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Impact de la diversité génétique sur la transmission des maladies infectieuses dans les troupeaux. Objectif. Etude des caractéristiques d’évolution d’une épidémie en fonction de la diversité génétique: - type d’épidémie - proportion de la population infectée - mortalité dûe à la maladie
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Impact de la diversité génétique sur la transmission des maladies infectieuses dans les troupeaux
Objectif • Etude des caractéristiques d’évolution d’une épidémie en fonction de la diversité génétique: • - type d’épidémie • - proportion de la population infectée • - mortalité dûe à la maladie • - durée de l’épidémie
« Materiel » • Population contenant 1, 2 , 10 ou 100 génotypes • 1 groupe = 1 génotype particulier = une même sensibilité au pathogène. • Population homogène = 1 seul génotype ( >< hétérogène ) • Populations statiques. • Animaux immunologiquement sensibles .
Principe • Simulations par ordinateur: introduction d’un animal malade dans une population saine. • Transmission par contact direct.
Paramètres • Ro: taux de reproduction basal du pathogène = ßN/ • N: taille de la population • ß: paramètre de transmission =nbe attendu de nouvelle infection par individu infecté par individu sensible par jour. • : taux de guérison = 1/période infectieuse
Paramètres • R: taux de reproduction basal du pathogène en fonction du génotype: R<1: pas d’épidémie • I: proportion totale de la population infectée durant l’épidémie: I<10%: épidémie mineure, I>10%: épidémie majeure • m: mortalité
Intérêt de l’étude • Modèle stochastique plus « réaliste » que modèle déterministe, donc meilleure prévision des effets d’une épidémie car prise en compte des variations dues au génotype. • MAIS: étude très théorique, intérêt pratique???
Bibliographie • SPRINGBETH A.J., MACKENZIE K., WOOLLIAMS J.A., BISHOP S.C., The contribution of Genetic Diversity to the Spread of Infectious Diseases in Livestock Populations. 2003.