Enzimoloģija/Metabolisms

1. Enzimoloģija/Metabolisms Transferāzes. To klasifikācija. Pārmetilēšanās procesi. Liāzes. Adenilāt ciklāze.Izomerāzes. Galaktozes metabolisms. Sintetāzes. Molekulāras bioloģijas (bioķīmijas)katedra 2008/2009. akad.gads

5. Pārmetilēšanās procesi

8. kobalamīns kobalamīns Sukcinīl-KoA Metīlmalonīlmutāze

9. Metionīn sintāze (KF.2.1.1.13) darbojas pēc ping-pong mehānisma

11. Kobamīd enzīmu katalizētās reakcijas: • Metīlmalonīlmutāze (metīlgrupu pārneses) • Metionīn sintāze • Leicīn aminomutāze • Kobamīdenzīma katalizētā ribonukleotīdreduktāze

12. Vitamīns B12 vai kobalamīns, oksi, metīl, ciano- kobalamīni. Kobalta atoms saistīts slāpekļa makrocikla korrīna reducētu tetrapirolu sistēmā: I un IV pirola gredzeni savienoti bez metīna tiltiņa I IV

14. IUBMB Enzyme Nomenclature • EC 5.4.3.7 • Accepted name: leucine 2,3-aminomutase • Reaction: (2S)-α-leucine = (3R)-β-leucine • Systematic name: (2S)-α-leucine 2,3-aminomutase • Comments: Requires a cobamide coenzyme. • Links to other databases: BRENDA, EXPASY, KEGG, ERGO, CAS registry number: 59125-53-0 • References: • 1. Freer, I., Pedrocchi-Fantoni, G., Picken, D.J. and Overton, K.H. Stereochemistry of the leucine 2,3-aminomutase from tissue-cultures of Andrographis paniculata. J. Chem. Soc. Chem. Commun. (1981) 80-82. • 2. Poston, J.M. Leucine 2,3-aminomutase, an enzyme of leucine catabolism. J. Biol. Chem. 251 (1976) 1859-1863. [PMID: 1270414] • 3. Poston, J.M. Coenzyme B12-dependent enzymes in potatoes: leucine 2,3-aminomutase and methylmalonyl-CoA mutase. Phytochemistry 17 (1976) 401-402.

16. Ribonukleotīdu pārveidošana dezoksiribonuleotīdos CDP,ADP,GDP NADH2 FAD 2SH S-S 2SH UDP Tioredoksīn- Tioredoksīns Ribonuleotīd- reduktāze B12 reduktāze, Se (KF.1.8.1.9) NAD FADH2 2S-S 2 SH S-S dUDP

17. Pārskats par vienoglekļa savieojumu veidošanos, izlietošanu, holīna cikls, betaīni, tetrahidrogēnfolskābes nozīme

18. Metilēto savienojumu funkcijas var būt visdažādākās Anserine (beta-alanyl-N-methylhistidine) is a dipeptide. Found in the skeletal muscle and brain of mammals, it is an antioxidant and helps reduce fatigue. The pKa of the imidazole ring of histidine, when contained in anserine, is 7.04, making it an effective buffer at physiologic pH. Trigonelline is an alkaloid with chemical formulaC7H7NO2. It is an inner salt formed by the addition of a methyl group to the nitrogen atom of nicotinic acid. Trigonelline is a product of the metabolism of niacin (vitamin B3) which is excreted in the urine.[1] Trigonelline is also found in coffee, where it may help to prevent dental caries by preventing the bacteriaStreptococcus mutans from adhering to teeth.

19. Melatonīns veidojas vairāk tumsā un nospiež seksuālhormonu sintēzi

23. Adenilātciklāzes telpiskā uzbūve

25. Heptahelikālā - heterotrimērā receptora darbība: 1. Ligands saistās ar heptahelikālo receptoru, 2. Receptors saists trimēro proteīnu, 3. Saistītā G proteīna  subvienība GDF vietā saista GTF, 4. GTP un G proteīna saistība isauc trimēra disociāciju, 5. GTF- subvienība aktivē adenilātciklāzi, 6. -subvienība hidrolizē GTF, 7. Veidojas GDF un G-proteīna trimērs.

27. Tālākās signāla transdukcijas piemērs pēc cikliskā AMF izveidošanās

30. Citu cukuru ieslēgšanās metabolismā II glikoze Laktoze beta-galaktozidāze galaktoze galaktozes -1-P UDF glikoze UTF Galaktozīl-1-fosfāt- UDF- galaktozīl-pirofosforilāze uridīltransferāze (Galaktozēmija) glikozes-1-P P-P UDF - galaktoze UDF-glukozoepimerāze 1) Glikoproteīni 2) Glikolipīdi 3) Konjugācijai UDF-glikoze

33. 3’-ACC...