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Bienvenue !. Formation continue du 19 et 20 janvier 2006 “Exploragénomes”. Contact: Marie-Claude.Blatter@isb-sib.ch. Quelques concepts utiles pour appréhender les banques de données dans le domaine des Sciences de la Vie. Explosion des données en biologie
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Bienvenue ! Exploragénome
Formation continue du 19 et 20 janvier 2006 “Exploragénomes” Contact: Marie-Claude.Blatter@isb-sib.ch Exploragénome
Quelques concepts utiles pour appréhender les banques de données dans le domaine des Sciences de la Vie Exploragénome
Explosion des données en biologie • Nouvelles techniques de biologie moléculaires et nouvelles approches • Exemples: séquençage de génomes complets, microarrays • ->quantités importantes de données (séquences, informations génomiques et biologiques…etc) qu’il faut gérer , stocker et accéder en retour… • -> les banques de données: encyclopédies informatiques • Les banques de données sont devenus des outils indispensables pour les biologistes au même titre que les publications scientifiques. Exploragénome
Banques de données en biologie Il existe plus d'un millier de banques de données dans le domaine des sciences de la vie. Afin d'y voir plus clair -> classification Exemples: * séquences en acides nucléiques (DNA et mRNA); * séquences en acides aminés (protéines); * références bibliographiques; * informations générales sur les gènes et/ou les maladies; * informations sur la structure tridimensionnelle des protéines ou de l'ADN; Exploragénome
Important: Banques de données ‘sources’ (musées, complètes, remises à jour régulièrement, ‘sur la durée’…mais pas facile d’accès….) Banques de données ‘jolies’ (facile d’accès, mais…pas complètes, durée de vie plus courte….) Exploragénome
Quelques noms de banques de données: * séquences en acides nucléiques (DNA et mRNA); EMBL, GenBank, RefSeq * séquences en acides aminés (protéines); Swiss-Prot, RefSeq * références bibliographiques; PubMed * informations générales sur les gènes et/ou les maladies; EntrezGene, OMIM, HMGD * informations sur la structure tridimensionnelle des protéines ou de l'ADN; PDB Il existe aussi des banques spécialisées, comme Newt, qui donne des informations sur la classification des espèces Exploragénome
EMBL/GenBank/DDBJ 200’000 organisms; 20 Sep 2005 Exploragénome
EMBL/GenBank/DDBJ http://www3.ebi.ac.uk/Services/DBStats/ The more representated species are also the more redundant 25 oct 2005 Exploragénome
Celles que vous allez découvrir aujourd’hui… * séquences en acides nucléiques: DNA et mRNA; EMBL, GenBank, RefSeq * séquences en acides aminés (protéines); Swiss-Prot, RefSeq * références bibliographiques; PubMed * informations générales sur les gènes et les maladies associées: EntrezGene, OMIM, HMGD * informations sur la structure tridimensionnelle des protéines ou de l‘ADN; PDB Il existe aussi des banques spécialiées, comme Newt, qui donne des informations sur la classification des espèces. Exploragénome
