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Etude de l’héritabilité de la fertilité

Number of Inseminations to Conception in Holstein Cows Using Censored Records and Time-Dependent Covariates. Etude de l’héritabilité de la fertilité. FERRARI Estelle MARTINAUD Séverine MORTEVEILLE Valérie. Gestion des Exploitations Agricoles 2e Doc VT Octobre 2005. PLAN. Introduction

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Etude de l’héritabilité de la fertilité

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Presentation Transcript

  1. Number of Inseminations to Conception in Holstein Cows Using Censored Records and Time-Dependent Covariates. Etude de l’héritabilité de la fertilité FERRARI Estelle MARTINAUD Séverine MORTEVEILLE Valérie Gestion des Exploitations Agricoles 2e Doc VT Octobre 2005

  2. PLAN • Introduction • Présentation des modèles statistiques • Analyse des résultats • Intérêt de l’étude pour le praticien • Bibliographie

  3. INTRODUCTION L’article traite du nombre d’inséminations artificielles nécessaires à la conception. Calcul de l’héritabilité de INS suivant 3 méthodes : • CTM = modèle à seuil censuré • STM = modèle séquentiel à seuil • DPH = Modèle de survie groupé

  4. INTRODUCTION Données collectées sur des VL espagnoles de 1994 à 2004 répondant aux critères suivants : • Au moins 100j de lactation et 1000 kg de lait PV • Intervalle V-V 300 à 600j • Exclusion des vaches ayant eu leur 1er vêlage avant 18 mois ou après 40 mois

  5. INTRODUCTION • 47 509 vaches • 3267 taureaux • 143 927 IA • Maximum 4 IA par vache

  6. 1-MODELE CENSURE A SEUIL (CTM) Seuil = nombre d’inséminations permettant la conception. Le modèle tient compte des données censurées (ex des 50 vaches).

  7. 1-MODELE CENSURE A SEUIL (CTM) Equation de modélisation : ljklmno = x’bjklmno + hm + ssn + uo + ejklmno Effet taureau inséminateur Résiduelle INS Effet systématique Effet troupeau Valeur génétique du père de la vache Effet aléatoire

  8. 1-MODELE CENSURE A SEUIL (CTM) Les données sont modélisées à l’aide de 3 formules : • Données censurées • Données non censurées • Censurées et non censurées Un algorithme met en relation ces 3 formules.

  9. 2-MODELE SEQUENTIEL A SEUIL (STM) Système binaire (gestation = 0 ; échec = 1) comprenant 4 catégories : 1 à 4 IA. Système séquentiel modélisé par une formule mathématique prenant en compte les mêmes variables que dans le modèle censuré.

  10. 2-MODELE SEQUENTIEL A SEUIL (STM) P = M + G + E = M + (A + D + I) + (Ep + Et) 4s2u h2 = (s2u + s2h + s2ss + s2e) h2 calculé de façon similaire pour STM et CTM.

  11. 3-MODELE DE SURVIE GROUPE (DPH) Exprime la probabilité instantanée de conception, pour d’une insémination t et pour une vache donnée.

  12. 3-MODELE DE SURVIE GROUPE (DPH) hklmnopq(t) = 1- exp (-exp (aDFSklmnopq + Lk + Ml + YSm(t) + hn + sso(t) + up +eq)) Certaines variables sont temps dépendants d’autres non. Nombre de lactation (L) Effet du père de la vache (u) Effet du mois de vêlage (M) Effet troupeau (h) Saison d’insémination (YS) Effet de l’inséminateur (ss)

  13. ANALYSE DES RESULTATS

  14. ANALYSE DES RESULTATS Pour comparer les 3 modèles, la base de donnée est scindée en 2 sous-groupes : • A : 396 troupeaux, 38 385 données • B : 371 troupeaux, 41 672 données Par une régression génétique le PTA (mérite génétique du père) est converti en probabilité de conception des filles.

  15. ANALYSE DES RESULTATS Les auteurs ont fait un khi2 des taux de conception ou d’echec attendus et observés. La plus petite valeur de khi2 reflète le modèle le plus précis pour l’estimation de la fertilité des vaches.

  16. ANALYSE DES RESULTATS

  17. ANALYSE DES RESULTATS

  18. ANALYSE DES RESULTATS • DPH : Variance du père de la vache = 0.011 Variance troupeau = 8.135 +/- 0.131 Variance du taureau inséminateur = 49.463 +/- 0.0204

  19. INTERET DE L’ETUDE POUR LE VETERINAIRE PRATICIEN Compte tenu des faibles valeurs d’h2 obtenues pour le facteur étudié (INS), la sélection génétique des vaches sur base de leur fertilité ne présente pas d’intérêt. h2 faible  pas étonnant ! car nombreux facteurs interviennent (semence, femelle,…)

  20. INTERET DE L’ETUDE POUR LE VETERINAIRE PRATICIEN L’amélioration de la fertilité ne se résume pas à la sélection génétique. De nombreux autres paramètres peuvent être améliorés : • Détection des chaleurs • Qualité / Conservation du sperme / Inséminateur • Respect de la période d’attente (cf dia suivante) • Alimentation • Hygiene • Antécédents pathologiques de la vache (RP, métrite, kyste)

  21. Status Multiparous Total Primiparous Cyclic 112 270 382 (64.37 %) (83.08 %) (76.55 %) Anestrus 62 55 117 (35.63 %) (16.92 %) (23.45 %) Total 174 325 499 (34.87 %) (65.13 %) (100.0 %) INTERET DE L’ETUDE POUR LE VETERINAIRE PRATICIEN % de vaches laitières cyclées ou en anoestrus (dosage de progestérone à 51 et 63 jours postpartum) (Thatcher et al. Quebec mai 2002)

  22. BIBLIOGRAPHIE • GONZALES-RECIO O. , CHANG M. , GIANOLA D. , WEIGEL K.A. , Number of Inseminations to Conception in Holstein Cows Using Censored and Time-Dependent Covariates, Journal of Dairy Science, 2005, Vol. 88, No. 10. • THATCHER et al. Québec, Pourcentage de vaches laitières cyclées ou en anoestrus, Mai 2002 • Cours de génétique quantitative 1er Doctorat, J. DETILLEUX • Cours d’Obstétrique grands animaux 1er et 2e Doctorat, Ch. HANZEN • Séminaire paraclinique de gestion des exploitations agricoles 2e Doctorat • http://babcock.cals.wisc.edu/downloads/de_html/ch16.fr.html

  23. Meuhhh..rci de votre attention !!

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