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Résistances Bactériennes

Résistances Bactériennes. Naturelles ou Acquises Mécanismes: - Pénétration - Efflux - Modification de la cible - Inactivation Support génétique: - Mutation - Acquisition de gènes exogènes: plasmides, transposons.

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Résistances Bactériennes

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Presentation Transcript

  1. Résistances Bactériennes Naturelles ou Acquises Mécanismes: - Pénétration - Efflux - Modification de la cible - Inactivation Support génétique: - Mutation - Acquisition de gènes exogènes: plasmides, transposons

  2. Résistances naturelles et acquises • Résistance naturelle • Elle fait partie du patrimoine génétique de la bactérie • Elle est systématiquement transmissible à la descendance(verticale) • Toutes les souches isolées sont résistantes • Le support génétique: très souvent le chromosome • Tous les mécanismes biochimiques sont impliqués: perméabilité-expulsion, • enzymes de modification, cibles non affines pour l’antibiotique • Résistance acquise • Concerne une espèce ou un genre bactérien qui , « au départ » était sensible • Ne concerne qu’une partie de l’ensemble des souches que l’on isole • Peut être transmissible horizontalement et verticalement • Mutation chromosomique ou acquisition de matériel génétique exogène • Tous les mécanismes biochimiques sont impliqués

  3. Résistances Bactériennes • Mutations: Spontanées • Rares • Stables • Spécifiques • Indépendantes • Plasmides Transfert Replication R R Chromosome plasmides

  4. Modèles de résistance du pneumocoque aux bêta-lactamines/ fluoroquinolones Pneumocoques et betalactamines - Modifications dans la cible (plps) - Transmission inter-espèces du gène naturel de résistance (S. viridans) - Niveau de R variable selon nb de plps modifiées Pneumocoques et fluoroquinolones - Modification dans la cible: topoisomérases IV(par C) et II (gyr A) - Transfert de résistance de S. viridans au pneumocoque - Niveau de R variable: type de modification nb de cible mutées nb de modifications /cible

  5. Ou se fait la sélection de résistance? 1. Au sein de la population bactérienne du foyer infectieux Les mutants résistants préexistent « en très petite quantité » dans la population majoritaire sensible du foyer infectieux.

  6. Mutation ADN exogène Niveau gène de la bactérie Spontanée Acquisition de la résistance

  7. Facteurs de risque de sélection de mutants résistants dans une population bactérienne. (1) Taux de mutation de l ’antibiotique: 10 -x C ’est le risque de voir apparaître 1 bactérie mutante. Exemple: si le taux est 10 -8, il faut 10 8bactéries dans l ’inoculum pour qu ’il y existe un mutant résistant. Si 109 bactéries, 10 mutants R Si 1010 bactéries, 100 mutants R, etc… Plus le taux est faible, plus le risque est faible 10-10 = risque inférieur à 10-6  Certains antibiotiques font toujours courir ce risque Fluoroquinolones, rifampicine, fosfomycine

  8. Facteurs de risque de sélection de mutants résistants dans une population bactérienne. (2)  Très souvent fonction du COUPLE antibiotique-bactérie C3G - entérobactéries du groupe 3 C3G - P.aeruginosa Fluoroquinolones - S. aureus, P. aeruginosa, S. pneumoniae  Quelques chiffres M. tuberculosis - streptomycine 10-5 isoniaside 10-6 Rifampicine 10-8 E. cloacae - C3G 10-6 P. aeruginosa - beta-lactamines 10-6 imipénème 10-7 ciprofloxacine 10-7 S. aureus - fluoroquinolones10-7 rifampicine 10-8 E. coli - beta-lactamines10-10 ciprofloxacine 10-6

  9. Inoculum bactérien bactéries sensibles - foyer infectieux mutants résistants - in vitro - biotope - autres... CMIs < CMIr [ C ] > CMIs < CMIr [ C ] > CMIs [ C ] < CMIs > CMIr < CMIr Sélection de mutants résistants pour un antibiotique donné Si concentration [ C ] en présence des bactéries : Eradication Mutants résistants

