80 likes | 186 Views
SEQUENCAGE DES DEUX EXTREMITES DE CHAQUE CLONE. TRANSFERT DES DONNEES DANS LE PROJET. SEQUENCAGE DES GENOMES DE Cenibacterium arsenoxidans (IA) ET Thiomonas spp. (KB). TRAITEMENTS DES SEQUENCES. Comparaison des séquences contre une banque d’ADN ribosomique (RI>80 & RL>100)
E N D
SEQUENCAGE DES DEUX EXTREMITES DE CHAQUE CLONE TRANSFERT DES DONNEES DANS LE PROJET SEQUENCAGE DES GENOMES DE Cenibacterium arsenoxidans (IA) ET Thiomonas spp. (KB)
TRAITEMENTS DES SEQUENCES • Comparaison des séquences contre une banque d’ADN ribosomique (RI>80 & RL>100) • Comparaison des séquences contre une banque d’IS (RI>80 & RL>100) LISTES DE SEQUENCES A ELIMINER DE L’ASSEMBLAGE ASSEMBLAGE SANS CES SEQUENCES RECHERCHE DE SEQUENCES REPETEES PAR NOSFERATU • Constitution d’une banque de séquences répétées de plus de 500pb • Comparaison des séquences contre cette banque de répétés (RI>80 & RL>100) LISTE DE SEQUENCES A ELIMINER DE L’ASSEMBLAGE
ASSEMBLAGE SANS LES SEQUENCES RIBO/IS/REPEATS CONSTRUCTION DE LA MOLECULE SANS LES SEQUENCES RIBO/IS/REPEATS RAPATRIEMENT DES SEQUENCES DE MANIERE CIBLEE
1 5 3 2 4 ASSEMBLAGES INDIVIDUELS DES SEQUENCES RECUPEREES A B 1 5 3 2 4 CONCATENATION DES ASSEMBLAGES 1 6 7