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rien ne se perd, rien ne se crée, tout se transforme. Antoine Lavoisier 1743 – 1794 . BIOENERGETICA E ENZIMI. Capitolo 6: Energia, enzimi e metabolismo. H = entalpia : energia totale. G = energia libera di Gibbs: energia utilizzabile per compiere un lavoro
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rien ne se perd, rien ne se crée, tout se transforme. Antoine Lavoisier 1743 – 1794 BIOENERGETICA E ENZIMI Capitolo 6: Energia, enzimi e metabolismo
H = entalpia: energia totale. G = energia libera di Gibbs: energia utilizzabile per compiere un lavoro S = entropia: disordine del sistema H = G + TS Ad una trasformazione chimica è associata una variazione di energia libera (DG) misurabile : DG = DH - TDS In Biochimica, DG’0 indica la variazione in condizioni standard: - 298 °K (25 °C) - 1 atm. - pH=7 - [ ] =1 M
DG < 0 DG > 0
A B Relazione tra DG e equilibrio di una reazione K’eq= [prodotti] / [substrati] K’eq= [B] / [A] DG’0 = - R T lnK’eq R = Costante dei gas = 8, 315 J/(mol * K) T = 298 K
Glucosio 6P Glucosio 1P K’eq= [Glucosio 6P] / [Glucosio 1P] = 19 mM / 1 mM = 19 DG’0 = - R T lnK’eq = - (8,315 J/(mole K)) (298 K) ln 19 = - 7,3 kJ/mole
Adenosintrifosfato (ATP) Moneta energetica della cellula
ENZIMI • Catalizzatori biologici • (quasi) tutti gli enzimi sono proteine • Sono altamente specifici • Permettono lo svolgersi di reazioni in condizioni fisiologiche • Agiscono abbassando l’energia di attivazione
Abbassamento dell’energia di attivazione nella catalisi enzimatica
Meccanismi per l’abbassamento dell’enegia di attivazione Orientamento dei substrati Destabilizzazione del substrato Modificazioni chimiche
Specificità e complesso enzima-substrato S + E → ES → P + E
Effetto della concentrazione del substrato S + E → ES → P + E
Cinetica di Michaelis-Menten KM = Concentrazione di substrato alla quale si ha metà della Vmax
Nomenclatura degli enzimi Nomi degli enzimi sono basati su: - reagenti / prodotti - tipo di reazione - si aggiunge il suffisso “-asi” Esempi: Peptidasi idrolizza i legami peptidici Piruvato decarbossilasi rimuove un gruppo carbossilico dal piruvato
Classificazione ufficiale degli enzimi • Ossidoreduttasi – reazioni redox • Transferasi – trasferimento di gruppi • Idrolasi – reazioni di idrolisi • Liasi – traserimento di gruppi su doppi legami • Isomerasi – reazioni di isomerizzazione • Ligasi – formazione di legami con uso di ATP Ad ogni enzima viene assegnato un numero a 4 cifre dalla Enzyme Commission
Gli enzimi possono utilizzare - cofattori (metalli) - coenzimi (molecole complesse)