Antibiorésistance chez les animaux, usages vétérinaires des antibiotiques et santé publique

1. Antibiorésistance chez les animaux, usages vétérinaires des antibiotiques et santé publique A. Bousquet-Mélou a.bousquet-melou@envt.fr

2. L’antibiothérapie vétérinaire est fortement interpellée sur le volet de la santé publique

3. Mortalité attribuée à la résistance aux antibiotiquesDonnées UE Europe More than 25 000 deaths per year More than 1.5 billion Euros

4. Mortalité attribuée à la résistance aux antibiotiquesDonnées UE Nombre estimatif de décès par sida chez l’adulte et l’enfant en 2008 Europe orientale & Asie centrale 87 000 Europe occidentale et centrale13 000 Amérique du Nord 25 000 Asie de l’Est 59 000 Moyen-Orient & Afrique du Nord 20 000 Caraïbes 12 000 Asie du Sud & du Sud-Est 270 000 Afrique subsaharienne 1,4 million Amérique latine 77 000 Océanie 2 000 Europe More than 25 000 deaths per year More than 1.5 billion Euros

5. Les plans de lutte contre l’antibiorésistance Novembre 2011 Union Européenne et France • Réduire de 25% en 5 ans la consommation d’antibiotiques en élevage

6. Toute utilisation d’antibiotiques exerce une pression de sélection Médecine vétérinaire Médecine humaine de ville Hôpital Agriculture Environnement

7. Les 4 principaux dangers pour l’homme liés à l’usage des antibiotiques en médecine vétérinaire • Perte de sensibilité ou résistance des pathogèneszoonotiques passant de l’animal à l’homme (contact direct ou chaîne alimentaire) • Sélection de déterminants génétiques de résistances dans les flores commensales des animaux et transfert à l’homme via la chaîne alimentaire ou l’environnement • Rejet d’antibiotiques actifs dans l’environnement avec toutes ses conséquences • Résidus d’antibiotiques dans les aliments

8. Les dangers de santé publique liés aux pathogènes zoonotiques et aux gènes de résistance • Transmission de pathogèneszoonotiques devenus résistantsaux AB • Salmonella • Campylobacter • E. coli • SARM • Transmission de matériel génétique support de résistance et capable d’être transféré à la flore commensale digestive humaine • Enterococci (entérocoques) • autres Enterobacteriaciae (entérobactéries)

9. Les écosystèmes de bactéries commensales impactés par l’antibiothérapie vétérinaire • Systèmes ouverts et large réservoir • Tube digestif • Peau • Système ouvert et faible réservoir • Arbre respiratoire, naso-pharynx • Système fermé et faible réservoir • La mamelle

10. Antibiotiques chez les animaux : quels risques pour l’Homme ? Danger pour l’Homme : pathogène humain + résistance aux antibiotiques Pathogènes animaux Zoonotiques Flore commensale Efficacité des traitements vétérinaires Efficacité homme Problème écologique global Risque de colonisation définitive Surconsommation d'antibiotiques Eradication naturelle Enjeux individuels Enjeux collectifs

11. Antibiotiques chez les animaux : quels risques pour l’Homme ? Danger pour l’Homme : pathogène humain + résistance aux antibiotiques Cas 1 : FLUOROQUINOLONES - Mécanismes de résistance chromosomiques - Transmission verticale - Problème si les bactéries résistantes sélectionnées chez l’animal sont PATHOGENES pour l’Homme : Salmonella, Campylobacter, E. coli pathogènes

12. Antibiotiques chez les animaux: quels risques pour l’Homme ? Danger pour l’Homme : pathogène humain + résistance aux antibiotiques Cas 1 : FLUOROQUINOLONES • Cas 2 : CEPHALOSPORINES • - Mécanismes de résistance plasmidiques • - Transmission verticale et horizontale • Problème pour TOUTES les bactéries résistantes sélectionnées chez l’animal, qui servent de véhicules aux gènes de résistance FLORE INTESTINALE SECURITE SANITAIRE DES ALIMENTS

13. Antibiotiques en élevage : les flores bactériennes critiques Pathogènes zoonotiques résistants (salmonelles, Campylobacter) Flore commensale (gènes de résistance) 5 5 Infection alimentaire Réservoir de gènes de résistance Chaîne alimentaire Environnement Antibiotique voie parentérale HOMME SANTE PUBLIQUE Antibiotique voie orale Tube digestif X ? Sang Pathogène d'intérêt vétérinaire SANTE ANIMALE

14. Usage vétérinaire des antibiotiques

15. 19 9 180 1.2 15 La diversité des espèces:les espèces de rente (millions) en France

16. 9+10 1 50 La diversité des espèces:les espèces de sport et de compagnie (millions) en France

17. Utilisation des antibiotiques chez l’animal Source : ANMV

18. Utilisation des antibiotiques chez l’animal

19. Utilisation des antibiotiques chez l’animal

20. Les élevages industriels imposent une médecine collective (porc, volaille, veau…)

21. Feedlots, USA

22. Implications de l’usage des antibiotiques chez les animaux • •Santé de l’animal • • Economie des productions animales • conflit d’intérêts pour le consommateur / malade potentiel • Santé Publique

23. Production d’animaux sains pour fournir des denrées animales ou d’origine animale saines, abondantes et bon marché Alimentation Santé

24. Passage direct de l’animal à l’homme Les voies de transmission entre les animaux et l’Homme Passage indirect de l’animal à l’homme

25. Passage direct de l’animal à l’homme :risque non professionnel immunodéprimé

26. Les animaux de compagnie

27. Les animaux de compagnie Le cas de Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline

28. sondage BVA auprès d'un échantillon de 1 009 personnes et publié dans le numéro de février 2002 du mensuel Trente Millions d'amis • Près de la moitié (45 %) des propriétaires de chats dorment avec leur animal.

