenghambat pengikatan isositrat • Kinase dapatmengkatalisis fosforilasi isositrat dehidrogenase, sedangkanFosfatase melepaskan gugus fosfat dari enzim • Isositrattidakdapatmengikatkarenadihambatsecarasterikdanditolakmuatannegatifgugus fosfat yang terikatpada Ser113.

  17. BentukAktif & Inaktif IDH dari E.coli (a). Dalambentukdefosforilasi, isositrat (kuning) terikatmelaluiikatanhidrogendengan Ser 113 (hijau) danberinteraksisecaraelektrostatikdengantigaresiduarginin (biru). (b). Dalambentukinaktifterfosforilasi, isositrattidakdapatmengikatkarenadihambatsecarasterikdanditolakmuatannegatifgugus fosfat (merah) yang terikatpada Ser113.

  18. Mutasipada IDH • Mutasipadaisositratdehidrogenasedapatmenyebabkanleukimia, tumor otak, danbeberapajeniskankersepertikankerprostatdankankertiroid • Mutasi yang paling seringterjadiadalahpadaresiduArg 132, residu yang terikatlangsungdengansitrat

  19. Mutasipada IDH • Akibatmutasi, produk yang dihasilkandarireaksikatalisisadalah 2 –hidroksiglutarat yang memicuaktivitastranskripsi gen berlebih 2-hidroksiglutarat

  20. DaftarPustaka • Nelson, David L., Cox, Michael M. Lehninger: Principles of Biochemistry, 4th edition. p. 621 – 623. • Williamson, John H., Campbell, A. M. 1999. IsocitrateDehydrogenase Parameters of Enzim Activity. p. 142-143. • Styer, Lubert.2000.Biokimia.Edisi 4. Jakarta: Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia.hal 524-525 • http://www.absoluteastronomy.com/topics/Isocitrate_dehydrogenase (akses 3 maret 2012) • http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16415587 (akses 26 Februari 2012) • http://www.chem.uwec.edu/Webpapers2005/mintermm/pages/IDH.html (akses 27 Februari 2012) • http://proteopedia.org/wiki/index.php/Isocitrate_dehydrogenase(akses 26 Februari 2012) • http://id.wikipedia.org/wiki/Siklus_asam_sitrat (akses 29 Februari 2012)

  21. TERIMA KASIH

More Related