170 likes | 347 Views
UMC Utrecht consists of the University Hospital Utrecht the Medical Faculty Utrecht the Wilhelmina Children’s Hospital. Voortgang in de DNA diagnostiek. T.G.W. Letteboer, Klinisch Geneticus Afdeling Medische Genetica, UMC U 9 november 2013. DNA diagnostiek HHT1, HHT2, HHT-JP, en toen….
E N D
UMC Utrecht consists of the University Hospital Utrechtthe Medical Faculty Utrechtthe Wilhelmina Children’s Hospital
Voortgang in de DNA diagnostiek T.G.W. Letteboer, Klinisch Geneticus Afdeling Medische Genetica, UMC U 9 november 2013 Afdeling Medische Genetica
DNA diagnostiek • HHT1, HHT2, HHT-JP, en toen…. • Nieuwe technieken voor bekende families zonder mutatie • Conclusie
celkern chromosoom cel DNA-basen dubbele helix DNA, chromosomen en genen
HHT3 HHT4 HHT1 HHT2 JP-HHT
HHT2 - chromosoom 12 - gen: ACVRL1 (ALK1) vaker HAVM HHT1 - chromosoom 9 - gen: ENG vaker PAVM, CAVM HHT1 en HHT2 verschillende genen
HHT-JP en HHT? Weer andere genen HHT-JP - chromosoom 18 - gen: SMAD4 HHT? - chromosoom 5 of 7 of ? - gen: onbekend
En de families zondermutatie?? • 10-15% van de families hebben geen mutatie in ENG, ACVRL1 (ALK1) of SMAD4 • Mogelijke verklaringen zijn: • andere genen veroorzaken HHT • onze technieken pikken niet alle mutaties op (in ENG, ACVRL1 en SMAD4)
Vooruitgang in technieken G A T C GTTGCTTGTTTATCACCTGT 1990 2.500 per 3 dagen 2000 25.000 per ochtend 2010 50.000.000 per uur 1ste 2de 3de
Op weg naar het individuele genoom bron: Science, 17 maart 2006 2000: $300.000.000 (?) 2007: $1.000.000 2009: $10.000
BMP9 mutatie veroorzaakt HHT beeld • Ontdekt in 3 personen met HHT • Teleangiectasien en bloedneuzen • (AVMs niet goed onderzocht, wrs 1 HAVMs) • Maar: • Ontdekt in 3 van de 197 onderzochte personen
Onbekende families worden onderzocht op BMP9 • Mogelijk dat andere landen (Nederland) BMP9 vaker voor komt dan in Canada • Zo veel mogelijk familie’s zonder mutatie onderzoeken op mutaties in BMP9
Mutaties in niet-coderendgebied poly A- signaal splice site 5'cap gt ag AATAAA 5’ UTR Intron Intron 3’ UTR Promoter
Zijn onze technieken niet toereikend?? • Mogelijk niet…. • In samenwerking met Hubrecht laboratorium bij aantal families kijken of er met andere techniek mutaties worden gevonden in de bekende genen
We zijn hard bezig de families in kaart te brengen, zonder gen afwijking voor de HHT