El Genoma en el Ganado de Carne

1. El Genoma en el Ganado de Carne Dr. Carlos Ignacio Ortiz Espinosa Departamento Técnico 2009

2. Historia • La vaca doméstica (Bostaurus) contiene unos 22.000 genes diferentes, 80% de los cuales son idénticos a los genes humanos • permitir la posibilidad de llevar la producción de leche y carne a una mejor calidad • puede significar una mejor comprensión de la salud bovina y lo que es mas importante aun, del propio genoma humano!

3. Historia • Tras que pasaran seis años de su vida trabajando; el grupo de 300 investigadores de 25 países lograron descifrar completamente la secuencia • El “Proyecto de Secuencia del Genoma Bovino” fue realizado con vacas Hereford, originarias de Gran Bretaña, • Se descubrió que la organización de los cromosomas en humanos está mucho más cercana al modelo vacuno que del de los roedores utilizados en laboratorios para estudiar tratamientos factibles a las enfermedades humanas.

4. Instituciones y Organismos • USDA 35 MILL DE DÓLARES • Baylor College of Medicine, Houston, Texas • InstitutoNacional de Salud, Dr. RaynardKington • Instituto de Genética Humana en la Universidad de München, Alemania. • Universidad de Washington, Departamento de Ciencia Animal y Escuela de Cienciasbiológicas.

5. El Cromosoma 14 • El cromosoma 14 (BTA14) ha sido explorado para distintos locis de rasgos cuantificables (QTL) y genes de importancia económica tanto en ganado de leche como de carne. • En la Universidad de Washington, más de 40 ivestigadores encontraron cerca de 126 QTL para el genoma del ganado de carne. La mayoria encontrados de la región 15 a la 45 del cromosoma. • Rasgos de importancia económica:

6. El Cromosoma 14 • Rasgos de importancia económica: • Ganancia diaria promedio pre-destete (PrWADG) • Ganancia diaria promedio post-destete (PoWADG) • Peso al nacimiento (BW) • Peso de la canal (CW) • Espesor de grasa dorsal (BFT) • Marmoleo (BMS) • Promedio de peso corporal (ABW) • Calidad de canal (EQT) • Tasa de crecimiento (GR) • Area del Ribeye (REA)

7. Estructurapoblacional K=2 K=3 K=4 • Cada individuo es representado por una barra vertical, dividido entre segmentos de colores con la longitud de cada segmento representando la proporción del genoma individual de 2,3 o 9 poblaciones ancestrales. Las razas son separadas por líneas negras. • Razas: NDA, N´Dama; SHK, Sheko; NEL, Nelore; BRM, Brahman; GIR, Gir; SGT, Santa Gertrudis; BMA, Beefmaster; ANG, Angus; RGU, Red Angus; HFD, Hereford; NRC, Norwegian Red; HOL, Holstein; LMS, Limousin; CHL, Charolais; BSW, Brown Swiss; JER, Jersey; • GNS, Guernsey; PMT, Piedmont,RMG, Romagnola. Lada sin costo 018002287272 servicio@reproduccionanimal.com.mx

8. Mapagenomico Bostaurus Razas intermedias Bosindicus • Componentes principales de todos los SNPs. Las razas Bostaurus permanecen • separadas de las razas Bosindicus, y las razas intermedias. Lada sin costo 018002287272 servicio@reproduccionanimal.com.mx

9. Regionesgenomicasasociadas a diferentesrasgos • Eficienciaalimenticia ZRANB3, R3HDM1 • Segmentaciónmesodermo en mamíferos WIF1 • Proteoglícanos, desarrollo del CNS SPOCK1 • Autismoidiopaticohumano NBEA • Activador del sistema del complemento NMT1, DCAKD, C1QL1 • Inmunodeficienciaseveracombinada NLGN3 al DGAT2L6 • Protecciónextracelularantioxidante PPARGC1A, DHX15 • Motor molecular multisubunitario DNAH9 • Expresado en tejidoolfatorio ZNF187 • Candidatossusceptibles al autismohumano AUTS2 • Muertecardiacainducidoporestrés y ejercicio RYR2 Lada sin costo 018002287272 servicio@reproduccionanimal.com.mx

