7 avril 2010

1. CAPITALISATION DES EXPERIENCES SOUS-REGIONALES DE LUTTE CONTRE LE CHOLERA POUR L’ELABORATION D’UN GUIDE PRATIQUE DE PREPARATION ET DE REPONSE AUX EPIDEMIES DAKAR – AVRIL 2010 Mise en œuvre et usages de l’outil de cartographie : intérêts et limites pour la lutte contre le choléral’exemple de la République de Guinée (2009-2010)Implementation and use of cartographytools :Avantages and limits for the fightagainst cholera as used in Guinea (2009-2010) 7 avril 2010 UMR CNRS 6249 Div. Prévention et Lutte contre la Maladie Ministère de la Santé et de l’Hygiène Publique République de Guinée

2. 1.1 Présentation des outils /contexteOverview of tools/context Guinée : façade littorale & Contrastes géographiques Coast and geographic profil & contrasted climats ! en Afrique de l’ouest côtière, Guinée = un « élément cartographique » côtier … Un ensemble complexe affecté par le choléra (Guineaisonly one element in a complexsub-regional cholera epidemiology) Guinée Bissau WORLD HEALTH ORGANIZATION Global Task Force on Cholera Control [CHOLERA COUNTRY PROFILE (2010)]

3. 1.2 Présentation des outils /contexteGeneral presentation of tools/context Pays / Régions (n=5) / Préfectures (n=38) / Sous-préfectures (n > 300) En zone urbaine : Quartiers / secteurs (urban settings : quarters, sectors) Nécessité d’analyse à des échelles complémentaires (temps et espace) A clearneed of complementarystudieswithdifferentscales of time and space Préfectures (n=38)

4. Répartition de la maladie Découpage préfectoral Geographic pattern of cholera (prefectoral scale) Taux d’incidence cumulée pour 10 000 hab.

5. Répartition de la maladie Découpage préfectoral Geographic pattern of cholera (prefectoral scale) Profondeur temporelle suffisante pour dégager les caractéristiques épidémiologiques. We need a longer temporal period in order to obtain a better understanding of cholera epidemiological characteristics • Les principaux problèmes : • (Main difficulties) • Archivage • (records) • Accessibilité des données « papier » • (availability of registersunderpaper format) • Sous-notification/complétude interne • (Under notification and internal • quality of recorded data) Taux d’incidence cumulée pour 10 000 hab.

6. Un exemple de changement d’échelle : Focus sous-préfectoral Pref. de Boke et Boffa Geographic pattern of cholera (sub-prefectoral scale) Boke and Boffa 2005 2007 N 2006 2008 60 km Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab. pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa. 2008 Figure 10 : Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab. pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa.

7. Un exemple de changement d’échelle : Focus sous-préfectoral Pref. de Boke et Boffa Geographic pattern of cholera (sub-prefectoral scale) Boke and Boffa 2007 2005 N Orientations opérationnelles (Fieldwork support) Aide à la définition de zone d’intervention (a support to define intervention zones) Implantation d’un système « sentinelle» (set up « sentinelle » system) 2006 2008 60 km Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab. pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa. 2008 Figure 10 : Taux d’incidence cumulée annuelle pour 10 000 hab. pour les sous-préfectures des préfectures littorales de Boké et Boffa.

8. 2. Quels usages ? Quelles précisions ? Quelles informations à visées opérationnelles ? Versant recherche / Versant opérationnel Epidémiologie MACRO (approche globale: écologie marine, climat, … ) Epidemiology MACRO (Integrated and global approach, climat …) / Aide à la décision programme trans-nationaux (Support / orientation of international programs) Trans-national National Epidémiologie : étude de la diffusion et cartes thématiques (Epidemiology : spread of outbreak, thematic maps) / Plan de contingence régionaux (contengency plan) Régional/préfectoral Epidémiologie MESO : facteurs environnementaux (Epidemiology MESO : environmentalfactors) (météorologie, biologie marine, prélvmts environnementaux, microbiologie, …) / Pré-positionnement , recherche des populations à risque, « site sentinelle » sur la zone littorale (Riskfactors, target populations for prevention, early warning system : e.g. costal points) Sous-préfectoral Epidémiologie MICRO en zone urbaine : dynamique de distribution des cas, étude des facteurs de risques, recherche de cluster (Epidemiology MICRO : urban settings , dynamic of outbreak, riskfactors, cluster identification) / Prévention, orientation des activités de riposte (sensibilisation, CTC, stocks, ….)(position of treatment center, register, follow-up, prevention …) Zone urbaine Quartier

