iGEM 2011 infosessie

1. iGEM 2011infosessie

2. wat is iGEM? • internationale GeneticallyEngineeredMachines competitie • sinds 2005 georganiseerd door MassachusettsInstitute of Technology (www.mit.edu) • wedstrijd synthetische biologie voor multidisciplinaire studententeams • teams maken een “nieuwe genetische machine” tijdens de zomervakantie, zowel met computersimulaties als in het labo • alle teams stellen hun project voor op de jamboree (1 – 2 okt) in de Vrije Universiteit van Amsterdam • Winnaars mogen naar het wereldkampioenschap in het MIT te Boston (5 – 7 nov)! • Deelnames K.U.Leuven: 2008 2009

3. wat is synthetische biologie? • combineert biologie en ingenieursprincipes om nieuwebiologischefuncties en systemen te ontwerpen en te bouwen die niet aanwezig zijn in de natuur • die nieuwe functies zijn vaak nuttig voor mens, dier of milieu → groot potentieel! Drew Endy Nature 2005

4. toepassingen • cellenwordengeprogrammeerdals robots voorallerleitoepassingen in geneeskunde, materialen, milieu, energie, … spider silk biobrandstoffen biosensors, bioremediatie, bv. detectie landmijnen bacteriële fotografie tumor productie anti-malaria geneesmiddel biotherapeutica

5. cellen programmeren • cellenwordengeprogrammeerdals robots voorallerleitoepassingen in geneeskunde, materialen, milieu, energie, … recombinante DNA technologie ad hoc & bijna nooit voorspelbaar synthetische biologiegestandaardiseerde onderdelen & voorspelbaar resultaat ontwerp modelleer  bouw

6. iGEM & BioBricks partsregistry.org Breithaupt (2006) EMBO reports • voor iGEM maken we een nieuwe genetische machine mbv BioBricks • BioBricks zijn gestandaardiseerde ‘off the shelf’ bouwblokken waarmee ontwerpers van genetische netwerken aan de slag kunnen • BioBricks uit vorige iGEM’s zijn geregistreerd in de Registry of Standard Biological Parts (partsregistry.org) • Registry groeit bij elke editie van iGEM!

7. iGEM & BioBricks partsregistry.org Breithaupt (2006) EMBO reports • vooriGEMmaken we eennieuwegenetische machine mbvBioBricks • BioBrickszijngestandaardiseerde ‘off the shelf’ bouwblokkenwaarmeeontwerpers van genetischenetwerkenaan de slag kunnen promoter Ribosome binding site gene terminator

8. iGEM & BioBricks partsregistry.org Breithaupt (2006) EMBO reports • voor iGEM maken we een nieuwe genetische machine mbvBioBricks • BioBricks zijn gestandaardiseerde ‘off the shelf’ bouwblokken waarmee ontwerpers van genetische netwerken aan de slag kunnen In silico: Ontwerp & Modellering In vivo: Bouw organisme

9. project K.U.Leuven 2008: Dr. Coli Geneesmiddel Ziektesignaal Reset Geheugen Filter Celdood (Inver)Timer

10. project K.U.Leuven 2009: Essencia coli – The fragrance factory Vanille receptor Licht receptor Vanilleproductie “Sleutel/slot” regulator

11. blog - website - wiki wedstrijdwiki: 2008.igem.org/Team:KULeuven blog tijdens jamboree: igemkuleuven.wordpress.com website: www.kuleuven.be/bioscenter/igem

12. knipsels De Standaard – Wetenschapsbijlage 6 nov 2008 EOS magazine – dec 2008 De Morgen 5 nov 2008 Mens en Molecule 10 dec 2009 De Standaard 12 nov2009

13. de iGEM jamboree!

14. wie zoeken we? • interdisciplinaire teamspelers • sterke motivatie • creatieve geesten • oog voor gewaagde én realiseerbare ideeën • met veel zin voor labowerk en/of modellen bouwen • maar ook grafische talenten, website/wiki makers, PR wonders, wetenschapcommunicators, team managers, ethici, podiumbeesten…

15. wat verwachten we? • 2e semester na paasvakantie (mei – juni): introductie & project brainstorm • zomervakantie: 8 weken aanwezig van de 11 weken tussen 4 juli en 16 september • Tweede helft september: presentatie voorbereiden en poster maken voor jamboree @ VU Amsterdam • Tweede helft oktober: presentatie voorbereiden en poster maken voor jamboree @ MIT, Boston

16. wat krijg je? • een onvergetelijke belevenis en heel wat ervaring • een wetenschappelijke en technische uitdaging • een blik van binnenuit op een nieuwe wetenschappelijke community • Europese jamboree @ VU Amsterdam, 1 – 2 oktober 2011 • Bij plaatsing: Wereldkampioenschap @ MIT, Boston, 5 – 7 november 2011 ?!!! • (reis, verblijf en jamboree)

17. iGEM team 2011 • 14 studenten: • Ingenieurswetenschappen (3) • bio-ingenieurswetenschappen (3) • wetenschappen (3) • biomedische wetenschappen (3) • Media Arts Design faculty (2) • begeleiding door doctoraatsstudenten, postdocs en proffen van BioSCENTer = BioScience, BioEngineering & BioTechnology, datalle onderzoekers in de bio-wetenschappen en bio-informatica van de groep Wetenschap & Technologie groepeert

18. selectie: motivatiebrief • waarom wil jij in het iGEM team? • waarom ben jij de meest geschikte persoon voor iGEM? • kan je samenwerken met studenten met totaal verschillende studie-achtergronden? • wat is jouw visie op synthetische biologie? • welke nieuwe genetische machine zou je maken en waarom? • hoe zou je firma’s overtuigen om het iGEM avontuur te sponsoren? • kan je je8 van de 11 weken zomervakantie (4/7 tot 16/9) vrijmaken, en kan je van 1 tot 2 oktober mee naar Amsterdam, en hopelijk van 5 tot 7 november naar Boston?  stuur je CV* & motivatiebrief (max 1 blz, in Engels!) naar BioSCENTer@bio.kuleuven.be vóór donderdag 12 mei (17h00) *vermeldstudierichting en –jaar (& gsmnummer)

19. info • Main page iGEM: http://ung.igem.org • “What is iGEM” • iGEM 2011: http://2011.igem.org • Registry of Standard Biological Parts: http://partsregistry.org • Voorgaande iGEM competities! • team abstracts: snel overzicht van de verschillende projecten ! • Results: presentatie (met video) en posters van de verschillende groepen • K.U.Leuven teams: • 2008: http://2008.igem.org/Team:KULeuven • 2009: http://2009.igem.org/Team:KULeuven • www.kuleuven.be/bioscenter/igem • Google/Wikipedia ! • erwin.swinnen@bio.kuleuven.be • Hanne.tytgat@biw.kuleuven.be