400 likes | 997 Views
Estructura dels a -aminoàcids. Enllaç peptídic. Els aminoàcids es poden unir través de l’enllaç peptídic. La formació de l’enllaç peptídic és una reacció endergònica. Estereoquímica i activitat òptica dels aminoàcids. El carboni a és asimètric o quiral.
E N D
Enllaç peptídic Els aminoàcids es poden unir través de l’enllaç peptídic La formació de l’enllaç peptídic és una reacció endergònica
Estereoquímica i activitat òptica dels aminoàcids El carboni a és asimètric o quiral Enantiomers: són imatges especulars no superposables
Nomenclatura de les molècules quirals Els aminoàcids que es troben a la natura són de la serie L
La nomenclatura D, L no està relacionada amb la rotació òptica
Classificació dels aminoàcids Es fonamenta en la polaritat de les cadenes laterals Apolars, alifàtics Hidrofòbics Aromàtics Polars no carregats Positius Negatius
Apolars, alifàtics G, Gly A, Ala V, Val L, Leu M, Met I, Ile P, Pro
Aromàtics F, Phe Y, Tyr W, Trp
Els aminoàcids aromàtics absorveixen llum UV Espectrefotòmetre Absorbancia = log Io/I = ecl LLei de Lambert Beer
Espectre d’absorció Les proteïnes absorbeixen llum a 280nm degut a la presència d’aminoàcids aromatics
Polars no carregats S, Ser T, Thr C, Cys N, Asn Q, Gln
Positius K, Lys R, Arg H, His
Negatius D, Asp E, Glu
Propietats àcid-base dels aminoàcids Substàncies amfotèriques: es poden comportar com àcids o com a bases
pKaCOOH pKaNH2 + pI = 2 Corba de titració de la glicina Punt isoelèctric Es el pH on l’aminoàcid té càrrega neutra Els aminoàcids tenen capacitat tamponadora a pHs propers als pKa
pKaCOOH pKaCL + pI = 2 pKaCL pKaNH2 + pI = 2 Aminoàcids àcids Aminoàcids bàsics
Reaccions químiques dels aminoàcids Ninhidrina Compost violeta
Reaccions químiques dels aminoàcids Reactiu de Sanger Molècules que reaccionen amb el grup amino
Pèptids i proteïnes Enllaç peptídic
Pèptids i proteïnes Dipèptids Tripèptids Oligopèptids Tetrapèptids Polipèptids i proteïnes S’anomena residus aminoàcids als aminoàcids que estan dins d’una cadena polipeptídica.
Pèptids i proteïnes S’anomena estructura primaria a la seqüència d’aminoàcids d’una proteïna L’estructura primaria determina l’estructura tridimensional de les proteïnes Les proteïnes tenen polaritat estructural
Seqüenciació de proteïnes Cicles de degradació d’Edman
Seqüenciació de les proteïnes Determinar si la proteina té més d’una cadena polipeptídica Separar les diferents cadenes polipeptídiques Trencar els ponts disulfur Determinar la composició d’aminoàcids Trencar la proteïna en fragments i separar-los Seqüenciar cada fragment Repetir 5 i 6 amb fragments diferents
Determinació del número de cadenes polipeptídiques HCl 6 M, 110ºC Hidròlisi Identificació de l’aminoàcid amino terminal
Trencament dels ponts disulfur HS-CH2-CH2-OH b-mercaptoetanol
Composició d’aminoàcids i trencament de les proteïnes Les proteïnes no es poden seqüenciar senceres Mètodes per a trencar proteïnes
Mètodes per a trencar proteïnes Digestió amb la proteasa tripsina Trencament amb bromur de cianogen (CNBr)
Seqüenciació de proteïnes Reacció d’Edman