  10. Mutants résistants: facteurs favorisants de la sélection [AB] CMI r [AB] locale Δ CMI CMI s- Bactéries bas niveau R -naturelle: C3G + Entérobacter -acquise: FQ + Gram - Nal R CMI s+ Bactéries très sensibles

  11. Facteurs de risque de sélection de résistants dans une population bactérienne  taux de mutation du couple AB- bactérie Taille de la population bactérienne  Existence d ’un bas niveau de résistance acquise / naturelle - FQ + entérobactérie nal R - FQ + P. aeruginosa - FQ + pneumocoques …….  Différentiel CMIr et CMIs  Niveau des concentrations locales DONC  Problème des doses trop faibles (autre ex: S. aureus et GISA/VISA)  Durée des traitements, surtout sur flore saprophyte

  12. Mutation ADN exogène Niveau gène de la bactérie Spontanée Acquisition de la résistance Niveau bactéries de l ’inoculum Infection PRESSION SELECTION AB Survie des souches R Disparition des souches S Sélection de SOUCHESR

  13. Ou se fait la sélection de résistance? 2-Dans les flores commensales Particulièrement celles qui sont abondantes: tube digestif( 10 11 bact/g); rhino -pharynx ( 10 8 bactéries/ml salive) - Espèces naturellement résistantes: * Enterobacter spp s/s C1G * entérocoques s/s céphalosporines - Espèces sensibles, avec ss-pop R Souches porteuses de plasmides avant traitement * E. coli R aminopénicillines Souches mutantes : ex: échec d ’éradication * S. aureus s/s rifampicine * E.coli et aminopénicillines * enterobactéries et C3G

  14. Mutation ADN exogène Niveau gène de la bactérie Spontanée Acquisition de la résistance Niveau bactéries de l ’inoculum Infection PRESSION SELECTION AB Survie des souches R Disparition des souches S Sélection de SOUCHESR Niveau flores normales survie de - espèces R naturellemt - souches R des espèces sensibles Sélection -Espèces R -Souches R

  15. Niveau de l ’individu Colonisation des écosystèmes Infection Mutation ADN exogène Niveau gène de la bactérie Spontanée Acquisition de la résistance Niveau bactéries de l ’inoculum Infection PRESSION SELECTION AB Survie des souches R Disparition des souches S Sélection de SOUCHESR Niveau flores normales survie de: - espèces R naturellemt - souches R des espèces sensibles Sélection -Espèces R -Souches R

  16. Niveau de la population Transmission inter-individuelle: - hommes - animaux - végétaux diffusion Mutation ADN exogène Niveau gène de la bactérie Spontanée Acquisition de la résistance Niveau bactéries de l ’inoculum Infection PRESSION SELECTION AB Survie des souches R Disparition des souches S Sélection de SOUCHESR Niveau flores normales survie de - espèces R naturellemt - souches R des espèces sensibles Sélection -Espèces R -Souches R Niveau de l ’individu Colonisation des écosystèmes Infection

  17. Mutation ADN exogène Niveau gène de la bactérie Spontanée Acquisition de la résistance Niveau bactéries de l ’inoculum Infection PRESSION SELECTION AB Survie des souches R Disparition des souches S Sélection de SOUCHESR Niveau flores normales survie de - espèces R naturellemt - souches R des espèces sensibles Sélection -Espèces R -Souches R Niveau de l ’individu Colonisation des écosystèmes Infection Niveau de la population Transmission inter-individuelle: - hommes - animaux - végétaux diffusion EMERGENCE R

  18. Dans les faits: • L ’exposition des individus d ’une population est double: • 1- exposition aux antibiotiques, et • 2- exposition aux bactéries déjà résistantes • La première assure •  la SELECTION de la résistance, • le MAINTIEN de la résistance • La seconde assure •  sa DIFFUSION, sa TRANSMISSION • Les deux phénomènes sont indépendants, • mais interagissent l’un avec l’autre. • La pression de sélection par l ’antibiotique est indispensable

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