1 / 12

A molekuláris szabályozási hálózatok matematikai modellezése

Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék. A molekuláris szabályozási hálózatok matematikai modellezése. Kapuy Orsolya. Témavezető: Dr. Novák Béla. 2007. február 7. transzláció. riboszóma. Pr. fehérje. TF A. DNS.

ferris
Download Presentation

A molekuláris szabályozási hálózatok matematikai modellezése

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék A molekuláris szabályozási hálózatok matematikai modellezése Kapuy Orsolya Témavezető: Dr. Novák Béla 2007. február 7.

  2. transzláció riboszóma Pr fehérje TFA DNS transzkripció mRNS protein kináz protein foszfatáz Pr P

  3. Cdk idő (perc) sejtosztódás DNS replikáció Cdk sejtmagosztódás

  4. Jensen, L.J., Jensen, T.S., de Lichtenberg, U., Brunak, S. and Bork P. Co-evolution of transcriptional and post-translational cell-cycle regulation.Nature 443: 594-597 (2006) hasadó élesztő lúdfű sarjadzó élesztő ember mind a négy organizmusban több száz periódikusan átírt gén található, amelyek transzkripciós faktorok által szabályozottak

  5. a periódikus ÉS Cdk által foszforilezhető fehérjék ~90%-ának illetve ~100%-ának a transzkripciós faktorai IS Cdk szubsztrátok periódikusan átírt gének periódikusan átírt gének Cdk szubsztrátok Cdk szubsztrátok 189 185 411 1063 315 1313 6 43 16 1502 600 1248 500 Jensen, L.J., Jensen, T.S., de Lichtenberg, U., Brunak, S. and Bork P. Co-evolution of transcriptional and post-translational cell-cycle regulation.Nature 443: 594-597 (2006) • Vajon a transzkripciós faktorok Cdk szubsztrátok-e? • Melyek az ismert transzkripciós faktorúperiódikusan átírt gének? hasadó élesztő sarjadzó élesztő 140 169 49 16 a fehérjék közvetlen és közvetett úton is Cdk szabályozottak

  6. TF TF + + Cdk Cdk + + - + Pr Pr TF TF - - Cdk Cdk + + - + Pr Pr Feed-forward loop TF ± + Cdk ± Pr ?

  7. TF TF - + Cdk Cdk + + + - Pr Pr szintézis degradáció Pr Pr Cdk Cdk

  8. TF TF TF TF - + - + Cdk Cdk Cdk Cdk + + + + - + + - Pr Pr Pr Pr szintézis degradáció Pr Pr Cdk Cdk

  9. Feed-forward loop + időkésleltetés TF ± transzkripció transzláció + Cdk ± Pr

  10. TF TF + + Cdk Cdk + + - + Pr Pr TF TF - - Cdk Cdk + + - + Pr Pr Cdk idő (perc)

  11. Összefoglalás Megvizsgáltuk, hogy a Cdk szubsztrátok közvetlen és közvetett úton is szabályozva vannak, és ez a hálózat egy ún. feed-forward loop-nak felel meg. A négy lehetséges feed-forward loop hálózatot matematikai egyenletekkel jellemeztük. Ez a négy feed-forward loop elegendő ahhoz, hogy a sejtciklus minden szakaszában legyen aktiválódásra képes fehérjecsoportja Az így kialakult rendszer megmagyarázza, hogyan tudja a Cdk a sejtciklus összes lépését szabályozni.

  12. Szeretném megköszönni a segítséget: a témavezetőmnek, a kutatócsoport minden tagjának! Köszönöm a figyelmet!

More Related