Ben dis donc…y a du boulot ! Exploragénome
Quelques remarques • Il n’existe pas une “banque centrale” qui contient toutes les infos: il est toujours nécessaire de grapiller les infos dans différentes banques. • Les données s'accroissent quotidiennement (il y a en moyenne un nouveau génome séquencé toutes les semaines) et sont continuellement remises à jour: le résultats de vos requêtes peut donc être différent d'un jour à l'autre (contenu, liens ou “look”) ! Exploragénome
3. Beaucoup de chercheurs travaillent sur un même sujet -> un gène, plusieurs séquences ->redondance. Ces séquences peuvent être différentes (erreurs de séquençage ou mutations, longueurs variables). 4. Les banques de données sont liées entre elles (“links”, cross-références ->réseau). Ces liens ne sont pas toujours bidirectionnels ! 5. Les banques de données contiennent des erreurs ! Exploragénome
C’est pas fini… Exploragénome
Comment accéder aux banques de données ? -> moteur de recherche spécialisé ou Google Comment accéder aux données qui se trouvent dans les banques de données ? -> portail d’accès Exploragénome
Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness RefSeq Entrez Gene OMIM PubMed ……. Serveur du NCBI (USA)
Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Serveur du NCBI (USA) RefSeq Entrez Gene OMIM PubMed ……. Moteurs de recherche spécialisés « Mapviewer » « Gene and Diseases » « Entrez »
Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Serveur du NCBI (USA) RefSeq Entrez Gene OMIM PubMed Mapviewer Moteur de recherche spécialisé
Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Serveur du NCBI (USA) Réseau RefSeq Entrez Gene OMIM PubMed Mapviewer Moteur de recherche spécialisé
Serveur du NCBI (USA) Logos NM_000513NT_025965 NP_000504.1 2652Hs Entrez Gene RefSeq *303800 OMIM Mapviewer Moteur de recherche spécialisé
Gene associated with color blindness Gene assNT_025965. ociated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene associated with color blindness Gene assNT_025965. ociated with color blindness Gene assNT_025965. ociated with color blindness Gene assNT_025965. ociated with color blindness Serveur du NCBI (USA) Numéro d’accession NP_000504.1 NM_000513 2652Hs RefSeq Entrez Gene *303800 OMIM PubMed Mapviewer Moteur de recherche spécialisé
OMIM Serveur ExPASy (Genève) Réseau depuis la banque de donnée Swiss-Prot PDB Newt Liens vers plus de 100 banques de données PubMed EMBL Swiss-Prot « Protein Knowledgebase »
Quelques définitions L’information génétique est stockée dans les chromosomes qui se trouvent dans un compartiment particulier de la cellule, appelé noyau. noyau Une cellule vue en coupe
Chromosome Noyau L’information génétique est stockée dans les chromosomes Cellule ADN Un chromosome est comme une pelote de laine dont le fil est l’ADN A T G C T A A T
