1 / 17

Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde NFKBIA Gen Polimorfizminin Rolünün Araştırılması

Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde NFKBIA Gen Polimorfizminin Rolünün Araştırılması. Farangiz Ghodrati 1 , Gökhan Özkan 2 , Engin Aynacı 3 , Yasemin Müşteri Oltulu 2 , Ender Coşkunpınar 2 , Pınar Yıldız 3 , İlhan Yaylım 2

miyo
Download Presentation

Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde NFKBIA Gen Polimorfizminin Rolünün Araştırılması

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanserinde NFKBIA Gen Polimorfizminin Rolünün Araştırılması Farangiz Ghodrati1, Gökhan Özkan2, Engin Aynacı3, Yasemin Müşteri Oltulu2, Ender Coşkunpınar2, Pınar Yıldız3, İlhan Yaylım2 1Fatih Üniversitesi, Genetik ve Biyomühendislik Bölümü, İstanbul2İstanbul Üniversitesi DETAE Moleküler Tıp AD, İstanbul3Yedikule Göğüs Hastalıkları ve Göğüs Cerrahisi EAH, İstanbul

  2. Giriş ve Amaç Akciğer kanseri tüm dünyada kansere bağlı ölümler arasında ilk sırada gelmekte ve dünya genelinde her yıl yaklaşık 1,4 milyon kişinin ölümüne neden olmaktadır. Hastaların sadece % 15’inde yaşam süresi 5 yıl Hastalığın genetik, moleküler ve biyolojik özelliklerinin ortaya konması, uzun süreli sağkalımı belirleyebilecek ve hedefe yönelik tedavi imkanı sağlayabilecek yeni prognostik faktörler bulunması gerekmektedir.

  3. Akciğer Kanseri - Giriş • Tüm kanser olgularının % 23’lük kısmını oluşturan akciğer kanseri tüm kanser ölümlerinin de % 19,4’unden sorumludur.

  4. NFκBIA genindeki 3'UTR varyasyonunun IκB proteininin fonksiyonunda veya yapısında bir eksiklik oluşturduğu düşünülmektedir. • Bu nedenle günümüzde NF-κB aktivitesini bloke eden yeni ilaçların geliştirilmesi, birçok laboratuar ve ilaç şirketinin ana hedefi haline gelmiştir.

  5. NF-κB – IκB Kompleksi • IκB proteini NF-κB molekülündeki NLS dizisini maskeleyerek çekirdeğe girmesini engeller. • IκB proteinlerinin yıkılması ise serin-spesifik IĸB kinaz (IKK) yolağı ile olur.

  6. NFκBIA İnsan NFκBIA (IκBα) geni 3,5 kb uzunluğunda, 6ekzon içermekte 14q13 kromozom bölgesinde lokalize bulunmaktadır.

  7. NFκBIA (IκBα), NF-κB transkripsyon faktörünün inhibitörüdür. • Bu protein NFκB transkripsiyon faktörüne bağlanarak onun nucleousa taşınmasını ve DNA’ya bağlanmasını bloke etmektedir.

  8. NFκBIA 3 kısımdan oluşur; • N terminal domain, • 30-33 aminoasitlik kopyalardan (6 kopya) oluşan ankirin tekrar domaini v • prolin-glutamat-serin-treonin amino asitlerince zengin C-terminal (PEST) bölgelerinden oluşur. • Hücrelere gelen tüm sinyaller, serin-spesifik IκB kinaz enziminin NFκBIA’nın N-terminal ucundaki iki spesifik serin bölgesini (S32 ve S36) fosforile etmesine yol açar. Böylece NFκBIA yıkılımı gerçekleşerek NF-κB aktive edilir.

  9. NFκBIA genindeki 3'UTR varyasyonunun IκB proteininin fonksiyonunda veya yapısında bir eksiklik oluşturduğu düşünülmektedir. • NFκB’nin inhibitörü olan NFκBIA proteinin disfonksiyonu NFκB aktivasyonunu arttırır bunun sonucu olarak da NFκB’nin karsinogenezde etkin olduğu düşünülmektedir. • Bu çalışmada KHDAK hastalarında NFκBIA 3’UTR A→G polimorfizmi incelendi. Song S, PLoS One. 2011;6(6):e21726.

  10. Materyal - Metod

  11. NFκBIA -3’ UTR A→G polimorfizmi PCR ürünleri 20 µl final hacimde HaeIII restriksiyon enzimi ile kesildi.Enzim kesimi için 0,5 µl enzim kullanıldı. 37ºC’de 1 gece inkübe edildi. HaeIII enzimi NFκBIA geni fragmanının HaeIII restriksiyon enzimi ile kesilmesi sonucu elde edilen bant profillerinin agaroz jel elektroforezi (%3) sonrası görünümü 1. kuyucuk, Marker; 2. ve 4. kuyucuklar, NF-ĸBIA mutant homozigot GG genotipi; 3. kuyucuk, yabanıl tip homozigot AA genotipi; 5. ve 6. kuyucuklar, heterozigot AG genotipi NFκBIA -3’ UTR A→G gen bölgesiPCR'ı final volümde 25 µl olacak şekilde ve primerlerin herbiri 10 pmol, 10 mmol dNTP, 2.5 U Taq DNA polimeraz (fermentas), içinde 10 mmol/l Tris-HCL (pH:8.3) 50mmol/l KCL ve 1.5 mmol/l MgCl2 olan buffer kullanılarak hazırlandı.

  12. BULGULAR • Genotip ve allel dağılımları bakımından hasta ve kontrol grubu sonuçları

  13. Sonuç ve Tartışma • NFκB’nin inhibitörü olan proteinin disfonksiyonu NFκB aktivasyonunu artırır bunun sonucu olarak da NFκB’nin karsinogenezde etkin olduğu düşünülmektedir. • Literatürde NFκBIA 3’UTR A→G polimorfizmlerinin incelendiği birçok çalışma bulunmaktadır.

  14. Sonuç ve Tartışma • Çalışmamız sonucunda NFκBIA 3’ UTR A→G Genotip ve allel dağılımları bakımından hasta ve kontrol grupları arasında istatistiksel anlamlı bir fark olmadığı tespit edidi. • Bu çalışma Türk popülasyonunda KHDAK hastalarında NFκBIA 3'UTR A→G polimorfizminin incelendiği ilkçalışmadır.

  15. TEŞEKKÜRLER Gökhan Özkan, MSc Engin Aynacı, MD Yasemin Müşteri Oltulu, PhD Pınar Yıldız, MD Ender Coşkunpınar, PhD İlhan Y. Eraltan, PhD

More Related