1 / 20

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen AB. Varumärken. Analycens lab. Laboratorier Finland: Tampere Norge: Moss Danmark: Frederica Polen: Warszawa

damon
Download Presentation

Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Nye analyseteknikker (DNA) för kontroll av mikroorganismer Charlotta Engdahl Axelsson Forsknings- och utvecklingschef mikrobiologi Lantmännen Analycen AB

  2. Varumärken

  3. Analycens lab • Laboratorier • Finland: Tampere • Norge: Moss • Danmark: Frederica • Polen: Warszawa • Sverige: Lidköping, Kristianstad, Örebro, Skara, Uppsala

  4. DNA analys -ny teknik • In vitro DNA amplifiering (PCR) 1983

  5. Brett användningsområde (Analycen idag) • Patogena mikroorganismer (näringsmedel, vatten, växter) • Allergena födoämnen • Djurslagsbestämning • GMO

  6. Patogena mikroorganismer • Salmonella • Shigella • Campylobacter • EHEC • Växtpatogena svampar • m.fl.

  7. DNA • Arvsmassa DNA/RNA • DNA baser (nukleotider) • DNA bibliotek

  8. Två syften • A) Detektion av mikroorganismer, arter, gener • B) Individidentifiering, smittspårning

  9. PCR • Uppförökning av DNA • Avgränsas av s.k. primers (måste vara specifika) • Probe som kontroll av specificitet och för detektion

  10. PCR -fördelar • Relevanta egenskaper mäts • Svårodlade mikroorganismer detekteras • Snabbheten • Specificiteten • Objektiv

  11. PCR – att tänka på • Inte alltid kompatibel med traditionell analys • Döda/levande bakterier • Hög detektionsnivå > 1000 bakterier/ml • Provupparbetning

  12. Lagstiftning/standardisering • DNA ok för livsmedelskontroll (gäller validerade metoder enl ISO 16140) • Standarder för EHEC och virus på gång (Norovirus och Heptit A) • Samarbete livsmedel-vatten standardisering • EHEC, Salmonella aktuellt för vatten • EU ref lab för parasiter (Cryptosporidium, Giardia)

  13. En utskrift från DagensNyheters nätupplaga, DN.se. • Publicerad 15 aug 2007 13:53 Smitta på förskola i Sundbyberg Sundbyberg.Ett barn har smittats och ytterligare 12 barn och en ur personalen har visat tecken på att ha smittats av en infektion på en förskola i Sundbyberg. - Vi har konstaterat att ett barn har fått en cryptosporidiuminfektion, som är en parasit, säger Ingegerd Hökeberg, biträdande smittskyddsläkare vid smittskyddsenheten i Stockholms läns landsting

  14. Erfarenheter av Legionella analyser

  15. Protocol Filtration of 1L water Lysis of Bacteria, extraction and DNA purification Real-time PCR detection and/ or quantification Screening : specific sequences detection / controls Quantification : specific sequences detection / Standards 5 h to result Legionella spp L. pneumophila

  16. Erfarenheter PCR och Legionella • PCR bra för detektion • Korrelation med PCR –odling dålig • Gränser baseras på odling

  17. Framtid • Fortsatt utveckling av DNA tekniken • Odling och isolering fortsatt viktigt • DNA standarder för vattenburna patogener

  18. TACK!

More Related