Chromosome Noyau Cellule A T G C T A A ADN T Un chromosome est comme une pelote de laine dont le fil est l’ADN
Chromosome Noyau Cellule A T G C T A A ADN T L’ADN est une chaîne composée de 4 « molécules » différentes symbolisées par les lettres AT G C
Chromosome 3 milliards de « caractères »… Noyau tgctgccatctacatttttgggactcgggaattatgtgagtaccgaaactactta gcttatggtaggtgtaccacacgcacagggaaagaattgcgtttatgtgggacag tgaaaacaatcgcaaaaaagcaatggaaagggctttgagagtaatttatcttctg acatatgcaatatggcaacttctaaatggtgagagggagtctctctaaagcaatc atttgaagattggttggacaaacaatgggaaagtcattgtcttagcagaattaag tcatactttttttttttttttttttttgctaactctagaagcttttctgttatct ctgtagctcagacgaaaatgcattctcaccagatgactgtttttggttaatcgat ctgaatgcgctttgtgtggactgtcgaatttcaaagatttaccgtatgaccaaga gcacctgatgctacaagtataaataggggaacaaatgctttctgttcttcctcgg taaggaggtagaggtggaggcggagccggatgtcagaggtcctgaaatagtcacc tgggggaaaatgatccgcctgctgttgaagcccccttctcattccgatcgctttt ggccttgatgatttgaaaataagtcctgttgcaccaggtaagtggacccaggtga gactctgtgatttctgcccataccctcatgtaggtgaccaatgtgactagctgtc ctgtgggggaaatatctccccagccattctgacacccacaggctggacacctgca ttccctagatctgcagaatctcagggagaaggggcattggagaggggatcgtttc ttaagccctttgctctctccctggagaccggtgttttcttctcttgttggaggtt tcagagactggggctccacaattgtcctgtcaatcctgaaggaggtcagatcctg gccaggaaatctctgagtcctccaggaagtcctgagaagcagtggccac Cellule Oups…ça fait 2 m.d’ADN par cellule ! A A T T G G C C T T A A A A ADN T T C
une séquence d’ADN… tgctgccatctacatttttgggactcgggaattatgtgagtaccgaaactactta gcttatggtaggtgtaccacacgcacagggaaagaattgcgtttatgtgggacag tgaaaacaatcgcaaaaaagcaatggaaagggctttgagagtaatttatcttctg acatatgcaatatggcaacttctaaatggtgagagggagtctctctaaagcaatc atttgaagattggttggacaaacaatgggaaagtcattgtcttagcagaattaag tcatactttttttttttttttttttttgctaactctagaagcttttctgttatct ctgtagctcagacgaaaatgcattctcaccagatgactgtttttggttaatcgat ctgaatgcgctttgtgtggactgtcgaatttcaaagatttaccgtatgaccaaga gcacctgatgctacaagtataaataggggaacaaatgctttctgttcttcctcgg taaggaggtagaggtggaggcggagccggatgtcagaggtcctgaaatagtcacc tgggggaaaatgatccgcctgctgttgaagcccccttctcattccgatcgctttt ggccttgatgatttgaaaataagtcctgttgcaccaggtaagtggacccaggtga gactctgtgatttctgcccataccctcatgtaggtgaccaatgtgactagctgtc ctgtgggggaaatatctccccagccattctgacacccacaggctggacacctgca ttccctagatctgcagaatctcagggagaaggggcattggagaggggatcgtttc ttaagccctttgctctctccctggagaccggtgttttcttctcttgttggaggtt tcagagactggggctccacaattgtcctgtcaatcctgaaggaggtcagatcctg gccaggaaatctctgagtcctccaggaagtcctgagaagcagtggccac Chez l’homme, L’information génétique est formée par un texte de 3 milliards de caractères unique pour chaque individu: « le génome humain »
Chromosome Noyau Cellule ADN Un gène
exon intron exon intron exon Stop AUG/Met transcription DNA (génomique) Pre-mRNA hnRNA Splicing (épissage) mRNA (cDNA, EST) AUG/Met Stop traduction protéine Un gène eucaryotique Exploragénome
