1 / 24

VALUNDOV EFEKAT, F- STATISTIKA

VALUNDOV EFEKAT, F- STATISTIKA. DEMA (engl. deme ) , lokalna populacija, ili subpopulacija je izolovana ili delimično izolovana grupa jedinki iste vrste koje se međusobno ukrštaju na način blizak panmiksiji.

minna
Download Presentation

VALUNDOV EFEKAT, F- STATISTIKA

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. VALUNDOV EFEKAT, F- STATISTIKA

  2. DEMA (engl. deme), lokalna populacija, ili subpopulacija je izolovana ili delimično izolovana grupa jedinki iste vrste koje se međusobno ukrštaju na način blizak panmiksiji. • POPULACIJA u prirodi najčešće predstavlja struktuiran entitet koji se sastoji od manjih ili većih grupacija jedinki (dema). • METAPOPULACIJA je struktuirana populacija koja se sastoji od određenog broja dema.

  3. Rodentia 200 jedinkiDobijen odnos genotipova:AA Aa aa89 82 29Očekivan odnos genotipova:AA Aa aa84 92 24Utvrđeno je prisustvo dve populacije:AA Aa aapopulacija 1: 64 32 14populacija 2: 25 5025

  4. Efekat prostorne izolovanosti dema (populacija) na genetičku strukturu čitave metapopulacije (vrste) se označava kao Valundov efekat(Wahlund effect). • Opisuje geografsku varijabilnost metapopulacije ili vrste. • Wahlund S., 1928. godine

  5. S lokalnih populacija (H-W) A a AA Aa aa pi qi pi2 2pi qi qi2 p=1/S∑pi Vp=1/S∑(pi-p)2= 1/S∑pi2 - p2 P= 1/S∑pi2= 1/S∑pi2 - p2+ p2=p2+ Vp Q= 1/S∑qi2= 1/S∑(1-pi)2........ =q2+ Vp H = 1/S∑2qipi=2 {1/S∑ pi ( 1-pi )} H = 2 {1/S∑ pi- 1/S∑pi2 } H = 2 {1/S∑ pi- 1/S∑pi2 +p2 -p2 } H = 2 { p - p2 - Vp } = 2 { p (1-p) - Vp} H =2 pq- 2Vp = 2pq (1- Vp/pq)

  6. ZAKLJUČCI • Usled prostorne izolovanosti lokalnih populacija smanjuje se heterozigotnost na nivou čitave populacije ili vrste. • Što su veće genetičke razlike između populacija ili dema (veća varijansa), veće je i smanjenje heterozigotnosti na nivou čitave populacije ili vrste.

  7. RAJTOVA F - STATISTIKASewall Wright (1931/32)

  8. RAJTOVA F STATISTIKA • Opisuje hijerarhijsku organizaciju genetičke varijabilnosti. • Genetička hijerarhija: - Jedinka (I) – unutar deme - Dema ili populacija (S) - Metapopulacija ili vrsta (T)

  9. Koncept • Jedinke koje se ukrštaju su i prostorno bliske. • Te jedinke su i genetički sličnije. • Genetičke posledice lokalnog ukrštanja liče na inbriding efekat (asortativno ukrštanje) unutar velike populacije: • smanjenje heterozigotnosti, identičnost po poreklu (IBD). • povećanje razlika između dema.

  10. FIS FST FIT Fi Fi Fi Fi

  11. Dva načina procene • Preko koeficijenta inbridinga (F – indeks fiksacije) na različitim nivoima (I, S, T) • Preko promene nivoa heterozigotnosti na različitim nivoima (I, S, T)

  12. IBD koncept • Fi – F unutar svake deme • FIS – verovatnoća da su 2 alela u I poreklom od istog pretka u S; prosečno odstupanje od H-W unutar S dema FIS=∑(Ni/N) FI

  13. IBD koncept • FST – verovatnoća da 2 slučajna alela u S su IBD; veća vrednost ukazuje na veću genetičku diferenciranost metapopulacije FST= Vp / pq stepen smanjenja heterozigotnosti usled genetičkih razlika između dema u odnosu na očekivanu heterozigotnost kada nema struktuiranosti

  14. IBD koncept • FIT – prosečna verovatnoća IBD jedinke (I) u metapopulaciji (T) FIT= FIS+(1-FIS) FST

  15. Koncept heterozigotnosti • FIS – prosečno odstupanje H unutar S od očekivane H • gde su: • prosečna očekivana H unutar svake S • = ΣNi/N·Hexpi • prosečna dobijena H unutar S • = Σ Ni/N·Hdobi

  16. Koncept heterozigotnosti • FST – stepen genetičke diferenciranosti dema, tj. stepen smanjenja heterozigotnosti usled genetičkih razlika između dema u odnosu na očekivanu heterozigotnost kada nema struktuiranosti gde je očekivana H na osnovu prosečnih učestalosti alela u T; = 2 p q

  17. Koncept heterozigotnosti • FIT – mera varijabilnosti i struktuiranosti čitave metapopulacije; predstavlja kombinaciju unutar- i među- demnog efekta

  18. Koristi seprilikom proučavanja izoenzimske varijabilnosti prirodnih populacija različitih vrsta. • Kalezić, 1982 Triturus vulgaris vulgaris 14 gena/ 15 populacija FIS = 0.026 FST = 0.096 FIT = 0.117 • (ssp. dalmaticus, graecus, meridionalis) FIS = 0.021 FST = 0.217

  19. Yanomamo Fst=0,073 Xavante Fst=0,0091

  20. Fst (0.05, 0.15)

  21. Rat kangaroo Fst = 0,676

  22. Puž iz roda Rumina Fst = 0,538 Između blokova iste ulice

  23. Zadatak 1 AA Aa aa Pop1 125 250 125 Pop2 50 30 20 Pop3 100 500 400 Izračunati parametre Rajtove statistike (koncept heterozigotnosti).

  24. Zadatak 2 • AA Aa aa Ni • Pop1 0,85 0,1 0,05 80 • Pop2 0,153 0,294 0,553 50 Izračunati parametre Rajtove statistike (IBD koncept)

More Related