280 likes | 761 Views
Chemie heterocyklů a nukleových kyselin. Petr Tůma. Heterocykly v přírodě. cyklické sloučeniny heteroatom: N, O, S zdroj: černouhelný dehet. Kyslíkaté heterocykly. Dusíkaté heterocykly. Pyrimidin a purin = dusíkaté báze v nukleových kyselinách. Monosacharidy v nukleových kyselinách.
E N D
Chemie heterocyklů a nukleových kyselin Petr Tůma
Heterocykly v přírodě • cyklické sloučeniny • heteroatom: N, O, S • zdroj: černouhelný dehet
Stavební jednotky nukleových kyselin fosfát cukr cukr dusíkatá báze dusíkatá báze N-glykosidová vazba fosfodi- esterová
Speciální nukleotidy energie hydrolýzy: cca -30 kJ.mol-1
Polynukleotidové vlákno 5'- konec fosfát cukr báze fosfát cukr báze fosfát cukr báze směr syntézy DNA připojování: dATP, dGTP, dTTP, dCTP 3'- konec
Párování bází v DNA • komplementarita bází • A = T • C ≡ G • řetězce antiparalelní • informační • templátový DNA mořských ježků obsahuje 32% adeninu. Jaké je procentové zastoupení ostatních bazí?
Replikace = syntéza DNA dle předlohy DNA • DNA polymeráza • monomery: dATP, dCTP, dTTP, dGTP • vedoucí řetězec • opožďující řetězec • Okazakiho fragmenty • prokaryota 1000 – 2000 • eukaryota 100-200
Ribonukleová kyselina • informační RNA též mediátorová (mRNA, messenger RNA) • kódování proteinů • ribosomální RNA (rRNA) • součást ribosomů • transferová RNA (tRNA, přenosová RNA) • přenáší aminokyseliny na ribosomy • malé RNA • účast na sestřihu pre-mRNA • transport proteinů do endoplasmatického retikula
Transkripce = syntéza RNA dle předlohy DNA • RNA polymeráza • monomery: ATP, GTP, CTP, UTP Z jaké sekvence bází DNA byla přepsána následující sekvence RNA? (5') UUCGCAGAGU (3')
Genetický kód a tRNA • kodon = triplet • 43 = 64 tripletů • 20 aminokyselin • tRNA – antikodon • aminoacyl-tRNA-syntetázy: • specifické pro každou AMK
Aminokyseliny a jejich kodony Jaké pořadí aminokyselin je kódováno následujícím segmentem mRNA? (5') CUA-ACU-AGC-GGG-UCG-CCG (3')
Translace = proteosyntéza translace = překlad sekvence nukleotidů v RNA do sekvence aminokyselin v proteinu • mRNA • ribosom • peptidyltransferázovou aktivitu • aminoacyl-tRNA
Sekvenování DNA Sangerova dideoxy-metoda • restrikční endonukleázy • specificky štěpí DNA v určitých místech • palindrom (5')-AG-CT-(3') • primer: malý úsek DNA komplementární k 3'-konci restrikčního fragmentu • 2'- deoxynukleotid-trifosfáty • čtyři různé 2',3'-dideoxyribonukleosid-trifosfáty značené odlišnou fluorescenční značkou • dělení fragmentů gelovou elektroforézou podle molekulové hmotnosti
Dělení fragmentů gelovou elektroforézou podle molekulové hmotnosti