10. SmartGenepara Carne • Es un proyectoqueproporcionainformaciónpara la evaluacióngenética en la industria de carne en Australia, proporcionanuevos EBVs e incrementa la confiabilidad de algunosvalores de cruzamiento. • La TERNEZAes la característicamásdeseadapor los consumidores. • Hay efectossignificativos T1 y T2 pararazasinglesas • T1, T2 y T3pararazasadaptadas al trópico. • Éstosmarcadores le permiten al ganaderoidentificaranimalesque son geneticamentepredispuestos a producir carne másblanda.

11. SmartGenepara Carne • Fase 1. Genotipificaciónutilizando 12,000 muestras de DNA • Todos los animales se prueban para 12 pruebas DNA GeneStar: 4 Ternesa, • 4 en Marmoleo y 4 en Eficiencia alimenticia. • Fase 2. Estimación de los parámetros para calcular el EBV, en base a los • resultados de las pruebas de DNA y medidas de rendimiento (ternesa, grasa • intramuscular o índice de masa corporal, marmoleo y eficiencia alimenticia en • animales con un pedigrí completo. • Así entonces tenemos marcadores: T1 – T4, M1 – M4 y FE1 – FE4. • Fase 3. Desarrollo de un Software para calcular los Valores de cruzamiento • (EBVs).

12. SmartGene • El proyecto de SmartGene para Carne se basa en el registro de datos por 2 proyectos de CRC Beef: • BEEF CRCI: Contempla 7 razas puras y 4 razas templadas (Angus, Hereford, Murray Grey y Shorthorn) 3,229 animales y 3 razas adaptadas al trópico (Brahman, Santa Gertrudis y Belmont Red) 3,615 animales. • BEEF CRCII: Contempla razas adaptadas al trópico, Brahman Puro (2,039 animales) y otras tropicales (2,400 animales) • Y por 2 campos de base de datos de Asociaciones de Raza: • Prueba de Progenie Angus: Australianos (415 individuos) • Prueba de Progenie Durham: Prueba de progenie Shorthorn (347 individuos)

13. GeneSTAR DNAResultados de prueba • Como resultado de 0, 1 o 2 estrellascorrespondientes a 0, 1 o 2 copias (alelos) de la forma favorable de cada gen o marcador. • En el caso de la Terneza • El número de estrellascorresponde a lasmedidasregistradas de “la fuerza de corte” del longissimusdorsi” . Entre másbajo sea el valor de la fuerza de corte, mayor grado de terneza (másestrellas). • En el caso del Marmoleo • Los registrosestánbasados en animalesalimentadoscon granoporarriba de 180 días. • Entre másestrellas, la grasa intramuscular es mayor en el bistek.

14. GeneStar

15. EficienciaAlimenticia • El incremento en el número de estrellas corresponde a individuos con alta eficiencia alimentica, óptimo consumo diario de alimento y excelente conversión alimenticia.

16. Glosario de términostécnicos • Marcardor de DNA: Una secuencia única de DNA genéticamente asociada con un rasgo en particular y utilizada para identificar un individuo o célula portadora del marcador. • Genotipo: Genética propia de un animal (en base a 1 o varias series de marcadores genéticos o por todos sus genes) • Fenotipo: Rendimiento medible. Lo observable o propiedades medibles de un animal. La combinación de efectos genéticos y medio ambientales sobre el rendimiento. • Alelo:Una forma específica de un gen o marcador genético • Gen: La secuencia funcional de DNA que codifica para una proteína específica.

17. Gracias !!  “ Estar preparado es importante, saber esperarlo es aún más, pero aprovechar el momento adecuado es la clave de la vida.” Arthur Schnitzler Lada sin costo 018002287272 servicio@reproduccionanimal.com.mx