1 / 12

Struktura nukleinskih kiselina

Struktura nukleinskih kiselina. nukleinske kiseline su linearni polimeri. - svaki monomer unutar polimera sastoji se od šećera, fosfata i baze. RNA i DNA razlikuju se po: šećernoj komponenti (riboza, deoksiriboza) 2) jednoj bazi (uracil, timin). . šećeri su vezani fosfodiesterskim vezama

vanna
Download Presentation

Struktura nukleinskih kiselina

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Struktura nukleinskih kiselina

  2. nukleinske kiseline su linearni polimeri - svaki monomer unutar polimera sastoji se od šećera, fosfata i baze • RNA i DNA razlikuju se po: • šećernoj komponenti (riboza, deoksiriboza) • 2) jednoj bazi (uracil, timin) 

  3. šećeri su vezani fosfodiesterskim vezama • šećeri i fosfati čine okosnicu nukleinske kiseline ("backbone")

  4. derivati: • purina: • adenin (A) • gvanin (G) • pirimidina: • a) citozin (C) • b) timin (T u DNA); uracil (U u RNA)

  5. nukleozid : šećer + baza • 4 nukleozida u: • RNA: adenozin, gvanozin, citidin, uridin • DNA: deoksiadenozin, deoksigvanozin, deoksicitidin, timidin  N-9 purina ili N-1 pirimidina vezan na C-1' šećera nukleotid : nukleozid + jedna ili više fosfatnih skupina • 4 nukleotida u DNA: deoksiadenilat, deoksigvanilat, deoksicitidilat, timidilat • npr. ATP: adenozin-5'-trifosfat • 3'-dGMP: deoksigvanozin-3'-monofosfat

  6. pApCpG ili pACG: trinukleotid DNA; 5' → 3' smjer Dvostruka zavojnica

  7. Parovi baza

  8. Zadaci 1. Zadan je tetranukleotid strukturne formule: Na koje se načine njegova struktura može kraće zapisati?

  9. 2. Kod dušikovih baza u ravnoteži su dva tautomerna oblika. Npr. kod timina ravnoteža se gotovo u potpunosti nalazi na strani keto-oblika. Međutim, kod sintetičkog analoga timina 5-bromuracila (5-BU) u ravnoteži je povišen udio enolnog oblika. a) Nacrtajte keto-oblik i enolni oblik 5-BU. b) Koja će biti posljedica ugradnje 5-BU u lanac DNA prilikom replikacije? 3. U jako kiselim uvjetima neki atomi baza DNA su protonirani. Protoniranje uključuje N-1 i N-7 adenina, N-7 gvanina, N-3 citozina i O-4 timina. Kako ta činjenica utječe na stabilnost DNA pri niskim pH vrijednostima? 4. Postoje enzimi, deoksiribonukleaze, koji cijepaju bilo kakav slijed jednolančane DNA dajući nukleozid-monofosfate; ti enzimi ne hidroliziraju dvolančane slijedove DNA. Koje produkte očekujete nakon inkubacije jednog takvog enzima i oligonukleotida sljedećeg sastava: 5'-ApGpTpCpGpTpApTpCpCpTpCpTpApCpGpApCpTp-3'?

  10. 6. pK vrijednosti adenina (N-1) i gvanina (N-7) su 4,2 i 3,2. a) Izračunajte postotak tih grupa u protoniranoj formi pri pH 7,0 b) Da li protonacija ili deprotonacija baza ima veze sa stabilnošću dvostruke uzvojnice DNA? 7. Napišite komplementarni slijed navedenog slijeda u standardnoj (5'3') notaciji: GATCGCGATTACGAC

  11. Sastav baza, izražen molarnim udjelima, jednog lanca dvolančane DNA je [A] = 0,30 i [G] = 0,24. Što možete reći o molarnom udjelu T i C istog lanca, a što o molnim udjelima A, T, C i G komplementarnog lanca?

More Related