DNA génomique Les introns sont représentés en rouge 1-1002 1407 - 1451 1084 - 1304 1662 - 1913 En noir, la séquence codante (CDS en anglais)
mRNA virtuel Traduction en ‘protéine’ Exploragénome
STOP Met intron Exploragénome
Notions de mRNA, cDNA Exploragénome
Définition (text book): La RNA polymerase lit le brin anti-sens (template, non-codant, complémentaire) dans la direction 3’ -> 5’ Le mRNA a la même séquence que le brin DNA sens (codant) Exploragénome
Coding strand Complementary strand Définition (text book): La RNA polymerase lit le brin anti-sens (template, non-codant, complémentaire) dans la direction 3’ -> 5’ Le mRNA (cDNA) a la même séquence que le brin DNA sens (codant) Exploragénome
Les protéines: quelques chiffres Chez l’homme, on pense qu’il existe environ 25’000 recettes ou gènes; On sait que la photocopie de la recette et/ou la protéine peuvent être modifiées: il y aurait plus de 1 million de protéines différentes ! Bienvenue au Royaume des protéines ! Exploragénome
From Genome to Proteome Human: about 25’000 genes Genome 10-42 % Alternative splicing of mRNA « After ribosomes » Post-translational protein modification (PTM) Increase in complexity 5 to 10 fold Definition of PTM: Any modification of a polypeptide chain that involves the formation or breakage of a covalent bond. Proteome Human: about one million of ‘different’ proteins; several proteomes
The shortest sequence is GWA_SEPOF (P83570): 2 amino acids. The longest sequence is SNE1_HUMAN (Q8NF91): 8’797 amino acids. Q8WZ42: 34’350 amino acids. http://www.expasy.org/sprot/relnotes/relstat.html Exploragénome
Annotation of the sequence differences Multiple alignment of the end of the available GCR sequences Exploragénome
La bioinformatique, c’est quoi ? L’utilisation de l’informatique pour l’analyse de l’ADN et des protéines de tous les êtres vivants. Exploragénome
Acquérir puis stocker les informations biologiques sous la forme d’encyclopédies appelées bases de données; Développer des programmesde prédiction et d’analyse en utilisant les informations contenues dans les bases de données; Analyser/Interpréter/Prédire: utiliser ces programmes pour analyser de ‘nouvelles’ données biologiques et prédire in silico par exemple la fonction potentielle d’une protéine; Visualiser: développer des programmes pour visualiser la structure en trois dimensions des protéines et de l’ADN, pour shématiser des voies métaboliques ou des arbres phylogénétiques. Exploragénome
Bioinformatique - application 1:acquisition de données • Exemples: lecture d’images de gels 2D, spectrométrie de masse (MS), séquençage ADN... • Détection de signaux ou d’images • Absence de contexte biologique. Exploragénome
Séquençage d’ADN Informatique instrumentale Programme pour analyser les données d’un séquenceur ADN Exemple: pregap4 de Rodger Staden https://sourceforge.net/projects/staden. Exploragénome
