240 likes | 767 Views
Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri (KHDAK) Hastalarında NF- Kappa B 1 Gen Polimorfizminin Rolünün Araştırılması. Yasemin Müşteri Oltulu 1 , Gökhan Özkan 1 , Engin Aynacı 2 , Ender Coşkunpınar 1 , Pınar Yıldız 2 , İlhan Yaylım 1 .
E N D
Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri (KHDAK) Hastalarında NF-Kappa B 1 Gen Polimorfizminin Rolünün Araştırılması • Yasemin Müşteri Oltulu1,Gökhan Özkan1 ,Engin Aynacı 2, Ender Coşkunpınar1, Pınar Yıldız 2, İlhan Yaylım 1. 1. İstanbul Üniversitesi DETAE Moleküler Tıp AD, İstanbul 2. Yedikule Göğüs Hastalıkları ve Göğüs Cerrahisi Eğitim Araştırma Hastanesi, İstanbul TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Herhangi bir çıkar çatışmam yoktur. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Akciğer Kanseri - Giriş • Akciğer kanseri tüm kanser ölümlerinin % 19,4’ünden sorumludur. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Giriş ve Amaç • Hastalığın genetik, moleküler ve biyolojik özelliklerinin ortaya konması, sağkalımı artırmaya yönelik bireysel tedavi olanaklarının geliştirilmesine imkan sağlayacaktır. NF-κB aktivasyonundaki artışın KHDAK’de birçok prognostik faktörün regülasyonunu etkilediği bilinmektedir. Bu çalışmada NF-κB1 -94ins/del ATTG polimorfizminin KHDAK deki rolü araştırıldı. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
KHDAK’de Hedefe Yönelik Kanser Tedavisi TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
NF-κB • NF-κB ilk kez 1986 yılında Baltimore ve arkadaşları tarafından tanımlanmıştır. • NF-κB geni B lenfositlerinin çekirdeklerinde yer alan bir transkripsiyon faktörü olarak tanımlanmaktadır. • Birçok organizmada ve hemen her hücre tipinde bulunan, birçok genin ekspresyonunun regülasyonunda önemli bir düzenleyici protein olduğu saptanmıştır. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
NF-Kappa B Yapısı ve Üyeleri NF-κB/Rel proteinleri C terminal dizisine göre 2 sınıfa ayrılır; p50/p105 (NF-κB1) ve p52/p100 (NF-κB2) RelA (p65), RelB, c-Rel yer alır TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Beş adet NF-κB polipeptidihomo- ve hetoro-dimerizasyon yoluyla 15 adet transkripsiyon faktörü oluşturabilir: Gösterilen 9 adet dimer transkripsiyonal aktivasyon gösterebilen dimerlerdir. Transkripsiyonal aktivasyon domaini bulunmayan dimerleri göstermektedir. DNA’ya bağlanma kabiliyeti olmayan dimerleri göstermektedir. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012, Antalya
NF-κB1 • NF-κB1 geni 4. kromozomun uzun kolunda lokalize (4q24) 156 kb ağırlığında ve 25 ekzondan oluşan bir gendir. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Bu varyasyonun, büyük bir sekansı etkilemesi, iki önemli promotör düzenleyici arasında yerleşmesi (Aktivatör protein-1 (AP-1) ve κB bağlanma yeri) ve bulunduğu pozisyon itibarı ile fonksiyonel κB bağlanma noktasına çok yakın olması nedenleriyle önemli olduğu düşünülmektedir. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
NF-κB Aktivasyon Yolağı • TNFα • IL-1 • LPS • LTB • BAFF • CD40 • IKK aktifleşir • NIK aktifleşir • Serin Spesifik Fosforilasyon (Ser32-34) • Serin Spesifik Fosforilasyon • (C terminal) • Ubiqutinasyon • (Lys21-22) • (E2 – E3 ligaz) • Ubiqutinasyon • Degredasyon • (26 S proteozom) • Preolitikyıkım • Dimernükleusa • Dimernükleusa TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Atipik Aktivasyon Yolağı • Hipoksi , H2O2 Tirozinkinazıuyarıyor • IKBα Tyr42’den fosforilleniyor • Degredasyon • UV, HER2 Kazein KinazII’yiuyarıyor • IKBα fosforilleniyor • Degredasyon TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Materyal - Metod TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
PCR NF-κB1 -94 ins/del ATTGpolimorfizmi RFLP Van91l (PflMI) Enzim Kesimi TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
BULGULAR TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
II:insersiyon/insersiyon DD:delesyon/delesyon ID:insersiyon/delesyon TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
TARTIŞMA • D alelinin promotor aktivitesi • I alelinin promotor aktivitesi • I allelini taşıyan oligonükleotitlerin çekirdek proteinlerine sıkıca bağlandığı fakat Dallelini taşıyan oligonükleotitlerin ise çekirdek proteinlerine bağlanmadığı ya da daha zayıf bağlandığı saptanmıştır. • D aleli, NF-κB1 ekspresyonunda azalmaya neden olup diğer Rel homo/hetero dimerlerin fazla ekspresyonuna neden olabilir. • Azalmış p50 (NF-κB1) ekspresyonu inflamatuvar yanıtın azalmasına yol açabilir. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
SONUÇ • DD genotipli bireylerin frekansının hasta grubunda kontrole göre anlamlı şekilde yükseldiği ve hastalık oluşum riskini 3,13 kat arttırdığı gözlenmiştir (*p=0,018 , 2:5,605; OR: 3,13%95CI: 0,119-0853). TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
SONUÇ NF-κB1 -94 ins/del ATTG promotor polimorfizmi akciğer karsinogenezinde ve prognozun belirlenmesinde önemli bir bulgu olabilir. Akciğer kanserinde kritik sinyal yolaklarındaki moleküler mekanizmaların ortaya konması, yeni tanı ve tedavi metodlarının geliştirilmesine imkan sağlayacaktır. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya
Gökhan Özkan, MSc Ender Coşkunpınar, PhD Engin Aynacı, Uzm Dr. Pınar Yıldız, Doç. Dr. Ayse Eren, MSc İlhan Yaylım, Prof.Dr. TTD 15. Yıllık Kongresi 11-15 Nisan 2012 Antalya