1 / 24

Pembimbing : Dr.Achmad Saifuddin Noer

Pembimbing : Dr.Achmad Saifuddin Noer. Karina Hidayat 20506038. Tiga lokus STR untuk melengkapi informasi identitas mtDNA. Agenda Presentasi. Pendahuluan Tujuan Metoda Hasil Kesimpulan. Pendahuluan. Identifikasi identitas individu dengan polimorfisme DNA inti dan mtDNA

zyta
Download Presentation

Pembimbing : Dr.Achmad Saifuddin Noer

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Seminar Penelitian

  2. Pembimbing :Dr.Achmad Saifuddin Noer Karina Hidayat20506038 Tiga lokus STR untuk melengkapi informasi identitas mtDNA Seminar Penelitian

  3. Agenda Presentasi • Pendahuluan • Tujuan • Metoda • Hasil • Kesimpulan Seminar Penelitian

  4. Pendahuluan • Identifikasi identitas individu dengan polimorfisme DNA inti dan mtDNA • Identifikasi dengan mtDNA • Identifikasi dengan DNA inti Seminar Penelitian

  5. Tujuan • Mendapatkan beberapa STR yang dapat memisahkan individu dengan pola hipervariabel-mtDNA yang sama Seminar Penelitian

  6. Metoda • Retrieve data dari public database • Pengelompokan data berdasarkan pola pengulangan • Pemilihan lokus • Sintesis primer dan PCR Seminar Penelitian

  7. Hasil • Raw data dari public database (ENFSI) • Pengelompokan pola pengulangan • Pemilihan lokus • PCR dan elektroforesis gel agarosa Seminar Penelitian

  8. Kesimpulan • Lokus yang diduga memiliki kemampuan mendiferensiasi ialah D8S1179, D21S111, dan FGA Seminar Penelitian

  9. Terimakasih Seminar Penelitian

  10. Sintesis Primer Seminar Penelitian

  11. Raw data Data yang berasal dari public site: • 1172 individu • Masing-masing terdiri atas 9 lokus • Setiap lokus terdiri atas dua data repeat • Total data = 21.096 Seminar Penelitian

  12. lokus Total data 1172 Raw Data Seminar Penelitian

  13. 9 lokus Total data 1172 Hasil pengelompokan Seminar Penelitian

  14. nHr = (n+r-1)! r!(n-1)! Pemilihan lokus Seminar Penelitian

  15. 1 2 3 4 5 6 7 8 Elektroforesis gel agarosa Lajur 1 : lokus D8 sampel 1 Lajur 2 : lokus D21 sampel 1 Lajur 3: lokus FGA sampel 1 Lajur 4 : kontrol negatif Lajur 5 : DNA ladder 0,15-1kb Lajur 6 : lokus D8 sampel 2 Lajur 7: lokus D21 sampel 2 Lajur 8 : lokus FGA sampel 2 Seminar Penelitian

  16. mtDNA untuk identitas • Jumlah DNA yang relatif banyak dalam jumlah sampel sedikit • Pewarisan sifat dari ibu. • HV I dan HV II • Daerah HV I memiliki urutan yang lestari hingga 7 keturunan Seminar Penelitian

  17. HVI : 16.024-16.383 HVII : 57-372 HVS (Hypervariable Segment) Seminar Penelitian

  18. Pola polimorfisme DNA inti • VNTR - Variable Number Tandem Repeat • STR -Short Tandem Repeat Seminar Penelitian

  19. VNTR • Terdiri atas 8 - 80pb yang berulang sebanyak 15-35 kali • Panjang fragmen terbesar ~10 kpb • Dianalisa dengan metoda restriksi Seminar Penelitian

  20. VNTR 14 9 4 Seminar Penelitian

  21. STR • Terdiri atas 3-5 bp yang biasanya berulang sebanyak 7-15 kali • Dianalisa dengan metoda PCR Seminar Penelitian

  22. Mother Child Father STR Seminar Penelitian

  23. Seminar Penelitian

  24. Seminar Penelitian

More Related