Bioinformatique - application 2:Assemblage des séquences d’ADN Nature 409, 860-921 (2001) • Les méthodes actuelles de séquençage ne permettent pas d’obtenir des séquences fiables de plus de 1000 bp ! Exploragénome
Bioinformatique - application 2:Assemblage des séquences d’ADN • -> Reconstruire la séquence complète d’un génome ou d’un morceau de chromosome (« contig ») à partir de séquences de 1000 bp; • Pas du tout trivial parce que: (a) il y a des erreurs de séquence; (b) il y a des régions répétitives. “Celera-generated shotgun data set consisted of 27 million sequencing reads …” Whole-genome shotgun assembly and comparison of human genome assemblies.PNAS 101(7):1916-21 (2004) Exploragénome
CCCCTGACGACCGATTCAAAAACCACTTTCCTCTTTTACGGCGCCCTAGCGCTATGGCGGTGAAGACTGCTTGACATTAACATGCCTGTTGAGGCTAGAGAATCCATGCGAAGGCGGTTCGGAAACTGCTTCGAAGGCGTGGGGTGGTGCGGGGGGTGGGATTTGAACCCACGCAGGCCTACGCCATCGGGTCCTAAGCCCGACCCCTTTGGCCAGGCTCGGGCACCCCCGCACCGTGTAGTCTTTAGGTTTAGCTTTCAGGGTTAAAACGGTTTAACACTCATGAGTATCACTGGGCTGGCTGTGACTGGGCTCTGCATTCCCGAGGCCATGCTGCCCGTGAGGAATAACGGGTCTGAGGAGCCGTTGACAGGTTGCCATTTGGCCTTGCCCCCAAAAGTGATGCTGTGGATCACGACCTCCTCGGAGGAGGGGAGCCTCAGCATACACTTTATAATGAAGGCTTTAAGGGTTTAGCCGGATAATGTTGTTGGGGCGTGCAGCGGCAAGTGCTGCAGCTCATGGGTATGGTATGCGGCTTTGCCTGGTGATGCGGTTTGGCCCCCGTTGTCTGCGACGTCTGCGGTGTTAGGAGGGCTGTGGTGCTGCAGCGCCACACGGGAAGGCGGCTCTGCAGGGAGTGCTTTAGGGAGGATATAGTGGGGAGGGTCAGGAGGGAGGTTGAGAGGTGGGGGATGATAGGCCCTGGGGAGACGGTCCTCCTAGGCCTGAGCGGCGGTAAGGACAGCTATGTCCTGCTGGACGCCCTCTCCGAGATAGTCGGGCCCTCGAGGCTGGTGGCGGTGTCTATAGTGGAGGGCATACCGGGGTACAACAGGGAGGGAGATATCGAGAAGATCAGGAGGGTGGCCGCGGCTAGGGGCGTCGACGTGATAGTGACGAGCATAAGGGAGTACGTGGGGGCCAGCCTCTATGAGATATACTCCAGGGCCCGAGGGAGGGGGGCGGGCCACGCCGCCTGCACCTACTGCGGCATAAGCAGGAGGAGGATACTTGCCCTCTACGCCCGCCTCTACGGCGCCCACAAGGTCGCTACGGCCCACAACCTCGACGACGAGGCGCAGACAGCTATAGTGAACTTCCTCAGGGGGGACTGGGTTGGCATGCTGAAAACACACCCCCTCTACAGGAGCGGGGGCGAGGACCTGGTTCCAAGGATAAAGCCTCTTAGGAAAGTCTACGAGTGGGAGACGGCCAGCTACGTGGTACTCCACCGCTACCCCATCCAGGAGGCTGAATGCCCCTTCATAAACATGAACCCAACCCTCAGGGCGAGGGTGAGGACGGCCCTGAGGGTGCTAGAGGAGAGGAGCCCGGGCACCCTGCTCAGGATGATGGAGAGGCTCGACGAGGAGCTGAGGCCGCTGGCCCAGGCCATGAAGCCCTCCTCCCTAGGCAGGTGCGAGAGATGCGGGGAGCCGACCAGCCCGAAGAGGAGGCTCTGCAAGCTCTGCGAGCTCCTGGAGGAGGCCGGGTTCCAGGAGCCCATCTACGCGATCGCAGGGAGAGGCAAGAGATTAAGGCTTCAGAGCCCCACCGCTAGCCCTGGGTGAACGCGCTATGGCAAAGCCAAAGGTTAGCCTGCCGGAGGATGTGGAGCCCCCCAAGGCTATAGTCAAGAAGCCTAGGCTAGTGAAGCTAGGCCCCGTAGACCCGGGGGTCAGGAGGGGAAGGGGGTTCAGCCTAGGCGAGCTCGCGGAGGCTGGGCTAGACGCTAAAAAGGCGAGGAAGCTTGGCCTGCACGTGGACACGAGGAGGAGGACGGTCCACCCGTGGAACGTGGAGGCCCTCAAGAAGTATATAGAGAGGCTTAGAGAGGCGGGCGTAGAGGTCTAGACCCCGGGGCTATATACTACCACTTCGCCCTCCCCATTATACTATCCACATCCACCCTGGCCCTCCCCACCTCCAGGACCTCAATATCCCCCTCAGCCCTGGTGTACACGCTCAAAGACGGCTCCCTGTAGGAGGCCCTGGTCACCACCCCCACGTGAATCACCCCTCCCGCGTGTACGGCGGCTATAAGCCCCCTCTCCCAGCCCTCCCGGAGGACGCGGAGCCCGGAGCCTACTCCGACCCTACCGCCCCTCCTCGCCACAACCACTATGTCCCCGTCAACACTCTCACCATAGAGGGCGGCTGGGTGTAGGGCCTTGAGGGCCTCGTGGGCCAGAGGCTCCCCCCGGAATATCGGCGCGCCAACTATCTCGGCCTCGCCGGGCCTGACCCTCCTCTCCCTCCCTCCCGAGGTCCTAAGGGCTATCAGCCTCTCCCTATGAAGAGCCCTCTCCCCCCGGCTCTTGCCCGCCTCTCCAGCCAGCCTCTCCACAGACAGAGTGTCAAGCCCCCACACCCTCTCGAGCAGCCTGGCCCGTCGGCTGGCTATGCCCACCGCGACTACAAGCCTTGCTCTAGAGGCTATGGCGAGGGCTGCCTTAGACTCGAGCCCCTCCCACAGTGATATCCAGCCATCTGTATCCACTACCACCTGGCTGGCCAGTGAGGCCAATCTAGATGCGCAGGCGAGGTAGCGGGACTCCGACCCCCGGGGGGTGAAGCCGCCGACGAAACACGGCTCGACACTCGAGAACGAGTCGTCTAGGCCCGGGACGGCCACGCCCTGTGGAGACGCCAGCGCCATAAACCCCGGGGCGAAGACCTCGTTCTGGCCTATATCCGCCGACAGCAGTCTATACCCACCACCGCCCCTGTTAACTATCCAAGCCGCTAGTGTGCTCTTACCGGAGTCGCTCGGCCCCACAATAGCCACCCTGCCCCGCTGAGAGGCCTCCCTGGCTATGGAGTCGAACCTGTTGTAAGCCTCCTCCACGCCCCCTGTGGAGACTACACCGGACACAATAGCCCTCCCCTCAACCCTGGCGAGCACCGACCTGCCTGCAGGGACCACTAGAGTAGAGCCCTCCCCCAGCCTTCCACCCAAAACCTCTGCAGCACCCTCTACAACCTCTATCCTCCCCGGGCCGCGGACTAGCGCCGAGCCCCATGCAATCTCCACAGGCAAAGCTTTAAACCCCCAGTGGTAAGATATGTGAACCGGGCCGCGGTAGTATAGCCTGGACTAGTATGCGGGCCTGTCAAGGGCCCCGCCTCCGCCCCACCCTCATTCTACTACACGCTTATCAGGATAAACAGCCGGGCAAACGTTTTTAACCCCGCCGAAATTCATACTCTTCCCGGGGCGGAGGCGGGCCTGCGGAGAGCCCGTGACCCGGGTTCAAATCCCGGCCGCGGCGCCAATAATCCTCGCGGCCCGCCTTCAAGACTCACTAAACCCCGGTTGAGCACCCGCAGCATCGATGCTAAGGCTCGAGCCATGCATAGTGCCCGCGGGGGGTGGGGGGATTTGGCGAGGCCTGTTGAGGCGGTAAAGAGGCTGCTGGAGAGGTGGCTGGAGGGTAGGAGGAGGGGTTATGTCCTTACGCTTGTAGCTCTTAGAAGGCTTGAGGAGAGGGGGGAGGAGGCTACTGTAGAGAGGGTTAGGGAGGAGGGCCTGAGGATTCTGGAGAGGACGGAGGGGAGGATAGACTGGGGTGTTACTAGGGATGAGTACACTGTCAACATGGTCTCCAGCGTTCTTCGCGAGCTGGCCGAGAGCGGCCTTGTCGAGATGGTGGACGGCGGGAGGAGTATCGTCAGGTACAGGATAGCGAGGGATGCTGAGGAGGAGTTCCTCTCCAGCTTCGGCCACCTCCTGCAGCTTGTGAGGATGCCGAAGTAGCGTTAAAGCCCTAGGTGCCAGAGGCCGCCGGAGGCTAAGAGGCCGATGAAGGCCTTGAGAGGCTCTGCCGCCAAGCTATCCCTATCCCTGCTGCTCTTTTGGGCTAGCTACTCGATCTACTACACTATAACGAGGCGTGCTGTAGAGGAGGGCCTAGGAGAGGGATCCTACCTCCTGGGCGTCTTGATGTCGGGGGCTGAGGAGGCGCCGCTCGCGGCGTCAATAGTCCTTGGCTACCTGGCGGACAGGCTAGGCTACCGCTTACCCCTGGCCCTGGGCCTGTTTGAGGCTGGGCTGGTCGCTGCAATGGCCTTCACCCCCCTAGAGACCTACCCCATACTGGCTGGGGCTGCGTCGCTAGTCTACGCCCTCTCATACTCCGCCCTAATGGGCCTCGTCCTGGGTGAGAGCGGGGGGAGCGGCTTCAGGTACAGTGTTATAGCAGCCTTCGGCAGCCTTGGCTGGGCTCTCGGCGGGTTGGCGGGGGGAGCGGCTTACTCCCGCCTGGGGTCACTGGGGCTCCTAGTGGCCGCAGCCCTCATGGCCGCCTCATACCTAGTCGCCCTCTCAGCCTCGCCCCCCCGCGGCGGCGCGGCGCCCAGTGTGGGGGAGACGATAACCGCTCTGAAGGGGGTTCTGCCCCTATTTGCAAGCCTCTCAACCAGCTGGGCGGCCTTGGGCTTCTTCTTCGGGGCTGCCAGCATAAGGCTTAGCGAGGCGCTCGAGAGCCCTATCGCCTACGGGCTAGTGCTGACCACCGTCCCCGCACTCCTAGGCTTCCTGGCGAGGCCTGCGGCGGGCAGGCTGGTCGACAAGGCCGGGGCTGTGGCAGTGCTTGCGTTGTCCAACGCGGCATACTCCCTTCTCGCCCTAGTTTTCGGCCTGCCCACCAGTCCGGCCCTGCTGGCCCTTGCATGGAGCCTGCCCCTATACCCCTTTAGGGATGCCGCCGCGGCCATCGCAGTTAGCAGCAGGCTTGAGAGGAGGCTGCAGGCGACGGCCGCGGGGCTGCTCTCAGCGAGCGAGAGCGTCGGCGGCGCTGCAACCCTTGCCCTGGCACTGCTCCTGGATGGGGGGTTTAGGGAGATGATGACGGCTTCAATAGCCCTTATGCTCCTCTCCACCCTACTCCTGGCCGCAGACCACTCTACGGCTCCACGCCGAGAGCCCTGTCCCCGGCGTCGCCAAGGCCCGGCACTATGAAGTAGTTCTCGTCCAGCTCGGGGTCTAGGGCTAGCGT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Génome humain 3.2 milliards de pb 2.7 milliards de $ (coût en 2000) 100 $ (coût en 2008 ?) Exploragénome