1 / 47

Conferência Científica Internacional Amazônia em Perspectiva Manaus, 18 Novembro de 2008

Redes de Coleções Biológicas. Integração e disseminação de dados sobre espécies e espécimes: a experiência da Rede species Link. Conferência Científica Internacional Amazônia em Perspectiva Manaus, 18 Novembro de 2008.

spike
Download Presentation

Conferência Científica Internacional Amazônia em Perspectiva Manaus, 18 Novembro de 2008

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Redes de Coleções Biológicas Integração e disseminação de dados sobre espécies e espécimes: a experiência da Rede speciesLink Conferência Científica Internacional Amazônia em Perspectiva Manaus, 18 Novembro de 2008

  2. Bioinformática, informática para biodiversidade, ecoinformática e coleções biológicas

  3. Padrões e protocolos  interoperabilidade entre sistemas de informação • Acesso dinâmico e transparente à dados distribuídos sobre biodiversidade • Global Biodiversity Information Facility (GBIF) • 160 mihões de registros de • > 200 provedores de dados • > 1.000 coleções biológicas • Rede speciesLink (Brasil) • 2.9 milhões de registros • 150 coleções/sub-coleções Informação integrada sobre espécies, linhagens, genomas e ecologia

  4. A importância e uso dos dados de coleções biológicas Pesquisa educação nomenclatura taxonomia dados descritivos tomada de decisão dados primários modelagem qualidade de dados mapas coleção biológica

  5. Rede speciesLink http://splink.cria.org.br

  6. interface search Protocolos para buscas em sistemas distribuidos Linux MySQL Win98 biota Win98 Access FreeeBSD PostgreSQL Col 3 Win2000 Brahms Col 4 Col 2 Col 5 Col 1 protocol X ? ? ? protocol X protocol X ? protocol X ? protocol X program

  7. interface search Solução para interoperabilidade: Linux MySQL Win98 biota Win98 Access FreeeBSD PostgreSQL Col 3 Win2000 Brahms Col 4 Col 2 mapping Col 5 Col 1 mapping mapping protocolo X mapping mapping protocolo X protocolo X protocolo X protocolo X + DarwinCore program

  8. Solução para integração de dados distribuídos • Protocolo DiGIR • Aplicativos DiGIR (Portal and Providor) • Modelo de dados DarwinCore 2.0 • spLinker • Aplicativos para exportar dados • Independente da plataforma • Independente do banco de dados

  9. site speciesLink Presentation layer Perl Collection A Mirror or cache node Collection B Collection C Postgres Data PHP Provider PHP Provider SQL SQL Data Data spLi nker spLi nker SQL SQL SOAP Server Collection Management System Collectione Management system Collection Management system Data repository Data repository Indicators/DCdatabase Postgres PHP Provider SQL SOAP Server Solução: conectividade internet Network available 24 hours Network not availablel 24 hours Advanced search & inventory Centralized Search

  10. Banco de dados das coleções: Campos de um registro Dados enviados ao servidor regional a serem disponibilizados on-line Dado bloqueado Mapeamento dos campos Modelo DarwinCore + Filtro para dados sensíveis

  11. Integrando dados e sistemas Exemplo: Tabebuia

  12. Rede speciesLink Ferramentas para a limpesa e correção de dados

  13. Ampliação do conhecimento sobre biodiversidade Quais espécies? • Indicadoras • Invasoras • Ameaçadas • Endêmicas Dados? • Catálogos taxonômicos e listas de espécies • Dados de ocorrência • Amostras em coleções científicas Qualidade? • Nomenclatura, georeferenciamento Esforço coletivo e processo contínuo

  14. Coleções Biológicas da Rede INPA Novembro 2008

  15. Total de registros visualizados por coleção desde agosto/2007 Herbário JBRJ Herbário INPA SinBiota NYBG_Br RPSP ESA MOBOT_Br

  16. Georeferenciamento original: INPA-Hymenoptera

  17. Georeferenciamento original + automático: INPA-Hymenoptera

  18. INPA - Peixes Novembro 2008

  19. Perfil do acervo

  20. Total do acervo: 28.628 Total on-line: 22.436 Total georeferenciado: 0

  21. Obrigado.... Vanderlei Canhos vcanhos@cria.org.br www.cria.org.br

More Related