29. Passage direct de l’animal à l’homme :risque professionnel

30. Staphylococcus aureus Resistant à la Méticilline

31. Portage de SARM : un risque professionnel pour les vétérinaires SARM portés par 27/417 (6.5%) participants à un congrès vétérinaire international : 23/345 (7.0%) vétérinaires,4/34 (12.0%) techniciens, et 0/38 autres.

32. Portage de SARM : un risque professionnel pour les vétérinaires In: Clin Microbiol Infect. 2008;14 (1):29-34. SARM portés par 34/272 (12.5%) participants à un congrès international sur la filière porcine au Danemark 31/34 isolats de type ST398, d’origine porcine

33. Passage direct de l’animal à l’homme Les voies de transmission entre les animaux et l’Homme Passage indirect de l’animal à l’homme

34. Passage indirect de l’animal à l’homme via l’alimentation Oui mais gérable Bactéries zoonotiques Chaîne alimentaire Gène de résistance (flore commensale) Oui difficile à gérer Environnement

35. Emergence et diffusion internationale d’un clone multi-résistant de Salmonella Kentucky – Résistance à la ciprofloxacine Top 8 sérovars Salmonella % souches résistantes (données 2008 ou 2009) CIPRO C3G Typhimurium : 3867 isolats Enteritidis : 1777 isolats Hadar : 177 isolats Typhi : 170 isolats Derby : 160 isolats Newport : 139 isolats Infantilis : 134 isolats Kentucky : 130 isolats 0 0 0 0 0 0 0 84.7 2 0 0 0 11.3 0.7 0 1.5 « Le serotype Kentucky est un sérotype émergent, associé à des souches acquises en Afrique et hautement résistantes aux fluoroquinolones »

36. Emergence et diffusion internationale d’un clone multi-résistant de Salmonella Kentucky – Résistance à la ciprofloxacine Voyageurs français de retour d’Afrique du Nord Données du CNR Salmonella Institut Pasteur, Paris (F.X. Weill)

37. Diffusion internationale du clone multi-résistant Salmonella Kentucky ST198 International Spread of an Epidemic Population of Salmonella enterica Serotype Kentucky ST198 Resistant to Ciprofloxacin Le Hello S, Hendriksen RS, Doublet B, Fisher I, Nielsen EM, Whichard JM, Bouchrif B, Fashae K, Granier SA, Jourdan-Da Silva N, Cloeckaert A, Threlfall EJ, Angulo FJ, Aarestrup FM, Wain J, Weill FX. J Infect Dis. 2011 Sep 1;204(5):675-84. Epub 2011 Aug 2.

38. Origine géographique du clone Salmonella Kentucky ST198

39. Liens possibles entre l’émergence du clone Salmonella Kentucky ST198 et utilisation des antibiotiques dans les élevages Plusieurs étapes: Multi-résistance: Acquisition/sélection SGI1-K1, aquaculture intensive et usage antibiotiques? Résistance aux FQ: Usages inappropriés de fluoroquinolones dans les élevages avicoles en Afrique du nord ?

40. “These are typically small-scale operations, which rely on chicken litter and manure from farm animals to fertilize aquaculture ponds.”

41. Acquisition ultérieure de plasmides conférant la résistance aux C3G et échecs thérapeutiques • Un cas rapporté en 2007 en Belgique: • Salmonellose chez un patient de retour de voyage en Afrique du Nord • S. kentucky CIPRO-RES : traitement C3G • Acquisition d’une résistance plasmidique en cours de traitement • Mécanismes de résistance identifiés: • Multi-résistance: SGI1-K1, mutations gènes cibles (FQ) • Résistance C3G: CTX-M-1 , gène blaCTX-M-1 localisé sur un plasmide conjugatif Collard et al. 2007. Travel-acquired salmonellosis due to Salmonella Kentucky resistant to ciprofloxacin, ceftriaxone and co-trimoxazole and associated with treatment failure. J. Antimicrob. Chemother. 60:190-192.

42. Les échanges internationaux comme facteur de risque pour l’antibiorésistance • Diffusion de S Kentucky

43. Les échanges internationaux comme facteur de risque pour l’antibiorésistance • Diffusion de S Kentucky • Colonisation « silencieuse » de nos flores digestives par des entérobactéries commensales porteuses de gènes de résistance mobiles Les voyages internationaux constituent un facteur de risque majeur pour la colonisation digestive par Escherichia coli producteur de BLSE « coli-postaux »

44. Bilan • Importation en Europe et en France d’une combinaison de dangers: • Pathogènes zoonotiques résistants : réseau de surveillance, absence de transmission inter-humaine • Colonisations digestives par supports génétiques de résistances = les « coli-postaux » : silencieux, transmissions inter-humaines • Risques pour nos élevages: • Transmission aux élevages des souches résistantes • Dissémination sous pression de sélection des antibiotiques • Enjeux pour nos élevages: réduire très significativement la pression de sélection exercée par l’usage vétérinaire des antibiotiques, en ciblant la pression sur les flores digestives

45. La plupart des résistances en médecine humaine ne sont pas liées aux usages vétérinaires des antibiotiques Danger : diffusion des résistances portées sur des éléments génétiques mobiles Danger : combinaison entre mauvaises pratiques d’élevage et échanges internationaux (des personnes et des denrées) Conclusion