1 / 21

Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja

Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja. Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport http :// ramet.elte.hu/~viktor. Mire megyünk labor nélkül?. = ?. +. Modellezés matematikai modell számítógépes szimuláció Adatelemzés.

kyros
Download Presentation

Vírusok a számítógépben A HIV-járvány eredetének szimulációja

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Vírusok a számítógépbenA HIV-járvány eredetének szimulációja Müller Viktor MTA-ELTE Elméleti Biológiai és Evolúciós Ökológiai Kutatócsoport http://ramet.elte.hu/~viktor

  2. Mire megyünk labor nélkül? = ? + • Modellezés • matematikai modell • számítógépes szimuláció • Adatelemzés

  3. Molekuláktól az emberig • Molekuláris folyamatok • Szervezeten belüli folyamatok • Populációs szintű folyamatok

  4. A HIV eredete(i) • Több független átugrás • 4 sikeres csoport: • HIV-1 M és O csoportja • HIV-2 A és B csoportja • Több sikertelen csoport

  5. Járványos törzsek: szűk időablak • Az összes sikeres HIV-csoport a 20. század első felében ugrott át emberre.

  6. Az időzítés problémája • Előbb miért nem? • „Bushmeat” vadászat: vírusforrás a történelem előtti idők óta • Urbanizáció, megnövekedett mobilitás stb. Forrás: Nature 455, 605.

  7. Az időzítés problémája • Előbb miért nem? • „Bushmeat” vadászat: vírusforrás a történelem előtti idők óta • Urbanizáció, megnövekedett mobilitás stb. • Később miért nem? Forrás: Nature 455, 605.

  8. Hipotézis A HIV-járvány epicentrumai különösen kedvező feltételeket kínáltak a heteroszexuális terjedésnek. • A heteroszexuális terjedést befolyásoló tényezők: • Kapcsolati háló • Akut fertőzés • Körülmetélés • Genitális fekélyt okozó fertőzések - Genital ulcer disease (GUD) • Ugyanezek a tényezők lehettek fontosak a HIV járvány indulásakor.

  9. Szimuláció: a HIV korai terjedése • Milyen tényezők segíthették a HIV-járvány elindulását? • Egyed alapú modell • Szexuális háló • Sztochasztikus folyamatok

  10. Esettanulmány: Kinshasa • A HIV-1 M világjárvány epicentruma • Adatgyűjtés • Tudományos irodalom (orvosi, virológiai, etnográfiai stb.) • Eredeti levéltári kutatás

  11. Esettanulmány: Kinshasa

  12. Szimulációs modell: paraméterek A heteroszexuális terjedést befolyásoló tényezők: • Kapcsolati háló (partnercsere, párhuzamos kapcsolatok) • Genitális fekélyek (GUD) • Akut fertőzés • Körülmetélés • Kezdetben alacsony hatékonyság

  13. Szimulációs modell: szexuális háló • Stabil linkek • Rövid távú linkek • CSW linkek • részletes paraméterek

  14. Szimulációs modell: a HIV terjedése 1. HÉT

  15. Szimulációs modell: a HIV terjedése 2. HÉT

  16. Szimulációs modell: a HIV terjedése 3. HÉT

  17. Eredmények: történeti szcenáriók 1000 futtatás minden szcenárióra • 1919-ben és 1929-benkülönösen kedveztek a feltételek a HIV terjedésének.

  18. Eredmények: mely tényezők voltak fontosak? • A GUD-prevalencia volt messze a legerősebb tényező.

  19. Következtetések • A HIV-járvány elindulásában kulcsszerepe lehetett a gyarmati központokban kialakult GUD-járványoknak. • Az „időablakot” valószínűleg a GUD-járványok visszaszorítására indított kezelési kampányok zárták be a 30-as évek közepén. • A körülmetélés és a populációméret/szerkezet valószínűleg a GUD-gyakoriságon keresztül közvetett hatást fejtett ki. • A nemi fekélyt okozó betegségek kontrollja kulcsfontosságú újabb HIV-törzsek kialakulásának megakadályozásában.

  20. Köszönetnyilvánítás João Dinis de Sousa Anne-Mieke Vandamme Funding: Philippe Lemey

More Related