170 likes | 278 Views
Arjen Doelman MAS, CWI & UvA. De Bio- (&Geo-) Diversiteit van het CWI. OPZET: Centraal staan een twaalftal voorbeelden van bestaande aan de aard- en levenswetenschappen gerelateerde onderzoeksprojecten op het CWI. Een `one man poster session’
E N D
Arjen Doelman MAS, CWI & UvA De Bio- (&Geo-) Diversiteit van het CWI
OPZET: • Centraal staan een twaalftal voorbeelden van bestaande aan de aard- en levenswetenschappen gerelateerde onderzoeksprojecten op het CWI. • Een `one man poster session’ • Andersoortige activiteiten: • Aard Leven • Plannen en `synergie’ • Opmerking: • Naamgeving `posters’ gebaseerd op groepsleiders – een versimpeling, zij representeren tevens aio’s en andere co-auteurs. • Het genoemde CWI-onderzoek is bijna zonder uitzondering uitgevoerd in samenwerking met aard- en/of levenswetenschappers.
Harry Buhrman/Peter Grunwald/Paul Vitanyi (INS4): Clustering & Similarity Analysis SARS is een Corona virus Andere toepassingen: evolutiaire bomen, tekstanalyse Een SARS virus
Leen Stougie (PNA1): Combinatorische optimalisatie computationele biologie `phylogenetic networks’ evolutionaire netwerk voor gistsoorten evolutionaire boom
. . . Eric Pauwels (PNA4): Extractie en matching van patronen `ambient intelligence’/ visuele plaatsbepalingen & walvissen, dolfijnen, zeeschilpadden, bomen, ... Foto Dezelfde walvis in de data base
Robert van Liere (INS3): Visualisatie & 3D oppervlakken Kwantitatief meten aan biologische objecten foto Informatie over de groei/geschiedenis van het koraal skelet
Jason Frank (MAS1): Statistisch accurate (klimaat)simulaties Simulatie KNMI (140 jaar)
Daan Crommelin (MAS1): Deduceren van modellen uit data Andere toepassingen: klimaatsdynamica, moleculaire dynamica, ... Andere toepassingen: klimaatsdynamica, moleculaire dynamica, ... Temperatuur oceaan oktober 2005 Voorspellingen
Jan van Schuppen (MAS2): `System reduction’ , metabolische/proteine/genetische networks gist input ) output glycolyse netwerk
Antonios Zagaris (MAS1): Dynamische model reductie Laag dimensionaal gedrag in grote systemen biochemische netwerken Een sterk vereenvoudigde verbrandingsreactie
Ute Ebert (MAS3): Multiscale analyse Gasontladingen Toepassingen in de techniek Sprites (50km) Laboratorium (4cm)
Joke Blom (MAS1): modelleren & simuleren biochemische processen `Hybride’ systemen: Tussen continu (concentraties) en volledig discreet (moleculaire dynamica) Schalen: continu discreet cel
Ben Sommeijer (MAS1): Phytoplankton dynamica Simulaties, hydrodynamica en ecologie Modelleren planktonconcentraties in het Nieuwe Meer (Amsterdam ZO) Blauwalgen in het Ijsselmeer
Arjen Doelman (MAS1): `Pattern Formation’ Verwoestijning Vegetatiepatronen als indicatie voor verwoestijning Niger, Afrika; schaal: tientallen meters
ANDERSOORTIGE ACTIVITEITEN: • Het NISB = Netherlands Institute for Systems Biology • Samenwerking tussen: • & • 17 december `kennismakingsdag’ op de werkvloer. • Er loopt een wervingsactie voor twee bio-informatici en/of bio-mathematici op tenure track niveau. • De `bio-bonus’.
AARD LEVEN • Wiskunde heeft langere traditie/is meer geïntegreerd in AARDwetenschappen • AARDwetenschappen `continue’ wiskunde MAS • LEVENswetenschappen zijn nog op zoek naar `fundamentele wetten’ • Wiskunde/Informatica? LEVENswetenschappen INS, MAS, PNA • LEVENswetenschappen:Triviale W & I? Of juist veel te moeilijk??
PLANNEN & SYNERGIE • Gecombineerde aanstellingen, detacheringen, gasten, ... • Frank Bruggeman (CWI & VU: NISB) – MAS3 • Huib de Swart (IMAU, Institute for Marine and Atmospheric research Utrecht:NDNS) – MAS1 • ... • DIVERSITEIT & SYNERGIE: • Duidelijk aanwezig binnen de Aardwetenschappen (MAS) • Binnen de Levenswetenschappen? • AARD & LEVEN(phytoplankton, verwoestijning, ...) • Een gecombineerde krachtsinspanning? • Klimaat? `Genetics’? Kankeronderzoek? Medisch-technisch? ...