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C. elegans : un espejo de 959 células. Prof. Dr. Juan Carlos Rodríguez Aguilera Centro Andaluz de Biología del Desarrollo, Universidad Pablo de Olavide, Sevilla. 1 mm. ¿ C. elegans ?. Caenorhabditis elegans. Goldstein lab. www.news.wisc.edu. Caenorhabditis elegans.
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C. elegans: un espejo de 959 células Prof. Dr. Juan Carlos Rodríguez Aguilera Centro Andaluz de Biología del Desarrollo, Universidad Pablo de Olavide, Sevilla.
1 mm ¿C. elegans? Caenorhabditis elegans Goldstein lab www.news.wisc.edu
Caenorhabditis elegans ¿C. elegans? www.wormatlas.org
Seis cromosomas, dos sexos 959 células somáticas 302 son neuronas 95 son miocitos pared 99% de la población 1031células somáticas 381 son neuronas 1% de la población www.wormatlas.org Paul Stenberg’s Lab
Reproducción (a)sexual • Asexual • Obtención y propagación de cepas genéticamente homogéneas • Facilidad de obtención y mantenimiento de estirpes homocigóticas • Mutagénesis en condiciones controladas • Sexual • Mapeo genético por cruces • Estudios con heterocigotos • Retrocruzamiento con parentales • Estudios de segregación ligados al sexo
Desarrollo de C. elegans (959 cells) (558 cells) www.wormatlas.org
Desarrollo de C. elegans Goldstein lab www.wormatlas.org
Linaje embrionario www.wormatlas.org
Linaje post-embrionario www.wormatlas.org
Estructura génica (in humans 8.8 ± 1.2 exons/gene) www.wormbook.org
Estructura génica 27.000 genes humanos 23.000 genes C. elegans www.wormbook.org
Genoma secuenciado www.wormbook.org www.wormbase.org www.wormbook.org
Termotactismo Rosenzweig et al. , Gen. Dev 19: 419-424, 2005
Quimiotactismo Hirotsu et al. Genes to Cells (2005) 10, 517-530.
Transformación por microinyección • vectores purificados (miniprep), segmentos lineales de ADN (digestiones), productos de PCR • Arrays extracromosómicos, poca estabilidad, herencia Sam Ward's lab www.wormbook.org
Transformación biolística • Integración cromosómica, estable, mutaciones colaterales www.bio-rad.com www.bio-rad.com
Algunos recursos • Wormbase • Wormbook • Wormatlas • Wormimage • Wormserver • Wormclassroom • Textpresso • KO consortium • CGC Genetics Center
C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético www.wormbook.org
C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético www.wormbook.org
Señalización y energía www.wormbook.org
Interacción rutas metabólicas www.wormbook.org
Efectos deletéreos en mutantes coq N2 coq-1 Gavilán et al., Biofactors, 2005 coq-2 coq-8
Degeneración muscular faríngea coq-1 coq-2 coq-8 / N2 Gavilán et al., Biofactors, 2005
Alteraciones bombeo faríngeo N2 coq-1 coq-2 Gavilán et al., Biofactors, 2005
Fenotipos de mutantes coq Gavilán et al., Biofactors, 2005
Eexpresión larvaria de coq-8 Asecio et al., Mech. Age. Dev. 2006
Expresión adulta de coq-8 Asecio et al., Mech. Age. Dev. 2006
Expresión embrionaria de coq-8 Asecio et al., Mech. Age. Dev. 2006
Fácil y asequible • Una lupa estereoscópica con transiluminación (4.000 €) • Una estufa con termostatización (1.500 €) • Un mechero de gas (50 €) • Reactivos varios (300 €) • Pipetas (400 €) • Incubador de cultivos: un cajón (0 €) • Libros técnicos especializados (0 €) • Librería de mutantes (0 €) • Librería de vectores de expresión (0 €) • Librería de vectores de silenciamiento (0 €) • Suscripción a bases de datos genéticas (0 €) • Aprendizaje y destreza (3 meses) www.nematodes.org
Entra en el “mundo elegans”… by Adam Hartley and Carolyn Marks
Gracias por su atención Prof. Dr. Juan Carlos Rodríguez Aguilera Centro Andaluz de Biología del Desarrollo, Universidad Pablo de Olavide, Sevilla.