9. Taux d’incidence du choléra 2007 à Conakry (Guinée) Analyses préliminaires (preliminary analyses) Projet de préparation aux épidémies de choléra. Conakry, Guinée. UMR CNRS 6249 Div. Prévention et Lutte contre la Maladie Ministère de la Santé et de l’Hygiène Publique République de Guinée

10. Recherche de cluster /modélisation S 23 S 29 Enquête terrain Ménages (households)/ Quartiers /cartographie thématique S 35 • Complémentarité • (Variousstrategies of anayses) • Choix raisonné des sites d’interventions • Scientific-basedchoices • Synthesisbased on published littérature and results • (Conakry : Vibriocholerae O1, poissons + (Boiro, 2005)) • Orientations opérationnelles • (work orientation: harbour, coastal areas) • Lieux spécifiques pour la préparation et la prévention • Débarcadères/Ports • Zones de bras de mer et maraîchages • … Modélisation du risque à partir des caractéristiques des unités spatiales

11. 3. Quelles méthodologies pour la confection de cartes ? Quels outils ? • I/Recueil des fonds de carte (SIG layer for map ) • Sous format papier • Mutualiser les compétences nationales en Guinée (Observatoire National de la Guinée) (to combine national competences /experiences) • II/ Recueil des données de santé (record of health data) • Partenariat avec les autorités sanitaires (Partnership with MoH) • III/ Etude des facteurs de risques (risk factor analyses) • Synergie avec les ONG : Enquêtes sur le typologie des quartiers à Conakry par Action Contre La Faim (partnership with non gouvernemental org.) • Données environnementales ( pluviométrie, réseau hydrographique, réseau d’adduction eau …) (environmental data, precipitation, hydrographic network) • Etude cas-témoin ciblée sur le début des épidemies à Conakry

12. 4. Quelles contraintes pour la faisabilité ? • Profondeur temporelle : comprendre l’épidémiologie et valider la modélisation • Logiciel national pour la cartographie thématique déjà existant mais sous-utilisé (need to supervise Ministery of Health agents in critical administrative positions) • Healthmapper (WHO) : besoin d’accompagnement individuel à des postes-clé • Mutualiser les compétences nationales (ONRG) • Cartographie analytique : ? coût des logiciels payants SIG (Mapinfo et Arc GIS), mais des alternatives gratuites existent comme (cost of software but free alternatives exist) • QGIS (logiciel libre gratuit en Français) ou R pour les analyses • Satscan (recherche de cluster) • Favoriser la formation pour le développement des capacités au long terme Conakry (pluviométrie/cas)

13. 5. Recommandations 1/ Déterminer les quartiers à risque à Conakry (DPLM, ACF et UNICEF) 2/ Mutualiser les moyens et les compétences (combine competences and supports) 3/ Etudier de l’hypothèse d’un réservoir environnemental /saisonnalité • Institut National de Santé Publique, Centre halieutique de Boussoura, Institut Pasteur de Kindia, DPLM, …. 4/ Favoriser l’utilisation de la cartographie au sein du système sanitaire => amélioration de la surveillance épidémiologique • Réaction plus précoce : seuil dans une zone géographique prédéfinie (par exemple Conakry) (to shortendelay of reaction : define a threshold in a geographic zone) 5/ Cartographie/séries temporelles combinée pour les pays au regard du plateau continental guinéen (Guinée-Bissau/Guinée/Sierra Leone et Liberia) => étude de la diffusion des épidémies

15. Merci pour votre attention