1 / 10

Poszttranszlációs módosítások Készítette: Cseh Márton

Poszttranszlációs módosítások Készítette: Cseh Márton. ~2001: megfejtették a humán genom szekvenciáját a genom ismerete → a fehérjék ismerete? NEM fehérjekutatás, leírás is rengeteget fejlődött: XRD fehérjekrisztallográfia, NMR módszerek. ”új tudományág?”.

karah
Download Presentation

Poszttranszlációs módosítások Készítette: Cseh Márton

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Poszttranszlációs módosítások Készítette: Cseh Márton

  2. ~2001: megfejtették a humán genom szekvenciáját • a genom ismerete → a fehérjék ismerete? NEM • fehérjekutatás, leírás is rengeteget fejlődött: XRD fehérjekrisztallográfia, NMR módszerek ”új tudományág?”

  3. Ez a proteomika (=funkconális genomika)‏ • Genom → genomika • Proteom → proteomika Proteom: egy szervezet, egy sejt, egy organellum vagy egy vírus összes proteinje, a szervezet teljes fehérjeállománya. (Létezik HUPO is (Human Proteome Organization), nem csak HUGO!)‏ Proteomika: röviden a proteom mennyiségi és minőségi analízise

  4. A proteomika a fehérjék kutatásával komplex módon foglalkozó tudományterület, amely meg kívánja ismerni a fehérjék szerkezetét, biológiai funckióját és ezek térbeli és időbeli változását. A proteomika nemcsak úgy tekinti a fehérjét, mint izolált molekulát, hanem figyelembe veszi a fehérje és környezete közötti kölcsönhatást. Ugyancsak a proteomika vizsgálódási körébe tartozik a fehérje eredetének meghatározása, rendszertani besorolása, a különböző forrásból származó, de azonos biológiai funkciót ellátó proteinek szerkezetének összehasonlítása, a fehérje jelenlétének vagy hiányának igazolása egészséges, illetve patológiás körülmények között.

  5. A munkafolyamat: -Eredetmeghatározás: bizonyítani, hogy a fehérje szerkezete és funkciója az adott sejt, szövet, szervezet sajátja, vagyis a genom által kódolt. - Expresszió - Izolálás - Aminosavsorrend-meghatározás, szerkezetmeghatározás (XRD, NMR)‏ -Annotáció (sz. ig.): alegységszerkezet, poszttranszlációs módosítások, térszerkezet, lokalizáció, funkció, rokonság

  6. Vissza a humán genomhoz: kb. 30000 gén kódol fehérjét ➝ kb 100 féle poszttranszlációs kémiai módosítás lehetséges ➝ milliós nagyságrendű különböző protein lehet jelen a szervezetben • A gének 5%-a kódol poszttranszlációs módosítást végző enzimeket • Szinte minden fehérje szenved PTM-t (hormon- és hormonreceptor fehérjék, fehérjepolimerek (kollagén, tubulin), vírusfehérjék stb)‏

  7. Milyen módosításokról is van szó? • Acilezés (általában acetilezés, az N-terminális végen)‏ • Alkilezés (általában Lys és Arg metilezése (hisztonfehérjéknél pl), demetilezés)‏ • Amidkötés (C-terminális végen, v. keresztkötés Asn/Gln és Lys közt)‏ • Formilezés • Karboxilezés • Glu kapcsolás • Glikozilezés (Asn, hidroxy-Lys, Ser, Thr aminosavakon)‏

  8. Glicin kapcsolódás (tubulin C-terminális végen)‏ • Hidroxilezés • Jódozás (pajmirigyhormonok)‏ • Foszforsav, zsírsavészterek képzése szabad -OH csoporttal • Nukletidok kapcsolódása (pl, ADP-ribóz)‏ • Oxidáció • Szulfát kapcsolódás • Diszulfid hidak létrehozása • Ubikvitinezés

  9. proteolízis: a fehérje egy része lehasadPl a szignálszekvencia, a transzportért felelős régió vagy a biológiai hatás kifejtését gátló aminosavrészek (Met). Inzulin esetében diszulfid hidak létrejötte után Cys-eket összekötő szakaszok eltávolítása. • A PTM-ok lehetnek reverzibilisek/irreverzibilisek(enzim aktiválás/inaktiválás)‏

  10. A PTM-ok helye általában dER • PTM-ok szerepe- Védelem (glikozilezés) proteázok ellen- Membránba ágyazódás lehetővé tétele- megjelölés- Ki/bekapcsolás

More Related