130 likes | 346 Views
DNA diagnostika. Co se detekuje ?. Monogenní a polygenní dědičné choroby Některé typy nádorů Progrese choroby během léčby Identifikace lidí ve forenzní medicíně HLA-typizace v případě transplantace Prevence - vyšetření: - preimplantační - prenatální - presymtomatické.
E N D
Co se detekuje ? • Monogenní a polygenní dědičné choroby • Některé typy nádorů • Progrese choroby během léčby • Identifikace lidí ve forenzní medicíně • HLA-typizace v případě transplantace • Prevence - vyšetření: - preimplantační - prenatální - presymtomatické
DNA polymorfizmus Variabilita sekvence DNA mezi rozdílnými jedinci téhož druhu • Alelový polymorfizmus fyziologická funkce, s frekvencí > 1% predispozice k polygenním chorobám • Mutace patologická funkce, s frekvencí < 1% příčina monogenních chorob
Zdroje nukleových kyselin DNA určitého genu – všechny jaderné buňky RNA určitého genu - jenom ty buňky, kde se daný gen exprimuje
Princip testování izolace DNA PCR (namnožení části DNA) + další analýzy vizualizace výsledku v gelu
Náplň třítýdenních praktik 1. praktikum: Izolace vlastní DNA 2. praktikum: PCR - namnožení genů CFTR a HFE 3. praktikum: RFLP - restrikční štěpení genu HFE
Nejčastější mutace Cystické fibrózy : • gen CFTR, na 7. chromozomu mutace delta F508 Hemochromatózy : • gen HFE, na 6. chromozomu mutace C282Y
Mutace delta F508 Normální sekvence DNA 5 ´ … AAT ATC ATCTTT GGT GIT … 3´ Protein Asn Ile Ile Phe Gly Val Pozice 505 506 507 508 509 510 Mutovaná DNA DNA 5 ´ … AAT ATC AT - - - T GGT GIT … 3´ ProteinAsn Ile Ile - Gly Val Pozice 505 506 507 508 509 510
Mutace C282Y Normální DNA 5 ´......G / TGC….. 3´ 3´…. C / ACG….. 5´ C – Cys – Cystein (TGC) na pozici 282 v proteinu Mutovaná DNA 5 ´......G / TAC….. 3´ 3´…. C / ATG….. 5´ Y – Tyr – Tyrosin (TAC) na pozici 282 v proteinu
CharakteristikaDNA diagnostiky • Detekce určitého polymorfizmu daného predispozičního genu • CÍLENÉ ANALÝZY • KOMPLETNÍ ANALÝZY
Cílené analýzy • Lokalizace a celá sekvence genu je známá • Mutace genu je známá Vyšetření členů rodiny není nutné
Kompletní analýzy • Lokalizace a celá sekvence genu je známá • Mutace genu jsou neznámé Vyšetření členů rodiny je nezbytné
Detekce polymorfizmu určitého genu Cílené analýzy: • PCR se sekvenčně specifickými primery (CFTR delta F508) • PCR s obecnými primery + 1) RFLP s restrikčními enzymy (Restriction Fragment Length Polymorphism) (HFE C282Y) + 2) hybridizace s DNA próbami • Kompletní analýzy: PCR s obecnými primery DNA sekvenování