Impact de la FCO sur la mortalité des bovins

1. Impact de la FCO sur la mortalité des bovins Réunion d'information et d'échanges sur la restitution des résultats de la recherche opérationnelle FCO en France 18 mars 2010, Afssa JB Perrin, P Hendrikx, C Ducrot, D Calavas

2. Contexte • Mortalité bien décrite chez les ovins, divergences à propos de l’espèce bovine • Études quantitatives rares (Institut de l’élevage) • Limites des approches classiques • Identification des foyers (clinique peu spécifique, qualité des tests diagnostiques, réticence liée aux conséquences socio-économiques) • Identification des mortalités dues à la FCO • Utilisation d’une approche alternative pour évaluer l’impact de la FCO sur la mortalité bovine

3. Données et méthodes

4. Adaptation d’une méthode employée par l’Inserm pour estimer les surmortalités dues à la canicule Basée sur un historique de données: BDNI Modélisationpar département de l’évolution temporelle des effectifs de mortalité (sem-1. âge-1) à partir d’une période de référence (2001-2006)  Prédiction des effectifs de mortalité attendusen 2007 Comparaison des effectifs de mortalité attendus (E) aux effectifs de mortalité réellement observés (O) Excès relatif : (O-E)/E Ratio de mortalité : O/E

5. Intercept + tendance Fonctions sinusoïdales : saisonnalité Effet de l’âge Interactions saison/ âge Modèle de prédiction t : semaine i : catégorie d’âge Xi: variable âge (1 ou 0) P = 52 (période) α,β,γ,η : paramètres du modèle

6. Ajustement du modèle (exemple de la Meuse)

7. Résultats (1) : Excès de mortalité par département

8. Ratios de mortalité mensuels, par département en 2007

9. Excès relatifs de mortalité et nombre de foyers déclarés par département, 2007 Ratios de mortalité Nb de foyers déclarés 1500 1000 500 200 50 10 1

10. Excès relatifs de mortalité et nombre de foyers déclarés par département, 2008 Ratios de mortalité Nb de foyers déclarés 1500 1000 500 200 50 10 1

11. Résultats (2) : Excès de mortalité à l’échelle nationale

12. Nombre de mortalités observées et attendues chez les bovins français, par semestre (2007-2008)

13. Résultats (3) : Excès de mortalité dans la Meuse

14. Prédictions établies par le modèle dans la Meuse 14

15. Déclaration de foyers FCO et excès de mortalité chez les veaux de moins de 7 jours (Meuse)

16. Risques de mortalité observés, attendus et risques de mortalité attribuables à la FCO 8 Veaux <7 j : 1,20% Vaches 5-10a :1,20% Vaches >10a : 1,27% Bovins de 2m à 2 a : 0.27 - 0.32% Calculés respectivement à partir des mortalités observées, attendues, et en excès

17. Discussion

18. Discussion • Validité des prédictions • ajustement du modèle, premier semestre 2007 • Veaux de moins de 7 jours : • sur-déclarations des mortalités ? • contexte épizootique, compensations financières etc. • conséquence infection au cours de la gestation? • Attribution des mortalités • Autres causes de surmortalité? Qualité des fourrages, élévation des quotas, limitations de mouvement • Cohérence surmortalités / épizootie de FCO ? • Cohérence spatiale, cohérence temporelle • Décalage pics de mortalité et déclaration de foyers • Effets à long terme?

19. Conclusion • 50 000 surmortalités (+10%) au second semestre 2007 150 000 surmortalités (+13%) en 2008 • Risque de mortalité augmenté chez les veaux (R=1,2%) et chez les bovins âgés (R=1,27%), stable chez les jeunes bovins • Mortalités directement ou indirectement attribuables à la FCO • Complémentarité des approches • Intérêt pour l’évaluation de l’impact d’une épizootie, rapide et peu onéreuse, sans nécessité de tests diagnostics • Limite : attributabilité des excès de mortalité

20. Merci de votre attention • Étude faite dans le cadre de l’Observatoire de la Mortalité des animaux de rente (OMAR) • Thèse FCPR, en codirection AFSSA (D. Calavas) et INRA (C. Ducrot) + encadrement P. Hendrikx (AFSSA) • Remerciements Jean-Luc Vinard, Eric Morignat (AFSSA-Lyon) André Gauffier, Pascal Deriu (DGAl)