3ème Colloque International Francophone de Bactériologie Vétérinaire

1. 3ème Colloque International Francophone de Bactériologie Vétérinaire Salmonella et germes indicateurs dans la filière de production et de distribution de viande deporc en Belgique

2. Sommaire • Introduction et contexte • Matériel et méthodes • Résultats • Discussion et conclusions

3. Introduction

4. Objectifs But du projet : • Analyse de risques quantitatifs pour Salmonella dans la filière porcine But du travail présenté: • Déterminer les facteurs de risques de présence de Salmonella dans la filière porcine à partir d’enquêtes et de résultats analytiques de laboratoires

5. Salmonella et la santé publique • Diarrhée, douleurs abdominales, fièvre, vomissements (5% de complications) • Près de 60% des Toxi-Infections Alimentaires (T.I.A.) d’origine bactérienne dans le monde (Pedro & Boris, 2005 • 160.000 cas déclarés par an dans l'UE, parmi lesquelles on estime qu'il y a environ 200 décès • Population sensibles: les vieillards, les enfants, les immunodéprimés, les femmes enceintes (Hohmann, 2001; McCabe-Sellers & Beattie, 2004) • Nombre de salmonelloses humaines rapportées en 2004 par les laboratoires de références en Belgique: n=9543 (Ducoffre, 2005) • Variation saisonnière • Sérotypes fréquents : Typhimurium et Enteritidis (Ducoffre, 2005)

6. Salmonella et la filière porcine • Située au niveau du tube digestif et des ganglions mésentériques et généralement porteurs sains • Activation lors de stress (Korsak, 2005) • Très nombreuses sources de contamination (Korsak, 2005) • Salmonella Typhimurium est le sérotype le plus fréquent en Belgique (CERVA, 2005)

7. Salmonella et la filière porcine • Données d’épidémio-surveillance des agents zoonotiques dans les aliments en Belgique • Entre 2000 et 2003 diminution de la prévalence • En 2004: • 14.6% pour les carcasses (600 cm2) • 6.1% pour les ateliers de découpe (25 g) • 11.1% pour les viandes hachées (25 g) (Ghafir et al., 2005)

8. Les germes indicateurs • Escherichia coli: témoin d’une contamination fécale • Le dénombrement des germes totaux aérobie mésophiles totaux à 30°C reflète l’hygiène générale (Sutra, Federighi, & Jouve, 1998)

9. Matériel et méthodes

10. Sources de données Privé • Abattoirs : 10 plus grands abattoirs de Belgique • Atelier de découpe :10.49 % du total du poids l’ensemble des sociétés de découpe • 4 grands distributeurs: représentent plus de 50% du marché Public • Source de données récoltées au près de l’Agence Fédérale pour la Sécurité de la Chaine alimentaire (AFSCA) de 1997 à 2004 • Plan d’épidémio-surveillance de la production nationale belge • Données collectées de l’abattoir à la distribution

11. La base de données des résultats analytiques Elle reprend des rubriques concernant : • l’origine des données, • la provenance de l’échantillon • les données administratives du laboratoire • les données temporelles • la caractéristique de l’échantillon • la description de la méthode d’analyse au laboratoire • les résultats des analyses microbiologique

12. Description de la base de données • Nombre d’analyses microbiologiques pour Salmonella, Escherichia coli et les germes totaux en fonction de l’origine des données • Nombre d’analyses microbiologiques pour Salmonella, Escherichia coli et les germes totaux en fonction du type de matrice

13. La régression logistique • Soit Y est une variable binaire: présence ou absence de Salmonella • vecteur X de variables : saison Log 10 E. coli Log 10 germes totaux • Test sur la régression: pertinence de la régression et des variables étudiées

14. Résultats

15. Evolution de la prévalence en fonction des saisons (1997-2004) (Source : AFSCA) • Effet de la saison: swabs de carcasses (p = 0.042) • morceaux de découpe (p = 0.034) • viandes hachées (p <0.001)

16. Les carcasses (1997-2004) (Source : AFSCA) IC 95% par la méthode de la binomiale exacte Escherichia coli Germes totaux Log 10/cm2 Log 10/cm2 Total Abattoir 1 Abattoir 2 n=2417 n=107 n=66 Total Abattoir 1 Abattoir 2 n=1089 n=50 n=50

17. Les morceaux de découpe (1997-2004) (Source AFSCA) Escherichia coli Prévalence de Salmonella Log 10/g Total Atelier 1 Atelier 2 n=1904 n=50 n=62

18. Les viandes hachées (1997-2004) (Source AFSCA) Escherichia coli Prévalence de Salmonella Log 10/g Total Atelier 1 Atelier 2 n=2318 n=80 n=76

19. Les régressions logistiques:les carcasses • Test sur la régression: p-value <0,001

20. Les régressions logistiques:les carcasses • Test sur la régression: p-value <0,001

21. Les régressions logistiques:les morceaux de découpe • Test sur la régression: p-value <0,001 • Effet Saison: moyenne du printemps par rapport à la moyenne des 3 autres saisons

22. Les régressions logistiques:La viande hachée • Test sur la régression: p-value <0,001 • Effet Saison: moyenne de l’automne par rapport à la moyenne des 3 autres saisons

23. Discussion et conclusions

24. Problèmes rencontrés dans la création de la base de données • Contrat de confidentialité • Problèmes dans l’uniformisation • Création d’algorithmes spécifiques • Données sous format papier = inutilisables

25. Discussions • Variation de la prévalence au cours des saisons • Variation importante entre les firmes • Relation entre la présence de Salmonella et la concentration d’Escherichia coli: OR=1.3 à 1.5 • Le saisons ont une influence sur les contaminations des morceaux de découpe et de la viande hachée • Les germes totaux ne sont pas un bon indicateur pour Salmonella • Perspectives avec les enquêtes

26. Conclusions • Ces données permettront une modélisation qualitative et quantitative de la filière quant à sa contamination par Salmonella • Ces éléments sont indispensables pour une évaluation quantitative du risque dans la filière porcine afin de préciser les stratégies de prévention les plus efficientes

27. Remerciements Je tiens à remercier : • SPF Santé Publique pour le financement du projet METZOON (n° R-04/003)

28. 3ème Colloque International Francophone de Bactériologie Vétérinaire Salmonella et germes indicateurs dans la filière de production et de distribution de viande deporc en Belgique